43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0852 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0816  LexA regulated protein  100 
 
 
97 aa  191  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  3.03434e-05  normal  0.244625 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0742  LexA regulated protein  100 
 
 
97 aa  191  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  8.25535e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0803  LexA regulated protein  100 
 
 
97 aa  191  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  7.41586e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0755  LexA regulated protein  100 
 
 
97 aa  191  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  8.19206e-06  normal  0.247968 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0852  LexA regulated protein  100 
 
 
97 aa  191  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  4.87307e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0780  LexA regulated protein  90.72 
 
 
120 aa  179  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  1.2319e-09  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2971  LexA regulated protein  90.72 
 
 
120 aa  179  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  1.39285e-07  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2952  CopG domain protein DNA-binding domain protein  90.72 
 
 
120 aa  179  2e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.90271e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0732  LexA regulated protein  90.72 
 
 
97 aa  177  3e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.95489e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0713  LexA regulated protein  90.72 
 
 
97 aa  177  3e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  2.36338e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0707  LexA regulated protein  90.72 
 
 
97 aa  177  3e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.00993e-10  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0565  LexA regulated protein  90.72 
 
 
97 aa  177  3e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  9.1188e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00642  LexA regulated protein  90.72 
 
 
97 aa  177  3e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  2.94576e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00633  hypothetical protein  90.72 
 
 
97 aa  177  3e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  2.47285e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1200  LexA regulated protein  91.3 
 
 
95 aa  162  2e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  8.8434e-09  hitchhiker  0.000162968 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0320  LexA regulated protein  87.5 
 
 
95 aa  154  5e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.91974e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2989  LexA regulated protein  87.5 
 
 
95 aa  154  5e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0164984  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2899  LexA regulated protein  87.5 
 
 
95 aa  154  5e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.83415e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1238  LexA regulated protein  87.5 
 
 
95 aa  154  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  3.06733e-11  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1209  LexA regulated protein  86.36 
 
 
93 aa  152  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  4.98844e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3122  LexA regulated protein  85.23 
 
 
93 aa  150  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  1.18498e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2936  LexA regulated protein  84.09 
 
 
93 aa  150  6e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.963687  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1120  LexA regulated protein  80.68 
 
 
93 aa  126  1e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1878  LexA regulated protein  65.91 
 
 
90 aa  120  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  9.4707e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2242  LexA regulated protein  65.91 
 
 
90 aa  119  2e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  3.27754e-08  decreased coverage  3.34576e-11 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2192  LexA regulated protein  65.91 
 
 
90 aa  119  2e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  5.07798e-09  unclonable  3.65361e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1940  LexA regulated protein  64.77 
 
 
90 aa  118  2e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  2.97749e-07  hitchhiker  0.00153004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2138  LexA regulated protein  64.77 
 
 
90 aa  118  2e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  8.22243e-08  decreased coverage  6.10258e-06 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4515  LexA regulated protein  65.91 
 
 
90 aa  119  2e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2229  LexA regulated protein  65.91 
 
 
90 aa  119  2e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.71947e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2142  LexA regulated protein  65.91 
 
 
90 aa  119  2e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  5.48725e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2035  LexA regulated protein  64.77 
 
 
90 aa  118  2e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  9.86212e-08  hitchhiker  0.000334724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2331  LexA regulated protein  64.77 
 
 
90 aa  118  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1918  LexA regulated protein  63.64 
 
 
90 aa  117  5e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.93466e-08  unclonable  1.85851e-06 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2052  LexA regulated protein  66.28 
 
 
90 aa  116  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  6.97819e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1911  LexA regulated protein  64.77 
 
 
90 aa  114  4e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.41756e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2271  LexA regulated protein  63.64 
 
 
90 aa  113  7e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.95646e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1702  LexA regulated protein  63.64 
 
 
90 aa  113  9e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  7.48973e-06  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1989  LexA regulated protein  61.36 
 
 
90 aa  113  1e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.52502e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1577  LexA regulated protein  62.22 
 
 
93 aa  112  1e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2336  LexA regulated protein  61.36 
 
 
91 aa  110  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.57855e-06  hitchhiker  6.38777e-05 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0875  LexA regulated protein  52.81 
 
 
89 aa  97.4  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2886  LexA regulated protein  43.18 
 
 
96 aa  75.5  2e-13  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000126708  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>