More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4967 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  100 
 
 
225 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  91.11 
 
 
225 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  91.11 
 
 
225 aa  434  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  91.11 
 
 
225 aa  434  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  91.11 
 
 
225 aa  434  1e-121  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  90.67 
 
 
225 aa  431  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  91.11 
 
 
225 aa  432  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  91.11 
 
 
225 aa  432  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  90.22 
 
 
225 aa  429  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  90.22 
 
 
225 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  84 
 
 
225 aa  404  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  60.36 
 
 
224 aa  293  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  61.36 
 
 
238 aa  289  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  62.16 
 
 
224 aa  288  4e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  61.26 
 
 
227 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  60 
 
 
234 aa  286  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  60.36 
 
 
238 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  60.36 
 
 
226 aa  285  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  60.36 
 
 
238 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  60.81 
 
 
245 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  59.64 
 
 
224 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  60.81 
 
 
245 aa  282  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  59.91 
 
 
224 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  60.36 
 
 
245 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  58.93 
 
 
225 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  56.05 
 
 
228 aa  270  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  57.99 
 
 
224 aa  270  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  57.21 
 
 
224 aa  269  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  56.31 
 
 
229 aa  268  5e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  56.31 
 
 
230 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  55.66 
 
 
233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  56.76 
 
 
224 aa  263  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  56.76 
 
 
224 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  56.76 
 
 
224 aa  263  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3427  nucleotidase  54.5 
 
 
226 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0757  HAD family hydrolase  34.65 
 
 
230 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000135957  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0743  HAD family hydrolase  34.65 
 
 
230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00097331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.24 
 
 
236 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  35.24 
 
 
236 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  35.24 
 
 
236 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  35.24 
 
 
236 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  35.24 
 
 
236 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.24 
 
 
236 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3362  HAD superfamily hydrolase  34.8 
 
 
236 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0552975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1884  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  35.24 
 
 
236 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  34.36 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3346  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.92 
 
 
236 aa  138  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  34.47 
 
 
229 aa  133  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5588  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.87 
 
 
231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5532  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.87 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5420  HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  30.84 
 
 
231 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5537  HAD superfamily hydrolase  29.57 
 
 
231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0740  HAD superfamily hydrolase  29.26 
 
 
228 aa  119  3e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.96225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5202  HAD family hydrolase  30.4 
 
 
231 aa  118  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5503  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.67 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5260  HAD superfamily hydrolase  30.67 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5088  HAD superfamily hydrolase  30.22 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5105  HAD superfamily hydrolase  30.22 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5658  HAD superfamily hydrolase  30.67 
 
 
231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  29.69 
 
 
235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1259  HAD family hydrolase  29.22 
 
 
231 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.380734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1234  HAD family hydrolase  29.22 
 
 
231 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
234 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3817  HAD family hydrolase  28.99 
 
 
242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000009679  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0446  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.47 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3750  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.22 
 
 
231 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.66 
 
 
231 aa  106  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.3 
 
 
229 aa  106  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.44 
 
 
229 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  30.22 
 
 
228 aa  105  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  28.82 
 
 
232 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  30.04 
 
 
231 aa  103  2e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.34 
 
 
225 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0667  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.24 
 
 
232 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1070  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.8 
 
 
227 aa  99  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.85 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1604  HAD superfamily hydrolase  26.34 
 
 
230 aa  96.3  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00646761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3624  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.96 
 
 
231 aa  95.9  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795882  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1759  hydrolase  25.34 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  28.12 
 
 
231 aa  95.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  28.12 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  30 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  30 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  27.68 
 
 
230 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  26.79 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  26.69 
 
 
231 aa  90.1  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0780  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.33 
 
 
228 aa  90.1  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  29.45 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  26.67 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  43.14 
 
 
220 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.34 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  36.67 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.13 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  31.87 
 
 
201 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.5 
 
 
250 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5158  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.6 
 
 
222 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0832547  normal  0.0266654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>