52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0180 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0176  2-keto-3-deoxygluconate permease  99.11 
 
 
337 aa  646  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145477  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0177  2-keto-3-deoxygluconate permease  99.7 
 
 
337 aa  648  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  5.64113e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0180  2-keto-3-deoxygluconate permease  100 
 
 
337 aa  650  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  1.29613e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0184  2-keto-3-deoxygluconate permease  99.68 
 
 
317 aa  601  1e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0565535  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0193  2-keto-3-deoxygluconate permease  99.68 
 
 
317 aa  601  1e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00793033  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0811  2-keto-3-deoxygluconate permease  58.39 
 
 
317 aa  327  1e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0694  2-keto-3-deoxygluconate permease  58.39 
 
 
317 aa  327  1e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0708  2-keto-3-deoxygluconate permease  58.39 
 
 
317 aa  328  1e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.155068  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0754  2-keto-3-deoxygluconate permease  58.06 
 
 
317 aa  326  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0768  2-keto-3-deoxygluconate permease  57.42 
 
 
317 aa  322  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5835  2-keto-3-deoxygluconate permease  49.69 
 
 
332 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0835449  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3567  2-keto-3-deoxygluconate permease  49.35 
 
 
324 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  2.41056e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0593  2-keto-3-deoxygluconate permease  48.06 
 
 
313 aa  251  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2622  2-keto-3-deoxygluconate permease  43.48 
 
 
347 aa  245  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.424244  hitchhiker  0.00252922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4428  2-keto-3-deoxygluconate permease  48.91 
 
 
346 aa  243  4e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0129  2-keto-3-deoxygluconate permease  44.27 
 
 
323 aa  236  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6105  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.32 
 
 
326 aa  235  1e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561422  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2588  2-keto-3-deoxygluconate permease  50.63 
 
 
327 aa  234  2e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.978377 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1736  2-keto-3-deoxygluconate permease  47.96 
 
 
342 aa  233  4e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0242221 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0924  2-keto-3-deoxygluconate permease  41.35 
 
 
332 aa  233  4e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000214762  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4645  2-keto-3-deoxygluconate permease  48.42 
 
 
334 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0828937  normal  0.0842003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4302  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.03 
 
 
329 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.405227  hitchhiker  0.00796393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03744  hypothetical protein  45.03 
 
 
327 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.429864  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4140  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.03 
 
 
327 aa  223  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4075  2-keto-3-deoxygluconate transporter  45.03 
 
 
327 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03795  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.03 
 
 
327 aa  223  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.364325  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4108  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.03 
 
 
327 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.360818  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5364  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.03 
 
 
327 aa  223  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.176642  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4443  2-keto-3-deoxygluconate permease  44.72 
 
 
327 aa  223  5e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0749  2-keto-3-deoxygluconate permease  37.7 
 
 
341 aa  221  2e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1707  2-keto-3-deoxygluconate permease  44.2 
 
 
335 aa  219  7e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0340212  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0985  2-keto-3-deoxygluconate permease  36.86 
 
 
341 aa  217  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0314  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.82 
 
 
331 aa  216  6e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.010064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3914  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.37 
 
 
318 aa  215  1e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.560083  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2205  2-keto-3-deoxygluconate permease  42.72 
 
 
341 aa  214  2e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4329  2-keto-3-deoxygluconate permease  40.88 
 
 
339 aa  213  3e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.16914 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4106  2-keto-3-deoxygluconate permease  45.05 
 
 
318 aa  213  5e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1740  2-keto-3-deoxygluconate permease  43.13 
 
 
337 aa  213  5e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5010  2-keto-3-deoxygluconate permease  40.88 
 
 
339 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5850  2-keto-3-deoxygluconate permease  40.88 
 
 
339 aa  212  7e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0284  2-keto-3-deoxygluconate permease  43.17 
 
 
331 aa  210  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  1.89316e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2152  2-keto-3-deoxygluconate permease  46.69 
 
 
319 aa  209  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.36427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3877  2-keto-3-deoxygluconate permease  40.31 
 
 
355 aa  209  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5761  2-keto-3-deoxygluconate permease  39.94 
 
 
338 aa  200  2e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2152  2-keto-3-deoxygluconate permease  38.99 
 
 
335 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1590  2-keto-3-deoxygluconate permease  36.77 
 
 
312 aa  194  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4389  2-keto-3-deoxygluconate permease  39.25 
 
 
303 aa  185  1e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1447  2-keto-3-deoxygluconate permease  41.21 
 
 
340 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2025  2-keto-3-deoxygluconate permease  41.21 
 
 
340 aa  172  5e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343811  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03754  2-keto-3-deoxygluconate permease  40.43 
 
 
283 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1025  2-keto-3-deoxygluconate permease  44.44 
 
 
336 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.100625 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0449  2-keto-3-deoxygluconate permease  42.37 
 
 
331 aa  168  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>