More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0528 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00408  conserved inner membrane protein  67.44 
 
 
516 aa  741    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3153  EAL domain protein  67.44 
 
 
516 aa  738    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.516748  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0509  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  99.42 
 
 
516 aa  1049    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000640721  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0571  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  99.61 
 
 
516 aa  1050    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0177316  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0500  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  67.05 
 
 
516 aa  737    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0386  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  66.87 
 
 
498 aa  712    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0528  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  100 
 
 
516 aa  1055    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000439808  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0492  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  67.7 
 
 
518 aa  741    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0518  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  99.61 
 
 
516 aa  1050    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00021587  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0930  EAL domain-containing protein  63.95 
 
 
520 aa  685    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.010678  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0533  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  67.7 
 
 
518 aa  738    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3159  EAL domain-containing protein  67.44 
 
 
516 aa  738    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0547  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  67.44 
 
 
516 aa  742    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29688  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0512  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  99.81 
 
 
516 aa  1052    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.491599  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00412  hypothetical protein  68.97 
 
 
406 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1677  EAL  35.05 
 
 
523 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5276  putative signal transduction protein  34.44 
 
 
529 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134868  normal  0.223865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1090  EAL-containing signal transduction protein  35.16 
 
 
530 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0487419  hitchhiker  0.00477361 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0975  EAL domain protein  34.83 
 
 
538 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4659  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  34.27 
 
 
533 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4515  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.9 
 
 
533 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4609  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.71 
 
 
533 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.18383  normal  0.98216 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.98 
 
 
516 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4608  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  33.52 
 
 
533 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.342789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03933  hypothetical protein  32.95 
 
 
528 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.123718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3931  EAL domain protein  32.95 
 
 
528 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03893  hypothetical protein  32.95 
 
 
528 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3966  EAL domain-containing protein  32.95 
 
 
528 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0738656 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4614  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.95 
 
 
528 aa  282  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4303  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.95 
 
 
528 aa  282  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5564  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  33.08 
 
 
528 aa  279  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.718753  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4523  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.76 
 
 
528 aa  279  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0265  EAL domain-containing protein  32.24 
 
 
528 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0344  EAL domain-containing protein  33.14 
 
 
530 aa  269  7e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0404  EAL domain protein  35.36 
 
 
538 aa  267  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0754229  normal  0.162888 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2925  EAL domain-containing protein  35.18 
 
 
537 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0148  EAL domain-containing protein  32.34 
 
 
535 aa  257  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0131  EAL domain containing protein  32.14 
 
 
535 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0146  EAL domain-containing protein  32.14 
 
 
532 aa  256  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85827  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3335  EAL domain protein  31.65 
 
 
540 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0122  EAL  30.86 
 
 
525 aa  249  8e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0048  EAL  30.9 
 
 
538 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.215998 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03877  Putative signal protein with EAL domain  46.32 
 
 
374 aa  248  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5097  EAL domain-containing protein  30.42 
 
 
542 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.217688 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3724  EAL-containing signal transduction protein  31.71 
 
 
536 aa  217  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.549123  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1385  signal transduction protein containing sensor and EAL domains-like protein  31.57 
 
 
522 aa  217  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.41583  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1771  hypothetical protein  30.23 
 
 
522 aa  212  1e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1709  EAL domain-containing protein  30.29 
 
 
530 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2200  EAL domain protein  29.39 
 
 
529 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4488  EAL domain protein  30.32 
 
 
534 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4205  EAL domain protein  30.66 
 
 
535 aa  189  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0133  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.5 
 
 
1077 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0355057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0133  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.74 
 
 
1074 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0487  EAL domain-containing protein  38.57 
 
 
544 aa  188  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.606097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4221  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.74 
 
 
733 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.74 
 
 
1074 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0141  sensory box protein  35.19 
 
 
1077 aa  187  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0138  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.42 
 
 
1074 aa  187  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0134  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.38 
 
 
1077 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0105152 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0128  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.38 
 
 
1077 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.184244 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0133  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.24 
 
 
1077 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0608  putative signaling membrane protein  39.55 
 
 
516 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.201434  normal  0.689714 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2526  EAL domain protein  29.48 
 
 
526 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0436  cyclic diguanylate phosphodiesterase  36.05 
 
 
516 aa  182  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0237258  hitchhiker  0.0000188077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0396  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.93 
 
 
516 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0476649  hitchhiker  0.000376911 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0383  hypothetical protein  36.46 
 
 
516 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0298247  normal  0.0200463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0376  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  35.93 
 
 
516 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000844741  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0965  GGDEF domain-containing protein  31.22 
 
 
680 aa  179  8e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00724002  normal  0.0458332 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0374  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain-containing protein  35.59 
 
 
516 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0285785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1646  diguanylate phosphodiesterase  27.59 
 
 
501 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3323  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.06 
 
 
711 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.444283  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0528  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  39.54 
 
 
858 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2830  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.28 
 
 
682 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0701966  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3569  sensory box protein  37.5 
 
 
1071 aa  172  9e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1425  hypothetical protein  34.93 
 
 
532 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.28 
 
 
684 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0216958  hitchhiker  0.00000239027 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1095  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.28 
 
 
684 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10926  normal  0.0282645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3557  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.48 
 
 
677 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.026762  decreased coverage  0.00000188852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4765  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.42 
 
 
1074 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000523741 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5279  RNase II stability modulator  35.37 
 
 
666 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164085  normal  0.0978812 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0994  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 
678 aa  171  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.031573  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.04 
 
 
954 aa  170  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3235  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.96 
 
 
684 aa  170  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.612111  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1297  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.43 
 
 
891 aa  169  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.112988  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1132  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  33.65 
 
 
684 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00732829  unclonable  0.0000000000153183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1018  GGDEF domain-containing protein  33.86 
 
 
678 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00123246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6649  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  37.5 
 
 
871 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829365  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3413  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.65 
 
 
684 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.341259  hitchhiker  0.0009308 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3276  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.65 
 
 
684 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0261711  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1208  GGDEF domain-containing protein  33.96 
 
 
684 aa  169  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4938  putative lipoprotein  37.89 
 
 
686 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0553  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.42 
 
 
699 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4373  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.71 
 
 
1076 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1268  cyclic diguanylate phosphodiesterase (EAL) domain protein  36.3 
 
 
504 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.585411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3097  cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  28.75 
 
 
533 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.230012  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1616  diguanylate phosphodiesterase  37.98 
 
 
500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.59158  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3056  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.02 
 
 
679 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.029022  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3385  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.65 
 
 
677 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.093446  hitchhiker  0.00322897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2823  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.96 
 
 
677 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.992425  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1034  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.65 
 
 
674 aa  167  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.20154  hitchhiker  0.000000435621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>