274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0041 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  99.49 
 
 
396 aa  837    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.499783  hitchhiker  0.00726967 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0039  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  78.63 
 
 
398 aa  673    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  99.24 
 
 
395 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0040  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  99.49 
 
 
395 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0041  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  100 
 
 
396 aa  840    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0795005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.39 
 
 
431 aa  449  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.79 
 
 
447 aa  451  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.39 
 
 
431 aa  450  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.14 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  51.14 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  54.38 
 
 
381 aa  440  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2436  Radical SAM domain protein  48.72 
 
 
407 aa  395  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0763  Radical SAM domain protein  48.72 
 
 
407 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  46.08 
 
 
411 aa  385  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  46.33 
 
 
411 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  46.33 
 
 
411 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5236  arylsulfatase-activating protein AslB  46.08 
 
 
411 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000331519  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4314  arylsulfatase-activating protein AslB  46.08 
 
 
411 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000133586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  46.68 
 
 
438 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03675  predicted regulator of arylsulfatase activity  45.57 
 
 
411 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00136934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03624  hypothetical protein  45.57 
 
 
411 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00100971  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4120  arylsulfatase-activating protein AslB  45.82 
 
 
411 aa  378  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000574144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0985  radical SAM domain-containing protein  46.53 
 
 
408 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0932  putative sulfatase regulator  46.53 
 
 
408 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4165  arylsulfatase-activating protein AslB  45.57 
 
 
411 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000104917  normal  0.969874 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3367  putative sulfatase regulator  45.9 
 
 
408 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.917343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  45.57 
 
 
405 aa  371  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0418  radical SAM domain-containing protein  44.95 
 
 
431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  45.76 
 
 
397 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1381  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.9 
 
 
398 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.238344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1414  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.9 
 
 
398 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.634455  normal  0.453788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1398  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.9 
 
 
398 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00310802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2069  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.9 
 
 
398 aa  358  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000256382 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  44.9 
 
 
398 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0563  radical SAM domain-containing protein  43.11 
 
 
435 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  42.24 
 
 
414 aa  346  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3390  radical SAM domain-containing protein  43.37 
 
 
435 aa  345  6e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.106597 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3560  radical SAM domain-containing protein  42.75 
 
 
435 aa  345  7e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.291344 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  43.67 
 
 
391 aa  342  7e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  43.67 
 
 
391 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  43.41 
 
 
391 aa  341  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000310  arylsulfatase regulator  41.5 
 
 
433 aa  339  4e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1084  Radical SAM domain protein  41.06 
 
 
444 aa  335  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003598  arylsulfatase regulator  41.07 
 
 
440 aa  331  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.527576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  40.1 
 
 
414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  42.05 
 
 
428 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  43.32 
 
 
385 aa  326  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  43.05 
 
 
385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  42.93 
 
 
385 aa  326  5e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  43.05 
 
 
385 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  43.05 
 
 
385 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  43.05 
 
 
385 aa  325  1e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  43.05 
 
 
385 aa  325  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  43.05 
 
 
385 aa  325  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1732  radical SAM domain-containing protein  42.97 
 
 
393 aa  315  8e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0603581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3987  arylsulfatase regulator (Fe-S oxidoreductase)  39.16 
 
 
383 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  39.74 
 
 
410 aa  279  7e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  39.74 
 
 
410 aa  279  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  36.19 
 
 
402 aa  262  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  34.85 
 
 
394 aa  229  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  34.85 
 
 
394 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3365  arylsulfatase-activating protein AtsB  34.85 
 
 
394 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.812959 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0912  Radical SAM domain protein  35.04 
 
 
367 aa  227  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0100915  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  31.93 
 
 
369 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0376  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 
368 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  34.32 
 
 
394 aa  222  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  32.62 
 
 
370 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1008  Radical SAM domain protein  28.61 
 
 
370 aa  186  7e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0045  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 
374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.120726  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  34.83 
 
 
280 aa  164  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1761  radical SAM domain protein  35.86 
 
 
214 aa  143  5e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2479  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.657358  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3003  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
436 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00234995  hitchhiker  0.0000159012 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2577  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2994  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 
366 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00145585  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4191  hypothetical protein  30.7 
 
 
176 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4133  hypothetical protein  30.7 
 
 
176 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4012  f165  30.7 
 
 
176 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4084  hypothetical protein  30.7 
 
 
176 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2595  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 
397 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0848982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4029  f165  29.82 
 
 
176 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2137  Radical SAM domain protein  24.26 
 
 
401 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344759  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2075  putative arylsulfatase regulatory protein  24.93 
 
 
399 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  23.56 
 
 
380 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  24.67 
 
 
460 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3282  Radical SAM domain protein  23.39 
 
 
393 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04221  putative arylsulfatase regulatory protein  31.05 
 
 
391 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3638  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 
403 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.775121  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3642  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 
402 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4972  putative arylsulfatase regulatory protein  32.28 
 
 
370 aa  99.8  8e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0901  Radical SAM domain protein  23.76 
 
 
414 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.912701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 
800 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0597  putative arylsulfatase regulatory protein  23.32 
 
 
401 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 
439 aa  91.7  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5726  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 
414 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2646  radical SAM family protein  24.02 
 
 
723 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
378 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1525  protein tyrosine phosphatase  22.49 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.469946  normal  0.164235 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0512  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 
815 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.663169  normal  0.326238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>