23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0655 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0655  KilA, N- domain protein  100 
 
 
284 aa  591  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.243495  hitchhiker  0.00000329473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4450  KilA-N domain family  53.27 
 
 
265 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000955205  unclonable  0.00000000145542 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2280  KilA-N domain-containing protein  43.31 
 
 
286 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0187873  decreased coverage  1.7596300000000002e-23 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2154  KilA-N domain family  49.55 
 
 
269 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000036696  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3591  phage antirepressor protein  48.11 
 
 
251 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1028  hypothetical protein  37.21 
 
 
257 aa  97.8  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.604601  normal  0.514281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3253  KilA domain-containing protein  49.43 
 
 
259 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000473609  decreased coverage  0.00000000000000635561 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  27.94 
 
 
292 aa  86.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2209  hypothetical protein  49.35 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.780892  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2212  hypothetical protein  41.18 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.803951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0561  KilA domain-containing protein  27.72 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2244  hypothetical protein  43.08 
 
 
264 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0101557  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0630  KilA-N domain family  28.85 
 
 
165 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.322077  hitchhiker  0.00000226954 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2877  antirepressor protein  22.54 
 
 
334 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2898  KilA-N domain protein  29.67 
 
 
165 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.892571  hitchhiker  0.0000000704164 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1228  hypothetical protein  29.31 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000185797 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1443  hypothetical protein  27.69 
 
 
274 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.450311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0343  KilA domain protein  53.12 
 
 
279 aa  45.4  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00871  hypothetical protein  45.71 
 
 
273 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3542  hypothetical protein  45.71 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.566225  normal  0.0498158 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0480  hypothetical protein  40 
 
 
271 aa  43.5  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0652  KilA domain protein  39.47 
 
 
267 aa  42.7  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3302  hypothetical protein  24.44 
 
 
273 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0541654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>