281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0029 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0029  fimbrial chaperone  100 
 
 
245 aa  507  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8309  normal  0.103429 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0029  fimbrial chaperone  97.94 
 
 
243 aa  494  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.91937  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0030  fimbrial chaperone  97.63 
 
 
211 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.8197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0030  fimbrial chaperone  97.16 
 
 
211 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.292301  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0028  fimbrial chaperone  96.68 
 
 
211 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0916506  normal  0.10634 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2175  putativi pili assembly chaperone  44.95 
 
 
229 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.741204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1059  putativi pili assembly chaperone  41.8 
 
 
245 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000349289  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00948  predicted periplasmic pilini chaperone  42.61 
 
 
236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00512688  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2699  Pili assembly chaperone, N-terminal  42.61 
 
 
236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000623101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00955  hypothetical protein  42.61 
 
 
236 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00537151  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1053  putativi pili assembly chaperone  41.39 
 
 
245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000246739  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2652  putativi pili assembly chaperone  42.17 
 
 
236 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000294251  hitchhiker  0.00357409 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  35.56 
 
 
225 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  38.81 
 
 
226 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  37.02 
 
 
227 aa  131  7.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  36.54 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  37.5 
 
 
227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  36.12 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5822  chaperone protein FimC  35.53 
 
 
241 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1048  periplasmic pilus chaperone family protein  33.19 
 
 
233 aa  129  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04147  hypothetical protein  35.53 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04185  chaperone, periplasmic  35.53 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  36.54 
 
 
227 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4542  chaperone protein FimC  35.53 
 
 
241 aa  128  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0616806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0989  pili assembly chaperone  35.56 
 
 
230 aa  128  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  36.06 
 
 
227 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0573  chaperone protein FimC  35.04 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0096123  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3681  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.53 
 
 
241 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00481  pilin chaperone, periplasmic  35.04 
 
 
230 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3082  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.04 
 
 
230 aa  126  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.219749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4843  chaperone protein FimC  37.16 
 
 
216 aa  126  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3091  pili assembly chaperone  35.04 
 
 
230 aa  126  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.554326  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00486  hypothetical protein  35.04 
 
 
230 aa  126  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00943  predicted periplasmic pilin chaperone  32.75 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.198614  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00950  hypothetical protein  32.75 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0576  chaperone protein FimC-like protein  35.04 
 
 
230 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.128277  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2704  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.75 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0315447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1101  periplasmic pilus chaperone family protein  33.48 
 
 
224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0720746  normal  0.540413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2180  periplasmic pilus chaperone family protein  33.48 
 
 
224 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.774785 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2657  pili assembly chaperone  32.75 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1054  periplasmic pilus chaperone family protein  32.75 
 
 
233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0632  chaperone protein FimC homolog  35.62 
 
 
230 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.29537  normal  0.474427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4845  pili assembly chaperone  33.79 
 
 
227 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5007  pili assembly chaperone  33.79 
 
 
227 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.42605  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  36.84 
 
 
251 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5004  pili assembly chaperone  33.79 
 
 
227 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4952  pili assembly chaperone  33.79 
 
 
227 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  34.39 
 
 
234 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  38.22 
 
 
246 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0606  chaperone protein FimC-like protein  34.62 
 
 
230 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000590749  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4918  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
227 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.458934  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.21 
 
 
265 aa  122  8e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  35.16 
 
 
250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1665  periplasmic pilus chaperone family protein  33.76 
 
 
236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.656199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0655  chaperone protein FimC  35.19 
 
 
237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2119  periplasmic pilus chaperone family protein  36.19 
 
 
236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.423034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0594  chaperone protein FimC  34.72 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.152719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0591  chaperone protein FimC  34.72 
 
 
230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00455551  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0590  chaperone protein FimC  34.72 
 
 
230 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0318933 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0598  chaperone protein FimC  34.72 
 
 
230 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.417884  normal  0.056011 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  37.12 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  28.96 
 
 
248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.78 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  33.99 
 
 
227 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  33.33 
 
 
241 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  32.86 
 
 
228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  36.32 
 
 
243 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  32.14 
 
 
236 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  32.77 
 
 
245 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  32.73 
 
 
237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  31.4 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2282  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.48 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  32.74 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  32.74 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  32.74 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  32.74 
 
 
232 aa  112  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  31.8 
 
 
245 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  33.94 
 
 
234 aa  111  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  33.05 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  37.1 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  31.96 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.64 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2236  pili assembly chaperone  29.36 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.918746  normal  0.0175555 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  33.63 
 
 
246 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  33.63 
 
 
246 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  33.63 
 
 
246 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  33.63 
 
 
246 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0024  chaperone protein FimC  34.88 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0267159  normal  0.211748 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0024  chaperone protein FimC  34.88 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.117286  normal  0.0585411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0025  chaperone protein FimC  34.88 
 
 
275 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.263689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0025  chaperone protein FimC  34.88 
 
 
275 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.37249  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  32.88 
 
 
253 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0023  chaperone protein FimC  33.96 
 
 
275 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.20078 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  31.16 
 
 
231 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  31.16 
 
 
231 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  31.16 
 
 
231 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0337  pilus assembly chaperone  30.24 
 
 
245 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0839363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  34.96 
 
 
246 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11090  chaperone CupB4  35.6 
 
 
246 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0085  pili assembly chaperone  28.57 
 
 
234 aa  105  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>