69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0621 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0621  gp61  100 
 
 		 610 aa  1274    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.934548  decreased coverage  0.000000719384 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2117  hypothetical protein  44.97 
 
 		 610 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3447  hypothetical protein  41.13 
 
 		 597 aa  432  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0187  putative DNA primase/helicase  39.03 
 
 		 788 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0913  phage related protein  32.52 
 
 		 342 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1933  hypothetical protein  37.32 
 
 		 323 aa  169  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262327  hitchhiker  0.000000452368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3911  TOPRIM domain protein  27.62 
 
 		 607 aa  135  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.305392  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94562  predicted protein  27.25 
 
 		 592 aa  103  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.650535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_605  predicted protein  23.94 
 
 		 646 aa  95.1  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0053  TOPRIM domain-containing protein  24.22 
 
 		 601 aa  91.7  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00140147  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2270  DNA primase/helicase  24.42 
 
 		 544 aa  87  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.411538  normal  0.0115739 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3347  TOPRIM domain-containing protein  24.69 
 
 		 515 aa  67.8  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  33.86 
 
 		 344 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2768  hypothetical protein  24.59 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  41.56 
 
 		 712 aa  60.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  41.56 
 
 		 720 aa  60.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  41.56 
 
 		 712 aa  60.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  41.56 
 
 		 712 aa  60.5  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  41.56 
 
 		 716 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  29.1 
 
 		 682 aa  58.9  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0534  hypothetical protein  30.53 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  40.26 
 
 		 712 aa  57.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0191  hypothetical protein  31.47 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.271456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4224  hypothetical protein  30.22 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.427202  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5568  hypothetical protein  32.58 
 
 		 352 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0489435  normal  0.0673092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3221  hypothetical protein  26.44 
 
 		 760 aa  55.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.038701  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  41.43 
 
 		 731 aa  56.2  0.000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  24.05 
 
 		 738 aa  56.2  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8283  hypothetical protein  38.46 
 
 		 357 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.331955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3335  hypothetical protein  31.58 
 
 		 351 aa  54.3  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  30 
 
 		 344 aa  53.9  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0376  hypothetical protein  34.07 
 
 		 345 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.325064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0770  hypothetical protein  31.87 
 
 		 346 aa  53.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.813668 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7414  hypothetical protein  26.56 
 
 		 354 aa  53.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4580  hypothetical protein  38.16 
 
 		 345 aa  53.5  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  29.14 
 
 		 759 aa  52.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2859  hypothetical protein  33.75 
 
 		 347 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0830067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2648  hypothetical protein  47.54 
 
 		 755 aa  52.8  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1612  virulence-associated E family protein  39.13 
 
 		 892 aa  52.4  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7718  hypothetical protein  35 
 
 		 353 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.731705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0572  hypothetical protein  36.84 
 
 		 345 aa  52  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2129  hypothetical protein  31.87 
 
 		 353 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.247766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3829  hypothetical protein  28.46 
 
 		 346 aa  52  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0758278  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  28.83 
 
 		 765 aa  51.2  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2651  hypothetical protein  35.53 
 
 		 348 aa  51.2  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.115024 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1537  hypothetical protein  38.36 
 
 		 103 aa  50.4  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  48.08 
 
 		 834 aa  50.4  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0841  mobilizable transposon, excision protein, putative  24.1 
 
 		 297 aa  49.7  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.012073 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6058  hypothetical protein  30.95 
 
 		 348 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2517  hypothetical protein  40 
 
 		 350 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.925497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  24.2 
 
 		 517 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4213  hypothetical protein  39.74 
 
 		 112 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.936932  normal  0.431658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4024  hypothetical protein  34.21 
 
 		 350 aa  48.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0488108 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  32.5 
 
 		 347 aa  48.5  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2345  hypothetical protein  34.21 
 
 		 345 aa  47.8  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  46.15 
 
 		 838 aa  47.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2785  hypothetical protein  33.33 
 
 		 353 aa  47.8  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  29.92 
 
 		 344 aa  47.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  29.92 
 
 		 344 aa  47.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2260  DNA primase-like protein  27.75 
 
 		 922 aa  47.4  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7053  hypothetical protein  38.36 
 
 		 102 aa  46.6  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.496846  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  26.82 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3697  TOPRIM  30.93 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.779758  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4156  hypothetical protein  24.4 
 
 		 345 aa  46.2  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0404908  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  29.37 
 
 		 346 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  24.7 
 
 		 918 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3066  hypothetical protein  29.23 
 
 		 346 aa  45.8  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.43309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3565  hypothetical protein  31.03 
 
 		 342 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7732  hypothetical protein  36.99 
 
 		 102 aa  43.5  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>