More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0303 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2505  type VI secretion ATPase  47.63 
 
 		 865 aa  748    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0732  type VI secretion ATPase  43.48 
 
 		 882 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.759249  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0942  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  62.98 
 
 		 906 aa  1067    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0433  clpB protein, putative  47.49 
 
 		 875 aa  658    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0170  AAA family ATPase  43.38 
 
 		 882 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000964396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3095  chaperone-associated ATPase, putative  47.58 
 
 		 878 aa  739    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0408  type VI secretion ATPase  47.98 
 
 		 889 aa  699    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3013  ATPase  54.32 
 
 		 887 aa  883    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01959  putative CLPA/B-type chaperone protein  46 
 
 		 905 aa  702    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0459  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.35 
 
 		 884 aa  868    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3255  type VI secretion ATPase  43.55 
 
 		 884 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1177  chaperone ClpB-1  41.21 
 
 		 872 aa  647    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5425  clpB protein, putative  42.37 
 
 		 882 aa  640    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0310  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  99.54 
 
 		 879 aa  1769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2830  ClpA/B type protease  47.84 
 
 		 897 aa  709    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0409  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.24 
 
 		 884 aa  868    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.834401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  62.89 
 
 		 895 aa  1070    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2331  ATPase  53.42 
 
 		 900 aa  882    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518917  normal  0.0250901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0530  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  52.51 
 
 		 909 aa  921    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4958  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:Clp, N terminal  47.25 
 
 		 867 aa  731    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3430  AAA family ATPase  44.6 
 
 		 867 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2171  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  47.97 
 
 		 899 aa  736    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203695  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0200  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  51.94 
 
 		 908 aa  821    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0451  type VI secretion ATPase  48.33 
 
 		 889 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1727  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  46.32 
 
 		 898 aa  687    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.141687  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3036  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  49.89 
 
 		 903 aa  798    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.125208  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5260  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal:phosphopantetheine attachment site  44.43 
 
 		 913 aa  678    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2829  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.58 
 
 		 888 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50860  AAA ATPase  48.08 
 
 		 842 aa  657    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2696  Clp ATPase  58.12 
 
 		 891 aa  984    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310032  hitchhiker  0.00716242 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3629  ClpA/B type protease  48.05 
 
 		 889 aa  715    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3638  protease associated ATPase ClpB  48.05 
 
 		 889 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1194  SciG protein  54.46 
 
 		 888 aa  877    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.445857  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  62.89 
 
 		 918 aa  1070    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0303  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  100 
 
 		 887 aa  1804    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.649065  normal  0.656234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00259  ClpB  51.32 
 
 		 901 aa  818    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.388989  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2924  type VI secretion ATPase  47.54 
 
 		 889 aa  716    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3412  ClpA/B-type protease  46.7 
 
 		 846 aa  652    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.219119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3147  ClpA/B type protease  48.05 
 
 		 889 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5584  ClpB protein, putative  41.45 
 
 		 885 aa  640    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3474  hypothetical protein  48.49 
 
 		 889 aa  745    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2820  heat shock protein ClpB-like  45.51 
 
 		 899 aa  686    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3565  chaperonin clpA/B/, ATPase  47.54 
 
 		 889 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0979  AAA ATPase, Clp  60.94 
 
 		 893 aa  1038    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1582  AAA ATPase, Clp  53.66 
 
 		 887 aa  872    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.385377 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05872  ClpA/B type protease  43.35 
 
 		 894 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3315  AAA ATPase  46.67 
 
 		 878 aa  648    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3129  ClpA/ClpB family protein  43.82 
 
 		 881 aa  672    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6115  type VI secretion ATPase  63.13 
 
 		 906 aa  1086    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.24944 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0140  ClpA/B type protease  62.98 
 
 		 918 aa  1070    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0264  ClpA/B type protease  54.58 
 
 		 885 aa  866    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02051  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  46.09 
 
 		 910 aa  699    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0298  ClpV1 family type VI secretion ATPase  99.2 
 
 		 879 aa  1769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.140659 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2958  ClpA/B type protease  47.45 
 
 		 887 aa  708    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2627  ATPase  47.69 
 
 		 865 aa  736    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3008  type VI secretion ATPase  63.31 
 
 		 887 aa  1056    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.694327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2366  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  49.83 
 
 		 904 aa  783    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.266382 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1789  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.24 
 
 		 884 aa  867    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0160275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1536  fibronectin, type III  43.46 
 
 		 897 aa  701    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1362  Clp protease-associated protein ClpB  58.34 
 
 		 885 aa  989    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  62.92 
 
 		 895 aa  1068    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2982  AAA family ATPase  43.41 
 
 		 880 aa  667    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00017738 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2096  putative ClpA/B-type chaperone, ATPase subunit ClpB, heat shock protein  62.26 
 
 		 916 aa  1058    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26610  ClpA/B-type protease  52.55 
 
 		 886 aa  833    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526897  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  62.38 
 
 		 889 aa  1066    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0295  ATPase  99.66 
 
 		 879 aa  1774    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.621453  normal  0.878276 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2273  ATPase AAA-2  46.84 
 
 		 889 aa  733    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3864  type VI secretion ATPase  54.21 
 
 		 928 aa  888    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00372415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0618  ATPase AAA-2  45.52 
 
 		 893 aa  685    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0224161 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0162  type VI secretion ATPase  52.63 
 
 		 902 aa  894    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.475088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2505  AAA family ATPase  43.64 
 
 		 880 aa  668    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4084  type VI secretion ATPase  53.56 
 
 		 916 aa  892    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000202411 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2890  type VI secretion ATPase  47.58 
 
 		 849 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3906  type VI secretion ATPase  61.2 
 
 		 893 aa  1031    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.356382 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000027  ClpB protein  45.01 
 
 		 855 aa  682    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3118  ATPase  48.83 
 
 		 889 aa  765    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0362166 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1713  ClpA/B type protease  48.05 
 
 		 889 aa  716    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1684  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  64.87 
 
 		 898 aa  1098    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2362  ATPase  45.41 
 
 		 868 aa  719    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.488644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0387  ATPase  48.11 
 
 		 889 aa  710    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.315602  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3473  ATPase  63.99 
 
 		 897 aa  1078    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.150348  normal  0.618015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01100  putative ClpA/B-type chaperone  51.83 
 
 		 902 aa  896    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33990  putative ClpA/B-type protease  47.18 
 
 		 849 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000016123  normal  0.0826946 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0804  type VI secretion ATPase  43.18 
 
 		 880 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.493869  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0473  ATPase  48.44 
 
 		 889 aa  712    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2954  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.46 
 
 		 888 aa  875    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.400792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2440  ATPase  49.61 
 
 		 915 aa  756    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.217736  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3559  type VI secretion ATPase  44.69 
 
 		 862 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3724  ATPase  42.79 
 
 		 895 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.154192  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3644  type VI secretion ATPase  45.1 
 
 		 902 aa  672    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.9184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3069  ATPase  49.2 
 
 		 882 aa  750    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2449  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  56.13 
 
 		 869 aa  897    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258414  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4919  type VI secretion ATPase, ClpV1 family  48.74 
 
 		 891 aa  701    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.989717  hitchhiker  0.00768481 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1474  type VI secretion ATPase  58.34 
 
 		 885 aa  989    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5984  type VI secretion ATPase  45.97 
 
 		 909 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1606  putative ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  54.24 
 
 		 884 aa  868    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0054  ClpA/B type protease  47.84 
 
 		 897 aa  709    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.622723  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3654  ClpA/B type protease  48.05 
 
 		 889 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1789  ATPase  45.02 
 
 		 884 aa  685    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2769  type VI secretion ATPase  48.1 
 
 		 865 aa  747    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186875  normal  0.804579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>