More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0077 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  100 
 
 		 198 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  100 
 
 		 198 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  100 
 
 		 198 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  99.49 
 
 		 198 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  99.49 
 
 		 198 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  85.64 
 
 		 196 aa  353  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  86.15 
 
 		 196 aa  353  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  86.15 
 
 		 196 aa  353  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  85.64 
 
 		 196 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  85.13 
 
 		 196 aa  349  1e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  85.64 
 
 		 196 aa  349  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  85.64 
 
 		 196 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  85.64 
 
 		 196 aa  349  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  72.22 
 
 		 222 aa  303  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  72.45 
 
 		 196 aa  298  3e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.56 
 
 		 199 aa  254  5e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.49 
 
 		 199 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  60.1 
 
 		 208 aa  246  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.18 
 
 		 198 aa  246  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.49 
 
 		 199 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  56.12 
 
 		 196 aa  241  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  60.31 
 
 		 205 aa  241  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  56.92 
 
 		 199 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  55.61 
 
 		 196 aa  239  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.76 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  56.12 
 
 		 196 aa  239  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  56.12 
 
 		 196 aa  239  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  55.9 
 
 		 195 aa  238  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.2 
 
 		 200 aa  234  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  57.75 
 
 		 200 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  53.06 
 
 		 202 aa  214  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  49.75 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  52.46 
 
 		 196 aa  207  8e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  47.25 
 
 		 204 aa  191  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  43.32 
 
 		 205 aa  176  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  48.07 
 
 		 176 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  50 
 
 		 171 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  50 
 
 		 175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  39.63 
 
 		 173 aa  125  6e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  41.03 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  39.43 
 
 		 172 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  38.95 
 
 		 175 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  35.93 
 
 		 175 aa  121  7e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  38.37 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  37.21 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  44.51 
 
 		 171 aa  117  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  37.04 
 
 		 173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  40.85 
 
 		 183 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  40.12 
 
 		 173 aa  115  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  33.91 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  36.02 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  38.55 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.99 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4821  hexapaptide repeat-containing transferase  37.06 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.849886  normal  0.480457 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.21 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  34.71 
 
 		 174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  34.48 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  36.48 
 
 		 174 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  36.6 
 
 		 170 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  38.32 
 
 		 172 aa  111  8.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  36.25 
 
 		 168 aa  110  9e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  34.59 
 
 		 175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  35.84 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  36.55 
 
 		 157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  33.33 
 
 		 174 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  35.71 
 
 		 234 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  39.05 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  35.12 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  35.12 
 
 		 172 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  36.02 
 
 		 174 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  36.02 
 
 		 174 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2121  hexapaptide repeat-containing transferase  35.4 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105256 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2058  transferase hexapeptide repeat  35.09 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.698807 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  38.26 
 
 		 174 aa  107  9.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2395  hexapaptide repeat-containing transferase  38.46 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  33.33 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5409  carbonic anhydrase  35.4 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  35.84 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  36.97 
 
 		 180 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0363  putative transferase  36.02 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.141387  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  36.02 
 
 		 174 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 		 171 aa  106  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0091  hexapaptide repeat-containing transferase  37.28 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  36.05 
 
 		 174 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0066  hypothetical protein  37.28 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0205  hexapaptide repeat-containing transferase  38.01 
 
 		 176 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0113  transferase  37.87 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164534  normal  0.0870058 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0621  carbonic anhydrase  35.37 
 
 		 163 aa  106  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  38.04 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  34.69 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00780  hypothetical protein  36.69 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  38.04 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1898  hexapeptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 		 174 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  38.65 
 
 		 171 aa  105  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  35.17 
 
 		 154 aa  104  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  32.56 
 
 		 174 aa  104  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 		 174 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  34.78 
 
 		 174 aa  104  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  37.28 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>