80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4953 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4959  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.375809  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4866  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4799  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.221212  normal  0.570717 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4953  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4900  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  313  8e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0521  hypothetical protein  91.08 
 
 
157 aa  290  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650808 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3634  conserved hypothetical protein  87.9 
 
 
157 aa  284  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4903  hypothetical protein  87.9 
 
 
157 aa  284  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4956  hypothetical protein  87.9 
 
 
157 aa  284  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000176607  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3692  hypothetical protein  87.9 
 
 
157 aa  284  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000191847  hitchhiker  0.00156887 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4595  hypothetical protein  87.26 
 
 
157 aa  281  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.2901e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5876  hypothetical protein  87.26 
 
 
157 aa  281  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4908  hypothetical protein  87.74 
 
 
155 aa  280  8.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105331  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0719  hypothetical protein  76.13 
 
 
156 aa  243  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.334296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0558  hypothetical protein  74.84 
 
 
156 aa  241  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73355  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3450  hypothetical protein  75.97 
 
 
156 aa  236  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3579  hypothetical protein  75.97 
 
 
156 aa  236  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0598  hypothetical protein  72.26 
 
 
156 aa  236  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.762355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3837  hypothetical protein  70.78 
 
 
156 aa  227  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0779  hypothetical protein  75.5 
 
 
157 aa  226  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.393956  normal  0.136083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3642  hypothetical protein  72.73 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04240  conserved inner membrane protein  89.81 
 
 
108 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000281641  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04206  hypothetical protein  89.81 
 
 
108 aa  201  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000212595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001669  hypothetical protein  60.51 
 
 
157 aa  199  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.811357  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00804  hypothetical protein  60.51 
 
 
161 aa  198  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2857  hypothetical protein  57.86 
 
 
161 aa  187  5.999999999999999e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00177194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0365  membrane protein  51.97 
 
 
163 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0190  hypothetical protein  51.61 
 
 
159 aa  168  3e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1008  hypothetical protein  47.4 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3647  hypothetical protein  48.05 
 
 
157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3121  hypothetical protein  48.7 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0899  hypothetical protein  48.7 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0908411  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3215  hypothetical protein  48.7 
 
 
157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.488511  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0958  hypothetical protein  47.1 
 
 
155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1073  hypothetical protein  46.75 
 
 
157 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0136401  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1040  hypothetical protein  46.75 
 
 
157 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0218174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3319  hypothetical protein  46.75 
 
 
157 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.999931  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0971  hypothetical protein  46.75 
 
 
157 aa  143  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.295057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0983  hypothetical protein  48.05 
 
 
157 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0873  hypothetical protein  47.44 
 
 
156 aa  143  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0929072  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0856  hypothetical protein  45.51 
 
 
157 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0789379  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2825  hypothetical protein  47.06 
 
 
155 aa  141  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.538821 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3690  hypothetical protein  46.36 
 
 
153 aa  137  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.460322  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3085  hypothetical protein  44.81 
 
 
156 aa  137  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2923  hypothetical protein  45.1 
 
 
155 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000118164  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1291  hypothetical protein  44.16 
 
 
154 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.762277  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0800  hypothetical protein  40.94 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2003  hypothetical protein  34.46 
 
 
150 aa  97.1  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0477013 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1965  ThrE family exporter, small subunit  32.43 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1692  ThrE family exporter small subunit  31.72 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1963  hypothetical protein  28.1 
 
 
167 aa  74.7  0.0000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0436579  hitchhiker  0.000913146 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1086  hypothetical protein  31.51 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.829899  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1299  hypothetical protein  31.41 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1180  hypothetical protein  31.41 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2926  hypothetical protein  33.59 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.67774  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2892  hypothetical protein  31.76 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.078452  normal  0.0867852 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2543  hypothetical protein  35.38 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2595  hypothetical protein  30.52 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1617  hypothetical protein  28.97 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1825  hypothetical protein  31.5 
 
 
168 aa  67  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0379  hypothetical protein  29.66 
 
 
177 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0907  conserved hypothetical protein-like protein  28.08 
 
 
193 aa  62  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497237  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1709  hypothetical protein  29.17 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000820605 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  30.68 
 
 
478 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  27.97 
 
 
426 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  28.68 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  28.68 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  27.01 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0555  hypothetical protein  27.07 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0823  hypothetical protein  27.61 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0368548  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  31.01 
 
 
440 aa  47.8  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1058  hypothetical protein  28.72 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.131438  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0622  hypothetical protein  27.82 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2819  hypothetical protein  31.3 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.162218  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0608  hypothetical protein  27.82 
 
 
150 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  30.11 
 
 
637 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0233  hypothetical protein  27.07 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0909  hypothetical protein  24.71 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000149992  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1713  hypothetical protein  28.28 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0302  hypothetical protein  23.31 
 
 
146 aa  41.6  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.216255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>