13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0076 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0072    98.99 
 
 		 396 bp  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0072    98.99 
 
 		 396 bp  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.606149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0076    100 
 
 		 396 bp  785    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.638132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0075    98.99 
 
 		 396 bp  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0074    98.74 
 
 		 396 bp  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00038  DNA-binding transcriptional activator  85.71 
 
 		 396 bp  60  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3565  DNA-binding transcriptional activator CaiF  85.71 
 
 		 396 bp  60  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0038  DNA-binding transcriptional activator CaiF  85.71 
 
 		 396 bp  60  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0036  DNA-binding transcriptional activator CaiF  85.71 
 
 		 396 bp  60  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3621  DNA-binding transcriptional activator CaiF  85.71 
 
 		 396 bp  60  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.923906  normal  0.286995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0035  DNA-binding transcriptional activator CaiF  85.71 
 
 		 396 bp  60  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0038  DNA-binding transcriptional activator CaiF  85.71 
 
 		 396 bp  60  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00037  hypothetical protein  85.71 
 
 		 396 bp  60  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>