More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0860 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  100 
 
 
225 aa  453  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  100 
 
 
225 aa  453  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0824  DNA-binding transcriptional activator KdpE  99.56 
 
 
225 aa  452  1e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0770111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0810  DNA-binding transcriptional activator KdpE  99.11 
 
 
225 aa  448  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0763  DNA-binding transcriptional activator KdpE  98.67 
 
 
225 aa  446  1e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  92.89 
 
 
225 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  92.86 
 
 
225 aa  427  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  92.41 
 
 
225 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  92.41 
 
 
225 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  92.41 
 
 
225 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  91.96 
 
 
225 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  92.41 
 
 
225 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  92.41 
 
 
225 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  91.52 
 
 
225 aa  422  1e-117  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  83.93 
 
 
225 aa  384  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1126  DNA-binding transcriptional activator KdpE  80.8 
 
 
226 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.296902  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2931  DNA-binding transcriptional activator KdpE  79.46 
 
 
229 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  77.68 
 
 
229 aa  361  6e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  77.13 
 
 
226 aa  357  7e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  74.16 
 
 
209 aa  331  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.03864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  74.16 
 
 
209 aa  331  5e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  74.16 
 
 
209 aa  331  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  63.96 
 
 
231 aa  302  2e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  64.13 
 
 
232 aa  301  4e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  64.04 
 
 
235 aa  301  7e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  63.39 
 
 
232 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  63.39 
 
 
234 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  63.39 
 
 
234 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  63.39 
 
 
234 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  63.39 
 
 
234 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  63.39 
 
 
232 aa  296  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  63.39 
 
 
234 aa  296  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  63.96 
 
 
231 aa  295  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  4.20296e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  62.95 
 
 
234 aa  295  4e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.23 
 
 
232 aa  291  4e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  62.78 
 
 
232 aa  292  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  62.33 
 
 
232 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  62.33 
 
 
232 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.51 
 
 
234 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.51 
 
 
234 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  63.96 
 
 
234 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  62.33 
 
 
232 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  62.33 
 
 
232 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  62.33 
 
 
232 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  60.53 
 
 
236 aa  289  3e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3557  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  61.61 
 
 
230 aa  288  5e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  62.22 
 
 
230 aa  288  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2502  two-component response regulator of kdp operon  63.35 
 
 
234 aa  287  8e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  61.43 
 
 
232 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  61.43 
 
 
232 aa  286  3e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  59.91 
 
 
230 aa  281  8e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1666  two component transcriptional regulator  57.92 
 
 
230 aa  275  4e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.91 
 
 
248 aa  275  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  55.8 
 
 
229 aa  258  5e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  57.21 
 
 
231 aa  257  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  56.5 
 
 
231 aa  256  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  55.41 
 
 
230 aa  254  9e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  54.55 
 
 
247 aa  252  4e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.27 
 
 
231 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.82 
 
 
231 aa  249  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  55.45 
 
 
233 aa  244  7e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  53.98 
 
 
226 aa  244  1e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0891  two component transcriptional regulator  55.91 
 
 
231 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3117  two component transcriptional regulator, winged helix family  75.16 
 
 
204 aa  239  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.47 
 
 
232 aa  238  6e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  52.04 
 
 
228 aa  234  1e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  52.25 
 
 
230 aa  233  2e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.8 
 
 
240 aa  233  2e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.42123e-13 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  51.12 
 
 
230 aa  231  9e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2379  two component transcriptional regulator  55.75 
 
 
250 aa  230  1e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.524484  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  50.45 
 
 
230 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.91 
 
 
235 aa  229  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 
235 aa  229  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 
231 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  50 
 
 
230 aa  228  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  52.23 
 
 
240 aa  228  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 
228 aa  228  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  50.9 
 
 
231 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.45 
 
 
235 aa  228  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  50 
 
 
241 aa  226  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
231 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  50.45 
 
 
231 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 
230 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1100  two component transcriptional regulator  52.27 
 
 
230 aa  224  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  52 
 
 
224 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  49.78 
 
 
231 aa  224  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.21 
 
 
235 aa  223  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  50 
 
 
226 aa  223  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0450  two component transcriptional regulator  53.39 
 
 
232 aa  220  1e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  51.13 
 
 
228 aa  219  2e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 
230 aa  218  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.53 
 
 
228 aa  218  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  51.13 
 
 
228 aa  217  1e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5029  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 
225 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2604  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.43 
 
 
246 aa  215  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  51.77 
 
 
224 aa  215  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  50.68 
 
 
228 aa  215  5e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 
230 aa  213  2e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1436  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.56 
 
 
374 aa  213  2e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235107  normal  0.196067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 
226 aa  212  3e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>