More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0566 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  100 
 
 
225 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  100 
 
 
225 aa  467  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  99.56 
 
 
225 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  99.56 
 
 
225 aa  465  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  99.11 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  75.11 
 
 
225 aa  359  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  75.11 
 
 
225 aa  359  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  75.11 
 
 
225 aa  359  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  74.67 
 
 
225 aa  358  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  74.67 
 
 
225 aa  357  7e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  74.67 
 
 
225 aa  357  7e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  74.22 
 
 
225 aa  355  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  74.22 
 
 
225 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  74.22 
 
 
225 aa  355  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  60.89 
 
 
225 aa  287  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 
218 aa  202  4e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.55 
 
 
212 aa  194  1e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  46.27 
 
 
216 aa  186  3e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  45.27 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  40.58 
 
 
220 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  40.58 
 
 
220 aa  156  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 
220 aa  148  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2860  ABC transporter related  38.24 
 
 
242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1235  ABC transporter related  37.24 
 
 
225 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  36.71 
 
 
366 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2631  ABC transporter related  39.34 
 
 
264 aa  125  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  35.21 
 
 
326 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0496  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  33.77 
 
 
359 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0754513  normal  0.366469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  35.21 
 
 
326 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0750  ABC transporter related  36.54 
 
 
330 aa  122  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.19269  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  36.94 
 
 
353 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0730  ABC transporter related  36.06 
 
 
330 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.86 
 
 
365 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.27 
 
 
375 aa  119  3.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0699  ABC transporter related  38.31 
 
 
224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.442107  normal  0.210343 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0122  ABC transporter related protein  35.9 
 
 
205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.60914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0982  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.07 
 
 
363 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  34.23 
 
 
364 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2573  ABC transporter related protein  41.97 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.09 
 
 
375 aa  118  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
332 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.09 
 
 
375 aa  118  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
329 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  34.27 
 
 
329 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  37.76 
 
 
222 aa  118  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0765  ABC transporter related  39.06 
 
 
224 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0339667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  35.05 
 
 
323 aa  118  7.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
352 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.72 
 
 
354 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1187  ABC transporter related  36.36 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
330 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  37.13 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
353 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.86 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.39 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.39 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  33.18 
 
 
366 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  33.94 
 
 
362 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  36.36 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  32.39 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.86 
 
 
352 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.39 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  35.82 
 
 
324 aa  116  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  36.32 
 
 
696 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0375  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 
316 aa  116  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3956  ABC transporter related  33.63 
 
 
355 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.396032  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32 
 
 
330 aa  116  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
351 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
351 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2129  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 
240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
351 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
351 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
351 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
351 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  32.39 
 
 
351 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  32.88 
 
 
353 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.86 
 
 
352 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 
374 aa  115  6e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.89 
 
 
370 aa  115  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.86 
 
 
329 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  33.18 
 
 
357 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  33.33 
 
 
329 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  34.67 
 
 
364 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.97 
 
 
367 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2039  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 
356 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  31.46 
 
 
352 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.86 
 
 
329 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  32.39 
 
 
355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2137  ABC transporter related  34.45 
 
 
312 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1061  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  34.08 
 
 
382 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000354755  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2291  ABC transporter related  35.48 
 
 
255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000398246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  32.39 
 
 
352 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2821  ABC transporter, ATPase subunit  33.66 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341071  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.38 
 
 
331 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  33.33 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1889  type I secretion system ATPase  35.59 
 
 
712 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  32.86 
 
 
352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  38.42 
 
 
579 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  33.78 
 
 
362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  32.71 
 
 
359 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>