More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0853 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  524  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  4.37553e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  99.61 
 
 
256 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  7.86446e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  99.61 
 
 
256 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  2.84969e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  99.22 
 
 
256 aa  520  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  99.61 
 
 
256 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  3.20823e-05  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  89.37 
 
 
254 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  1.35641e-09  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  89.76 
 
 
254 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  1.45499e-12  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  89.37 
 
 
254 aa  471  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.61502e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  88.98 
 
 
254 aa  468  1e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.07362e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  88.98 
 
 
254 aa  468  1e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.90791e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  88.98 
 
 
254 aa  470  1e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  4.54581e-09  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  88.98 
 
 
254 aa  468  1e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  1.0714e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  88.98 
 
 
254 aa  468  1e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.44031e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  88.98 
 
 
254 aa  468  1e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  3.12971e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  80.39 
 
 
257 aa  426  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  6.12925e-08  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  67.06 
 
 
259 aa  361  5e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  65.87 
 
 
255 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.14451e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  65.48 
 
 
255 aa  348  4e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  65.08 
 
 
255 aa  347  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.42239e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  63.49 
 
 
259 aa  347  2e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  3.31929e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  63.53 
 
 
260 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  64.17 
 
 
260 aa  340  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1239  alpha/beta hydrolase fold  63.49 
 
 
257 aa  322  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.13614e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  47.9 
 
 
255 aa  243  3e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.12375e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  47.9 
 
 
255 aa  235  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  46.69 
 
 
257 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  7.46451e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  42.47 
 
 
258 aa  228  5e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1209  esterase/lipase  41.9 
 
 
311 aa  216  3e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  43.85 
 
 
259 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2334  alpha/beta hydrolase fold  42.51 
 
 
258 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000909068  hitchhiker  8.46948e-05 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1880  alpha/beta hydrolase fold  42.91 
 
 
258 aa  192  4e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.36147e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1704  alpha/beta fold family hydrolase  43.93 
 
 
262 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000659233  normal  0.0248748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2333  alpha/beta fold family hydrolase  40.15 
 
 
280 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  41.6 
 
 
255 aa  189  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  2.23856e-06 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2194  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
258 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  6.35452e-08  unclonable  4.336e-06 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  40.64 
 
 
264 aa  185  6e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1913  alpha/beta hydrolase fold  41.3 
 
 
257 aa  185  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  3.59899e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2240  alpha/beta hydrolase fold protein  41.7 
 
 
258 aa  184  9e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  3.09374e-07  hitchhiker  7.81643e-10 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2227  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
258 aa  184  1e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  6.90683e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4513  hypothetical protein  41.7 
 
 
258 aa  184  1e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  37.66 
 
 
258 aa  184  1e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 
252 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1942  alpha/beta hydrolase fold  40.33 
 
 
266 aa  182  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000178977  hitchhiker  0.00172948 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2144  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
258 aa  182  4e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  4.12012e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2136  alpha/beta hydrolase fold  40.33 
 
 
266 aa  182  5e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.06984e-05  decreased coverage  7.41326e-06 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2033  alpha/beta hydrolase fold  40.33 
 
 
266 aa  182  5e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.95645e-05  hitchhiker  0.000143979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1987  alpha/beta hydrolase fold  41.06 
 
 
253 aa  177  1e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0877  alpha/beta hydrolase fold  39.75 
 
 
260 aa  172  5e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1579  alpha/beta fold family hydrolase  37.86 
 
 
265 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2781  alpha/beta hydrolase fold  41.22 
 
 
261 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2479  alpha/beta hydrolase fold  39.69 
 
 
256 aa  166  3e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.261597 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0821  esterase/lipase/thioesterase  39.69 
 
 
256 aa  166  3e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
256 aa  165  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  36.64 
 
 
258 aa  164  2e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2849  alpha/beta hydrolase fold  37.75 
 
 
254 aa  161  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0918  alpha/beta hydrolase fold  38.37 
 
 
255 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.891406  normal  0.241554 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01088  hypothetical esterase/lipase ybfF  39.56 
 
 
230 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  6.42463e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  39.34 
 
 
259 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1935  alpha/beta hydrolase  38.46 
 
 
268 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1030  alpha/beta hydrolase fold  38.37 
 
 
264 aa  155  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3000  alpha/beta hydrolase fold  36.51 
 
 
253 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  38.65 
 
 
267 aa  153  3e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  35.86 
 
 
271 aa  150  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1586  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
252 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3402  esterase/lipase  36.13 
 
 
235 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  37.16 
 
 
257 aa  147  1e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3436  alpha/beta hydrolase  40.59 
 
 
256 aa  145  7e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  36.29 
 
 
260 aa  145  8e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  33.07 
 
 
253 aa  139  4e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5337  alpha/beta hydrolase fold protein  34.14 
 
 
264 aa  139  5e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0345321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1699  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 
254 aa  138  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2707  Alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
264 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  32.69 
 
 
265 aa  134  2e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0820  alpha/beta hydrolase fold protein  36.1 
 
 
255 aa  130  2e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_21912  predicted protein  29.96 
 
 
261 aa  129  4e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2149  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 
227 aa  127  2e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1790  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
268 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.911201  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.93 
 
 
264 aa  123  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.31361 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  32.27 
 
 
295 aa  120  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  32.01 
 
 
281 aa  117  2e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1485  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
263 aa  116  4e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0519  alpha/beta hydrolase fold protein  31.89 
 
 
256 aa  115  9e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1037  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
226 aa  114  2e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2022  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
265 aa  111  1e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0500364  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15660  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.6 
 
 
277 aa  97.8  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0398174  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57391  predicted protein  28.68 
 
 
306 aa  93.2  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209701  normal  0.500519 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  27.86 
 
 
293 aa  88.6  8e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05610  mitochondrion protein, putative  29.62 
 
 
356 aa  84  2e-15  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.92 
 
 
282 aa  77.8  1e-13  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1049  Alpha/beta hydrolase  28.03 
 
 
285 aa  75.1  1e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 
316 aa  71.6  1e-11  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2154  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 
257 aa  69.7  4e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0016859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3822  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
308 aa  69.3  6e-11  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0800  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
267 aa  68.2  1e-10  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.156653 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4130  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 
301 aa  68.2  1e-10  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
271 aa  67.4  2e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0326  alpha/beta fold family hydrolase  23.74 
 
 
267 aa  67.8  2e-10  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.339818  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1181  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
300 aa  67  3e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
304 aa  65.5  7e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1188  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 
289 aa  64.7  1e-09  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.971563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>