225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0871 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0871  LamB/YcsF family protein  100 
 
 		 244 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.557987  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0761  LamB/YcsF family protein  99.18 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0774  LamB/YcsF family protein  98.36 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.846244 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0822  LamB/YcsF family protein  97.95 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0506032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0837  LamB/YcsF family protein  98.36 
 
 		 244 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000610355 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00673  hypothetical protein  81.97 
 
 		 244 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2942  LamB/YcsF family protein  81.97 
 
 		 244 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00662  hypothetical protein  81.97 
 
 		 244 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0630  LamB/YcsF family protein  81.15 
 
 		 244 aa  414  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0761  LamB/YcsF family protein  81.56 
 
 		 244 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0738  LamB/YcsF family protein  81.56 
 
 		 244 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0728  LamB/YcsF family protein  81.97 
 
 		 244 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.190889  normal  0.45791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0803  LamB/YcsF family protein  81.56 
 
 		 244 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.179932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1216  LamB/YcsF family protein  82.64 
 
 		 245 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.653039  normal  0.072436 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2923  LamB/YcsF family protein  81.15 
 
 		 244 aa  410  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.140615  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1257  LamB/YcsF family protein  72.13 
 
 		 245 aa  354  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.187621  normal  0.809316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1117  LamB/YcsF family protein  73.36 
 
 		 245 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000433292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3591  LamB/YcsF family protein  73.36 
 
 		 245 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1169  LamB/YcsF family protein  73.36 
 
 		 245 aa  352  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000136688  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1138  LamB/YcsF family protein  67.62 
 
 		 245 aa  330  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1228  LamB/YcsF family protein  67.21 
 
 		 245 aa  328  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0089  LamB/YcsF family protein  63.11 
 
 		 246 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0380957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3309  LamB/YcsF family protein  61.98 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.716241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2978  LamB/YcsF family protein  61.98 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.8067  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2113  LamB/YcsF family protein  61.98 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0264  LamB/YcsF family protein  61.98 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0974794  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3370  LamB/YcsF family protein  61.98 
 
 		 254 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2920  LamB/YcsF family protein  69.26 
 
 		 245 aa  313  9.999999999999999e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0447  LamB/YcsF family protein  61.98 
 
 		 262 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0251  LamB/YcsF family protein  61.98 
 
 		 254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4365  LamB/YcsF family protein  63.11 
 
 		 246 aa  312  3.9999999999999997e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2169  LamB/YcsF family protein  63.64 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.514078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0228  LamB/YcsF family protein  61.57 
 
 		 254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3058  LamB/YcsF family protein  61.48 
 
 		 254 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0249954 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2425  LamB/YcsF family protein  61.48 
 
 		 274 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16977  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3039  LamB/YcsF family protein  61.48 
 
 		 274 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1972  LamB/YcsF family protein  61.57 
 
 		 256 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2950  LamB/YcsF family protein  61.07 
 
 		 254 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.815554 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3084  LamB/YcsF family protein  61.07 
 
 		 254 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3034  LamB/YcsF family protein  61.07 
 
 		 254 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.689834 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2905  LamB/YcsF family protein  60.74 
 
 		 250 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.493812 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0193  LamB/YcsF family protein  60.33 
 
 		 250 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3108  LamB/YcsF family protein  65.57 
 
 		 245 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316999  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2372  LamB/YcsF family protein  61.16 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.839401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3743  LamB/YcsF family protein  60.33 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.819674  normal  0.479135 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6386  LamB/YcsF family protein  60.25 
 
 		 254 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.631285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0064  LamB/YcsF family protein  59.43 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1948  LamB/YcsF family protein  55.87 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000410312  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0027  LamB/YcsF family protein  52.48 
 
 		 247 aa  262  4e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.529091  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2338  LamB/YcsF family protein  57.49 
 
 		 256 aa  261  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3118  LamB/YcsF family protein  52.42 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000358938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2847  LamB/YcsF family protein  51.61 
 
 		 253 aa  254  6e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2808  LamB/YcsF family protein  52.03 
 
 		 253 aa  254  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3100  LamB/YcsF family protein  51.61 
 
 		 253 aa  251  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3119  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2880  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.178795  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3095  LamB/YcsF family protein  51.21 
 
 		 253 aa  250  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2060  LamB/YcsF family protein  51 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.284201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2150  LamB/YcsF family protein  52.02 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0708  LamB/YcsF family protein  50.2 
 
 		 258 aa  249  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00425486  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2872  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 254 aa  248  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3086  LamB/YcsF family protein  50.4 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.621895  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2827  LamB/YcsF family protein  53.5 
 
 		 245 aa  238  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  hitchhiker  0.00875882 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01950  uncharacterized lactam utilization protein B-like protein  51.41 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.581711 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2226  LamB/YcsF family protein  49.16 
 
 		 254 aa  236  2e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2074  LamB/YcsF family protein  49.39 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal  0.628028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0006  LamB/YcsF family protein  49.58 
 
 		 242 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154728 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0173  LamB/YcsF family protein  49.8 
 
 		 254 aa  228  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0476  LamB/YcsF family protein  53.63 
 
 		 260 aa  227  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.26266  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0374  LamB/YcsF family protein  50.81 
 
 		 274 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1098  LamB/YcsF family protein  43.8 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.248626  normal  0.159804 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1696  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1662  LamB/YcsF family protein  44.13 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1269  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0021  hypothetical protein  46.98 
 
 		 241 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312119 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1168  LamB/YcsF family protein  43.72 
 
 		 252 aa  211  5.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.810933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0008  LamB/YcsF family protein  47.6 
 
 		 246 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119793 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0010  LamB/YcsF family protein  47.14 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1712  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 255 aa  209  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  decreased coverage  0.00394761  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1526  LamB/YcsF family protein  41.77 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1899  LamB/YcsF family protein  41.37 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2788  LamB/YcsF family protein  50.85 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2043  LamB/YcsF family protein  46.15 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.815905 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0986  lactam utilization protein B related protein  45.15 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3099  LamB/YcsF family protein  46.34 
 
 		 256 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3454  LamB/YcsF family protein  45.75 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5728  LamB/YcsF family protein  43.32 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536045  normal  0.717107 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5851  LamB/YcsF family protein  43.27 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00357056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4134  LamB/YcsF family protein  45.93 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.607272 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0519  LamB/YcsF family protein  48.35 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6351  LamB/YcsF family protein  45.16 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1828  LamB/YcsF family protein  47.79 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.365387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3294  LamB/YcsF family protein  44.49 
 
 		 255 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5378  LamB/YcsF family protein  42.98 
 
 		 256 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1143  LamB/YcsF family protein  41.7 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.395519  normal  0.256013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2042  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4381  LamB/YcsF family protein  44.67 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284094  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2956  LamB/YcsF family protein  45.97 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1103  LamB/YcsF family protein  45.23 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0380368  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1594  LamB/YcsF family protein  42.68 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>