49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0704 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0704  phage minor tail protein  100 
 
 
109 aa  227  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154722 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2800  phage minor tail protein  100 
 
 
109 aa  227  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.732108  normal  0.653749 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0909  phage minor tail protein  70.37 
 
 
109 aa  173  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1417  phage minor tail protein  58.33 
 
 
110 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0253918 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1152  phage minor tail protein  58.33 
 
 
110 aa  148  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1080  phage minor tail protein  58.33 
 
 
110 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.282749 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2105  minor tail family protein  54.63 
 
 
109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000552364  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1634  phage minor tail protein  53.7 
 
 
109 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.155069 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00746  hypothetical protein  54.63 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10050  tail component  54.63 
 
 
109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3193  phage minor tail protein  51.85 
 
 
109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000147806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3125  phage minor tail protein  51.85 
 
 
109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0375615 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1873  phage minor tail protein  51.85 
 
 
109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1797  phage minor tail protein  51.85 
 
 
109 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0414413 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2767  phage minor tail protein  51.85 
 
 
109 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.805166 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1468  phage minor tail protein  51.85 
 
 
109 aa  124  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1196  phage minor tail protein  51.85 
 
 
109 aa  124  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0884  phage minor tail protein  50.93 
 
 
109 aa  122  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1199  phage minor tail protein  42.06 
 
 
113 aa  98.6  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607618 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1089  phage minor tail protein  40.37 
 
 
113 aa  90.5  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.674881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2882  phage minor tail protein  39.45 
 
 
113 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000117946 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2236  phage minor tail protein  39.45 
 
 
113 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000997154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2172  phage minor tail protein  39.45 
 
 
113 aa  89  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.126173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0659  phage minor tail protein  40.54 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000282073 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1550  phage minor tail protein  38.53 
 
 
113 aa  86.3  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0913332  hitchhiker  0.00355714 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3386  minor tail family protein  37.17 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.36986  hitchhiker  0.000000000407319 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3877  minor tail family protein  38.39 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266915  normal  0.28398 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2582  minor tail family protein  30.19 
 
 
111 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.509278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0781  hypothetical protein  35.19 
 
 
113 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.602909  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1691  phage HK97 GP17-like protein  35.53 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.294427  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08250  hypothetical protein  35.19 
 
 
113 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222375 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1689  Phage minor tail protein  35.56 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2418  phage minor tail protein  29.91 
 
 
112 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0502911  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1057  Phage minor tail protein  34.44 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0742722  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0090  phage minor tail protein  31.78 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2952  prophage LambdaSo, minor tail protein M, putative  26.42 
 
 
111 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2224  phage minor tail family protein  34.21 
 
 
112 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.869121 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0450  LambdaSo, minor tail protein M  31.25 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0159877  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1883  phage minor tail  30.1 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2779  Phage minor tail  27.1 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00996028  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3932  minor tail family protein  34.21 
 
 
112 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3100  minor tail family protein  31.48 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.033574  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4061  minor tail family protein  31.46 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5051  minor tail family protein  31.46 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5471  hypothetical protein  25.66 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3531  minor tail family protein  29.41 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567031  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3878  minor tail family protein  29.41 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5754  minor tail family protein  29.41 
 
 
121 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2201  phage minor tail protein  30 
 
 
113 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>