83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0260 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0255  endochitinase  99.64 
 
 
587 aa  1141    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.931196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0271  endochitinase  99.64 
 
 
587 aa  1142    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.527688  normal  0.775272 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0255  endochitinase  99.82 
 
 
587 aa  1144    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.942643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0274  endochitinase  99.82 
 
 
587 aa  1144    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0260  basic endochitinase  100 
 
 
553 aa  1142    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  55.66 
 
 
565 aa  609  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004329  chitinase  48.55 
 
 
567 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0298  putative chitinase  48.68 
 
 
574 aa  367  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01081  hypothetical protein  47.19 
 
 
566 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  42.29 
 
 
972 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5553  Chitinase  35.4 
 
 
709 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.122706 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  36.14 
 
 
1204 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  37.87 
 
 
868 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  37.87 
 
 
868 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  37.06 
 
 
868 aa  97.8  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1943  chitinase  40 
 
 
464 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0117537  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  34.32 
 
 
867 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  34.12 
 
 
868 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  30.95 
 
 
296 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  31.12 
 
 
868 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  34.12 
 
 
868 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3140  chitinase  27.43 
 
 
284 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  30.77 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  30.77 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  30.77 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  33.96 
 
 
863 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  30.59 
 
 
869 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  27.38 
 
 
353 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  31.1 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1920  Chitinase  29.34 
 
 
359 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  28.93 
 
 
295 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  32.98 
 
 
855 aa  73.2  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  27.05 
 
 
245 aa  72.8  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  33.33 
 
 
848 aa  70.5  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  27.27 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  35.56 
 
 
699 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7196  Chitinase  27.35 
 
 
367 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4654  glycoside hydrolase family 19  27.27 
 
 
384 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.274267  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 
727 aa  63.9  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  39.22 
 
 
833 aa  61.6  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  28.64 
 
 
985 aa  60.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  52.63 
 
 
391 aa  60.1  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  67.65 
 
 
378 aa  58.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  31.72 
 
 
600 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  52.63 
 
 
390 aa  58.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  45.76 
 
 
565 aa  54.3  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  46 
 
 
388 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  46 
 
 
389 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  40 
 
 
1011 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  36.19 
 
 
1393 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  36.19 
 
 
1393 aa  50.4  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  33.33 
 
 
848 aa  49.7  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  32.92 
 
 
792 aa  49.7  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  29.09 
 
 
765 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  41.38 
 
 
729 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  41.38 
 
 
729 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  38.82 
 
 
3278 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  32.41 
 
 
611 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  36.04 
 
 
1022 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0044  hypothetical protein  38.14 
 
 
568 aa  48.5  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000379088  hitchhiker  0.00388829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  38.71 
 
 
1265 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  35.29 
 
 
3197 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  32 
 
 
634 aa  47.8  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  33.93 
 
 
1441 aa  47.4  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4398  PKD domain containing protein  39.42 
 
 
1142 aa  47.4  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0061097  normal  0.588694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  48.72 
 
 
473 aa  46.2  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  36.05 
 
 
656 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  38.1 
 
 
861 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  38.32 
 
 
635 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  48.78 
 
 
481 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  48.78 
 
 
481 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2959  protease domain-containing protein  41.03 
 
 
1298 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.161686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1542  protease-associated PA domain protein  41.03 
 
 
1298 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2816  protease domain-containing protein  41.03 
 
 
1298 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.738271  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  32.94 
 
 
950 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2834  protease domain-containing protein  41.03 
 
 
1298 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  26.79 
 
 
816 aa  45.1  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  39.74 
 
 
1258 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  36.63 
 
 
460 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.5 
 
 
481 aa  44.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  50 
 
 
481 aa  44.3  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.34 
 
 
481 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34 
 
 
1212 aa  43.5  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>