More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0089 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  86.33 
 
 
443 aa  764  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  70.9 
 
 
452 aa  636  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  99.79 
 
 
468 aa  939  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  86.33 
 
 
443 aa  764  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  86.1 
 
 
443 aa  761  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  86.1 
 
 
443 aa  763  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  86.33 
 
 
443 aa  764  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  99.79 
 
 
468 aa  938  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  99.79 
 
 
468 aa  937  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  100 
 
 
468 aa  940  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  99.79 
 
 
468 aa  939  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  68.86 
 
 
445 aa  640  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  86.33 
 
 
443 aa  764  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  86.33 
 
 
443 aa  764  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  86.56 
 
 
443 aa  766  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  67.58 
 
 
438 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  60.95 
 
 
458 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  49.77 
 
 
480 aa  473  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  43.64 
 
 
464 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  43.35 
 
 
446 aa  358  1e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  38.83 
 
 
442 aa  301  1e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  37.99 
 
 
443 aa  284  3e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  37.78 
 
 
442 aa  275  1e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  36.94 
 
 
457 aa  273  4e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  35.09 
 
 
460 aa  273  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  36.2 
 
 
453 aa  266  6e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  38.37 
 
 
442 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  35.6 
 
 
452 aa  253  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  35.44 
 
 
452 aa  252  9e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  35.6 
 
 
452 aa  252  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  34.12 
 
 
439 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  34.85 
 
 
445 aa  229  7e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  34.85 
 
 
445 aa  229  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.89575e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  34.85 
 
 
445 aa  229  7e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  34.85 
 
 
445 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  34.85 
 
 
445 aa  229  7e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 
469 aa  229  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  34.85 
 
 
445 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  34.62 
 
 
445 aa  228  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  33.72 
 
 
457 aa  214  4e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0278  major facilitator transporter  33.33 
 
 
441 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.672912  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3468  General substrate transporter  30.94 
 
 
468 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  30.02 
 
 
427 aa  179  7e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1884  D-xylose proton-symporter  27.48 
 
 
447 aa  179  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.326848  hitchhiker  1.4456e-12 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  27.97 
 
 
434 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 
465 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  33.01 
 
 
465 aa  166  9e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  33.02 
 
 
458 aa  165  2e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  33.02 
 
 
458 aa  165  2e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.28 
 
 
476 aa  157  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  29.1 
 
 
423 aa  156  9e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.35 
 
 
463 aa  155  2e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  1.99551e-15 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  27.33 
 
 
471 aa  153  6e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  30.84 
 
 
477 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  26.52 
 
 
469 aa  149  1e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  27.42 
 
 
441 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  27.42 
 
 
443 aa  145  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  24.03 
 
 
454 aa  143  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  25.51 
 
 
459 aa  143  8e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  28.12 
 
 
471 aa  137  3e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  7.49242e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  25.22 
 
 
471 aa  137  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  24.27 
 
 
499 aa  137  5e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  24.46 
 
 
474 aa  136  7e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  29.21 
 
 
446 aa  135  1e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  27.02 
 
 
493 aa  135  2e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 
477 aa  134  4e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  27.31 
 
 
508 aa  132  1e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25.35 
 
 
457 aa  132  2e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  24.89 
 
 
467 aa  132  2e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  27.89 
 
 
465 aa  132  2e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  26.9 
 
 
457 aa  129  2e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  26.73 
 
 
442 aa  128  2e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.11 
 
 
456 aa  128  2e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
451 aa  128  2e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.78504e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  26.73 
 
 
442 aa  129  2e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  27.65 
 
 
441 aa  127  4e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  25.79 
 
 
458 aa  127  5e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  25.66 
 
 
459 aa  126  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  25.4 
 
 
463 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  28.78 
 
 
472 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.11 
 
 
474 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  27.15 
 
 
442 aa  124  3e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6752  major facilitator transporter  27.63 
 
 
475 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0303663 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6518  major facilitator transporter  27.63 
 
 
475 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3658  aromatic compound MFS transporter, putative  26.13 
 
 
450 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.691847  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2072  major facilitator transporter  26.13 
 
 
450 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6341  major facilitator transporter  27.38 
 
 
475 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  24.46 
 
 
460 aa  122  1e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  25.22 
 
 
474 aa  122  2e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  25 
 
 
474 aa  121  2e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.81 
 
 
472 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  24.89 
 
 
472 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  23.73 
 
 
485 aa  120  4e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  25.95 
 
 
434 aa  120  4e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 
435 aa  120  4e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  27.33 
 
 
448 aa  120  4e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25.71 
 
 
455 aa  120  5e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.12 
 
 
455 aa  120  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 
451 aa  120  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.15751e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  25.22 
 
 
474 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>