184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0106 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0101  Dna-J like membrane chaperone protein  100 
 
 
270 aa  560  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000130204  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0099  Dna-J like membrane chaperone protein  100 
 
 
270 aa  560  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  1.96602e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0106  Dna-J like membrane chaperone protein  100 
 
 
270 aa  560  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  5.40131e-07  normal  0.839324 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0104  Dna-J like membrane chaperone protein  100 
 
 
270 aa  560  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.41328e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0100  Dna-J like membrane chaperone protein  100 
 
 
270 aa  560  1e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  3.27368e-05  normal  0.0501049 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3544  heat shock protein DnaJ domain protein  92.25 
 
 
271 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  3.15628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0061  Dna-J like membrane chaperone protein  91.88 
 
 
271 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.04638e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  91.88 
 
 
271 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  2.6636e-08  normal  0.688624 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0061  Dna-J like membrane chaperone protein  92.25 
 
 
271 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  1.28159e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3600  Dna-J like membrane chaperone protein  92.25 
 
 
271 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.71898e-08  hitchhiker  3.23028e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0059  Dna-J like membrane chaperone protein  91.88 
 
 
271 aa  497  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  6.13097e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0049  Dna-J like membrane chaperone protein  91.51 
 
 
271 aa  495  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  4.77601e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00058  hypothetical protein  91.88 
 
 
271 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.67853e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00059  Dna-J like membrane chaperone protein  91.88 
 
 
271 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.86823e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0604  Dna-J like membrane chaperone protein  87.18 
 
 
273 aa  471  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  3.56276e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0728  Dna-J like membrane chaperone protein  76.19 
 
 
273 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  3.04706e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3569  Dna-J like membrane chaperone protein  67.51 
 
 
277 aa  371  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  7.71944e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0768  Dna-J like membrane chaperone protein  67.51 
 
 
277 aa  371  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  1.28794e-09  normal  0.0201885 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3440  Dna-J like membrane chaperone protein  67.51 
 
 
277 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.44251e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3631  Dna-J like membrane chaperone protein  58.04 
 
 
291 aa  343  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.181642  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3828  Dna-J like membrane chaperone protein  57.93 
 
 
296 aa  328  8e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0567  Dna-J like membrane chaperone protein  50.48 
 
 
318 aa  300  2e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0606  Dna-J like membrane chaperone protein  52.17 
 
 
305 aa  287  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21113  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001661  DnaJ-like protein DjlA  51.58 
 
 
284 aa  268  9e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1291  Dna-J like membrane chaperone protein  50.34 
 
 
289 aa  259  4e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  6.51268e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0372  Dna-J like membrane chaperone protein  50 
 
 
283 aa  258  8e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4522  Dna-J like membrane chaperone protein  48 
 
 
275 aa  254  1e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00812  Dna-J like membrane chaperone protein  50.52 
 
 
286 aa  253  3e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1020  Dna-J like membrane chaperone protein  47.78 
 
 
259 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.325317  normal  0.0319615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1085  Dna-J like membrane chaperone protein  46.52 
 
 
262 aa  249  4e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367802  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0911  Dna-J like membrane chaperone protein  47.08 
 
 
262 aa  244  7e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0269993  normal  0.373919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3109  Dna-J like membrane chaperone protein  47.08 
 
 
262 aa  243  2e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0792555  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03410  Dna-J like membrane chaperone protein  46.71 
 
 
288 aa  243  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0995  Dna-J like membrane chaperone protein  45.42 
 
 
262 aa  242  4e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.555246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3633  Dna-J like membrane chaperone protein  47.08 
 
 
262 aa  242  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3203  Dna-J like membrane chaperone protein  47.08 
 
 
262 aa  242  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.967283 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0970  Dna-J like membrane chaperone protein  47.41 
 
 
259 aa  241  8e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0207673  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2813  Dna-J like membrane chaperone protein  50 
 
 
256 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0603068  normal  0.639961 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0885  Dna-J like membrane chaperone protein  46.3 
 
 
258 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00720639  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0983  Dna-J like membrane chaperone protein  46.52 
 
 
262 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.193447  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3306  Dna-J like membrane chaperone protein  46.52 
 
 
262 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.044478  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1052  Dna-J like membrane chaperone protein  46.52 
 
 
262 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0982922  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0868  Dna-J like membrane chaperone protein  47.04 
 
 
259 aa  236  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2882  Dna-J like membrane chaperone protein  46.67 
 
 
259 aa  228  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.50671e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2865  Dna-J like membrane chaperone protein  47.71 
 
 
284 aa  228  1e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.87957e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3073  Dna-J like membrane chaperone protein  48.52 
 
 
257 aa  226  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.70305  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1051  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  46.21 
 
 
268 aa  223  3e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3415  Dna-J like membrane chaperone protein  42.05 
 
 
284 aa  221  1e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.258634  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0020  Dna-J like membrane chaperone protein  45.37 
 
 
276 aa  193  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0104  Dna-J like membrane chaperone protein  41.07 
 
 
271 aa  189  6e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000467525  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2075  Dna-J like membrane chaperone protein  41.58 
 
 
270 aa  187  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  5.70933e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2989  Dna-J like membrane chaperone protein  39.46 
 
 
264 aa  162  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1055  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.61 
 
 
267 aa  162  8e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.887e-05  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2106  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  36.6 
 
 
260 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1907  Dna-J like membrane chaperone protein  36.7 
 
 
271 aa  158  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0100  heat shock protein DnaJ-like protein  35.88 
 
 
257 aa  155  8e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2289  Dna-J like membrane chaperone protein  33.79 
 
 
296 aa  152  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2262  Dna-J like membrane chaperone protein  33.1 
 
 
296 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  33.07 
 
 
257 aa  139  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0910  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.47 
 
 
268 aa  116  4e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.2781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4621  heat shock protein DnaJ, N-terminal  30.55 
 
 
255 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418995  normal  0.628986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0557  DnaJ-like protein DjlA, putative  30.22 
 
 
255 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4007  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  31.98 
 
 
253 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.55 
 
 
255 aa  95.1  9e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.524438  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0438  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  30.55 
 
 
255 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1747  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  26.07 
 
 
251 aa  95.5  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  1.51297e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0407  heat shock protein DnaJ domain protein  30.55 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4795  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.39 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424531  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1837  DnaJ domain-containing protein  30.09 
 
 
264 aa  92.8  5e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5129  heat shock protein DnaJ-like  27.97 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.583171  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0742  hypothetical protein  31.92 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0971129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0880  heat shock protein DnaJ domain protein  24.81 
 
 
241 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161205  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0905  protein of unknown function DUF1332  24.81 
 
 
241 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0299728  normal  0.285713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0942  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.81 
 
 
241 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0233536  normal  0.0990554 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0397  heat shock protein DnaJ-like  37.86 
 
 
250 aa  83.2  4e-15  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3513  Fis family transcriptional regulator  29.44 
 
 
251 aa  82.4  6e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46770  heat shock protein DnaJ-like protein  28.77 
 
 
253 aa  82.4  7e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0668  DnaJ domain-containing protein  25.45 
 
 
265 aa  81.6  1e-14  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.165012  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2868  protein of unknown function DUF1332  24.34 
 
 
235 aa  80.5  3e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.96346 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  25.57 
 
 
257 aa  78.6  9e-14  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2408  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.93 
 
 
236 aa  76.6  3e-13  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.553614  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07800  hypothetical protein  29.11 
 
 
252 aa  77  3e-13  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0234725 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1630  silent information regulator protein Sir2  24.06 
 
 
244 aa  73.9  3e-12  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.071584  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2252  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.85 
 
 
266 aa  72  1e-11  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4909  protein of unknown function DUF1332  24.72 
 
 
245 aa  70.5  2e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.296192  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2608  heat shock protein DnaJ domain protein  23.81 
 
 
235 aa  70.5  3e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.221974  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2908  molecular chaperone DnaJ family  23.6 
 
 
245 aa  67.4  2e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0546  DnaJ-like protein  24.04 
 
 
256 aa  67  3e-10  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2105  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.07 
 
 
235 aa  67  3e-10  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.296971 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1860  heat shock protein DnaJ-like  23.11 
 
 
235 aa  67  3e-10  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.25 
 
 
227 aa  66.2  5e-10  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32724  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1034  DnaJ domain-containing protein  22.6 
 
 
212 aa  63.9  2e-09  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0627693  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0977  DnaJ domain-containing protein  22.6 
 
 
212 aa  64.7  2e-09  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  22.09 
 
 
246 aa  64.7  2e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2092  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.19 
 
 
233 aa  64.3  2e-09  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.764372  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4375  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  24.44 
 
 
240 aa  63.9  3e-09  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.283206  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0827  DnaJ domain-containing protein  23.18 
 
 
212 aa  62  1e-08  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2884  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  27.92 
 
 
256 aa  61.6  1e-08  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842041  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1731  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  25.66 
 
 
236 aa  60.5  3e-08  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0785  putative heat shock protein DnaJ  21.64 
 
 
227 aa  60.5  3e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>