27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0010 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0010  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0202252  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0010  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0398298  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0010  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.503351  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0010  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.242343  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0010  hypothetical protein  99.58 
 
 
237 aa  482  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3585  protein of unknown function UPF0174  86.92 
 
 
237 aa  377  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00011  hypothetical protein  86.92 
 
 
237 aa  377  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0012  hypothetical protein  86.92 
 
 
237 aa  378  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0012  hypothetical protein  86.92 
 
 
237 aa  377  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.242726  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0011  hypothetical protein  86.92 
 
 
237 aa  377  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00011  hypothetical protein  86.92 
 
 
237 aa  377  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0010  hypothetical protein  87.34 
 
 
237 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.642715  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0011  hypothetical protein  86.92 
 
 
237 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3644  hypothetical protein  86.5 
 
 
237 aa  372  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0936  hypothetical protein  32.92 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.792793  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003217  hypothetical protein  31.95 
 
 
251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03360  hypothetical protein  31.96 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000516345  unclonable  5.57606e-22 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0937  hypothetical protein  28.69 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.291347  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1808  hypothetical protein  26.34 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.210053 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03370  hypothetical protein  27.35 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000262084  unclonable  6.16772e-22 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4801  hypothetical protein  29.83 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.472026  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3728  hypothetical protein  28.74 
 
 
475 aa  59.3  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3598  hypothetical protein  27.06 
 
 
280 aa  52.8  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.451197 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3350  hypothetical protein  25.86 
 
 
280 aa  44.7  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3175  hypothetical protein  27.66 
 
 
277 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.207155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1284  hypothetical protein  26.03 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1313  hypothetical protein  26.03 
 
 
276 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>