More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4724 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  100 
 
 
401 aa  790  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  48.56 
 
 
395 aa  350  2e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0153  tetracycline resistance protein, class A  47.23 
 
 
424 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0042  tetracycline repressor protein TetA, class A  47.23 
 
 
424 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0032  tetracycline resistance protein, class A  47.23 
 
 
399 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.581594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3850  major facilitator transporter  41.89 
 
 
397 aa  274  2e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369274  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  37.12 
 
 
397 aa  262  7e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0682  major facilitator transporter  42.63 
 
 
397 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0278  major facilitator transporter  42.7 
 
 
399 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0762  major facilitator transporter  42.7 
 
 
399 aa  261  2e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0731  major facilitator transporter  42.7 
 
 
399 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90869  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0657  major facilitator transporter  42.36 
 
 
397 aa  259  5e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  36.29 
 
 
398 aa  245  1e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  35.9 
 
 
397 aa  245  1e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2068  major facilitator transporter  36.22 
 
 
395 aa  239  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.731019  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4881  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 
408 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  36.8 
 
 
428 aa  217  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0266  tetracycline resistance protein  37.33 
 
 
405 aa  213  5e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.968173  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  34.27 
 
 
421 aa  205  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1774  major facilitator superfamily MFS_1  36.93 
 
 
430 aa  203  4e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2449  major facilitator transporter  34.65 
 
 
424 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0110452  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3004  major facilitator transporter  35.67 
 
 
421 aa  202  1e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  33.7 
 
 
414 aa  198  2e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0530  major facilitator transporter  39.27 
 
 
415 aa  197  2e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.308388  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  33.43 
 
 
414 aa  196  4e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3504  major facilitator superfamily MFS_1  35.56 
 
 
428 aa  196  5e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0374275  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2280  major facilitator transporter  36.19 
 
 
419 aa  196  8e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.398896  normal  0.849447 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  35.25 
 
 
412 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  35.54 
 
 
407 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3394  major facilitator superfamily MFS_1  32.27 
 
 
408 aa  192  8e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6748  major facilitator superfamily MFS_1  33 
 
 
426 aa  190  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3778  putative tetracycline-efflux transporter  34.83 
 
 
422 aa  189  6e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0047  major facilitator superfamily MFS_1  33.51 
 
 
401 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  34.26 
 
 
428 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  4.34229e-07  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4835  major facilitator transporter  34.07 
 
 
419 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1661  major facilitator transporter  33.04 
 
 
406 aa  180  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171561  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2247  major facilitator transporter  34.92 
 
 
399 aa  179  5e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224163  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1648  major facilitator transporter  31.23 
 
 
415 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0811808 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3307  major facilitator transporter  33.33 
 
 
405 aa  178  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0906362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  32.28 
 
 
426 aa  176  6e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.11783e-05  unclonable  7.56922e-10 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2910  major facilitator transporter  34.55 
 
 
405 aa  174  2e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2150  major facilitator superfamily MFS_1  31.27 
 
 
406 aa  172  7e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.357257  normal  0.0705689 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  29.75 
 
 
406 aa  168  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  31.91 
 
 
396 aa  166  6e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2249  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  33.52 
 
 
406 aa  166  8e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0638588  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0923  major facilitator transporter  33.52 
 
 
406 aa  166  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.311973  normal  0.133556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2504  tetracycline-efflux transporter, putative  30.21 
 
 
411 aa  165  1e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00179141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2426  tetracycline resistance protein  30.48 
 
 
411 aa  165  2e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1028  multidrug resistance protein  28.18 
 
 
408 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0302699  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  32.36 
 
 
427 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  3.52958e-05  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0796  major facilitator transporter  31.12 
 
 
391 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2904  tetracycline resistance protein  29.68 
 
 
411 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.316872  normal  0.10266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2062  major facilitator transporter  33.69 
 
 
436 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.020715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2462  major facilitator superfamily MFS_1  28.76 
 
 
411 aa  157  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.09307e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  32.22 
 
 
370 aa  154  4e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03308  tetracycline-efflux transporter  33.23 
 
 
434 aa  153  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0389216  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2776  major facilitator transporter  34.19 
 
 
412 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.978343 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1621  tetracycline-efflux transporter  32.8 
 
 
418 aa  151  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  29.97 
 
 
416 aa  150  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  31.55 
 
 
387 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  3.58317e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0789  major facilitator transporter  31.62 
 
 
412 aa  147  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1706  major facilitator transporter  31.17 
 
 
411 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.20478  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0551  major facilitator transporter  35.06 
 
 
407 aa  144  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  1.14988e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1186  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 
402 aa  140  4e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.924769  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3727  cold shock protein  30.5 
 
 
413 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.664331 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1444  major facilitator transporter  32.3 
 
 
413 aa  138  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2032  multidrug-efflux transporter quinolene resistance protein NorA  32.72 
 
 
396 aa  137  3e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.810377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.17 
 
 
392 aa  131  2e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  5.24014e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  26.51 
 
 
416 aa  131  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  30.31 
 
 
389 aa  129  1e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
424 aa  126  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3378  major facilitator transporter  29.57 
 
 
412 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0191855  normal  0.504281 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 
425 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 
439 aa  124  4e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1303  major facilitator superfamily permease  30.17 
 
 
414 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1305  major facilitator superfamily MFS_1  28.15 
 
 
421 aa  123  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18861  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  28.76 
 
 
422 aa  122  1e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.899402  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4029  major facilitator transporter  26.92 
 
 
442 aa  121  2e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00530062  normal  0.0326348 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21761  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  29.86 
 
 
414 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.407538 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19051  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.97 
 
 
423 aa  119  1e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49750  MFS family transporter  50.36 
 
 
422 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  27.07 
 
 
424 aa  117  4e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1788  major facilitator superfamily multidrug-efflux transporter  27.51 
 
 
422 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0271  major facilitator transporter  30.42 
 
 
429 aa  115  1e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  29.32 
 
 
434 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  29.34 
 
 
386 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  27.96 
 
 
417 aa  114  4e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  26.56 
 
 
423 aa  113  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0121  multidrug resistance protein  30.14 
 
 
429 aa  113  7e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369056  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1119  multidrug resistance protein  30.14 
 
 
429 aa  113  7e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510833  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1708  multidrug resistance protein  30.14 
 
 
429 aa  113  7e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.477199  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1290  multidrug resistance protein  30.14 
 
 
429 aa  113  7e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.800676  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0305  multidrug resistance protein  30.14 
 
 
429 aa  113  7e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.54 
 
 
388 aa  112  8e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.54 
 
 
388 aa  112  8e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1794  multidrug resistance protein  30.14 
 
 
429 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2291  major facilitator superfamily permease  27.56 
 
 
419 aa  112  1e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0140  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
398 aa  110  4e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1859  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
421 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0875597  normal  0.419035 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0151  major facilitator superfamily MFS_1  28.41 
 
 
398 aa  109  8e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>