More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4646 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01581  fumarate hydratase (fumarase A), aerobic Class I  88.69 
 
 
548 aa  1016    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.733068  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03993  anaerobic class I fumarate hydratase (fumarase B)  93.43 
 
 
548 aa  1072    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2031  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  88.69 
 
 
548 aa  1016    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0136036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3870  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  93.43 
 
 
548 aa  1073    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0994  fumarate hydratase, class I  70.19 
 
 
541 aa  806    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1587  fumarate hydratase  88.5 
 
 
548 aa  1016    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.596697  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1417  fumarate hydratase class I, anaerobic  78.79 
 
 
548 aa  909    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.70407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5566  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  64.37 
 
 
548 aa  739    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0933  fumarate hydratase, class I  85.16 
 
 
547 aa  979    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.140694  normal  0.173179 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19708  precursor of fumarase fumarase  61.63 
 
 
567 aa  670    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.473143  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2144  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  74.41 
 
 
548 aa  830    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.207467  normal  0.384871 
 
 
-
 
NC_004310  BR0961  fumarate hydratase, class I  66.6 
 
 
539 aa  742    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.426877  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0745  tartrate/fumarate family Fe-S type hydro-lyase  66.73 
 
 
550 aa  798    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.517956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2560  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  85.95 
 
 
549 aa  1001    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0557449  normal  0.126998 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1831  fumarase  87.96 
 
 
548 aa  1010    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.640602  hitchhiker  0.002407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0889  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  71.85 
 
 
541 aa  827    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000151157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4588  fumarate hydratase class I, anaerobic  93.43 
 
 
548 aa  1076    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0631  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  67.85 
 
 
547 aa  783    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01571  hypothetical protein  88.69 
 
 
548 aa  1016    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.900743  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8500  fumarate hydratase, class I  62.43 
 
 
550 aa  702    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3905  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  93.43 
 
 
548 aa  1075    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5636  fumarate hydratase  93.07 
 
 
548 aa  1071    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2018  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  66.22 
 
 
535 aa  748    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1888  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  72.86 
 
 
540 aa  833    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86934  predicted protein  62.59 
 
 
560 aa  699    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120062  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3371  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  71.67 
 
 
541 aa  823    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2570  fumarase  72.22 
 
 
541 aa  821    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.013592  normal  0.472366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4676  fumarate hydratase  93.61 
 
 
548 aa  1076    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1149  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  61.55 
 
 
554 aa  704    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.691464  normal  0.943485 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2322  fumarate hydratase  88.5 
 
 
548 aa  1014    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.387044  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2225  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  66.41 
 
 
539 aa  740    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03954  hypothetical protein  93.43 
 
 
548 aa  1072    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2206  fumarase  65.41 
 
 
548 aa  725    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0177181  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1820  fumarate hydratase  88.69 
 
 
548 aa  1016    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.279126  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1023  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  84.07 
 
 
547 aa  976    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2068  fumarase  72.3 
 
 
540 aa  830    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3762  fumarate hydratase, class I  63.65 
 
 
555 aa  701    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1567  fumarate hydratase class I, anaerobic  88.32 
 
 
548 aa  1001    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3184  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  84.43 
 
 
549 aa  979    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.493682  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4675  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  61.4 
 
 
555 aa  676    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.63947  normal  0.0290276 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1533  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  63.57 
 
 
551 aa  707    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.639003 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6383  hydro-lyase Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, subunit beta  63.79 
 
 
547 aa  724    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1809  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  72.86 
 
 
540 aa  834    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1651  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  69.81 
 
 
541 aa  801    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000020704  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1708  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  63.76 
 
 
551 aa  708    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3404  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  84.98 
 
 
547 aa  977    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24490  fumarase  62.27 
 
 
567 aa  709    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.208028  normal  0.69636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2615  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  69.44 
 
 
542 aa  794    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000086832  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1337  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  63.75 
 
 
548 aa  738    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3258  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  83.88 
 
 
547 aa  974    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000853495  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0162  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.29 
 
 
538 aa  704    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1687  fumarate hydratase  88.5 
 
 
548 aa  1014    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.713112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0786  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  84.25 
 
 
547 aa  977    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.141985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0713  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  64.78 
 
 
550 aa  717    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0340597  normal  0.16476 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3285  fumarase  63.87 
 
 
534 aa  729    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4397  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  63.38 
 
 
551 aa  703    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.617771  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1577  fumarate hydratase class I, anaerobic  88.14 
 
 
548 aa  999    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.551964 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2076  fumarate hydratase protein class I  65.46 
 
 
534 aa  736    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3271  fumarate hydratase, class I  84.98 
 
 
547 aa  978    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4646  fumarate hydratase class I, anaerobic  99.64 
 
 
548 aa  1136    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1798  fumarate hydratase  88.5 
 
 
548 aa  1014    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.773214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2336  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  74.34 
 
 
538 aa  847    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.801629  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3238  fumarase  61.39 
 
 
535 aa  710    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1636  fumarate hydratase class I, anaerobic  88.5 
 
 
548 aa  1003    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.901964 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0749  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  69.44 
 
 
541 aa  800    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000017058  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4245  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  61.95 
 
 
568 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201953  normal  0.0592114 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2239  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  65.28 
 
 
535 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.747448 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1061  fumarase  61.55 
 
 
571 aa  694    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2916  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  62.9 
 
 
538 aa  701    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.36455 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0951  fumarate hydratase, class I  66.41 
 
 
581 aa  742    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4555  fumarate hydratase class I, anaerobic  99.45 
 
 
548 aa  1134    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3051  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  71 
 
 
540 aa  820    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0708755  normal  0.340068 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0881  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  61.08 
 
 
534 aa  702    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1080  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  64.03 
 
 
546 aa  730    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4646  fumarate hydratase class I, anaerobic  100 
 
 
548 aa  1140    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1706  fumarate hydratase class I, anaerobic  88.14 
 
 
548 aa  1013    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.142614  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3124  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  62.41 
 
 
564 aa  703    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00427914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2018  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  88.5 
 
 
548 aa  1014    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4564  fumarate hydratase  99.45 
 
 
548 aa  1134    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5483  fumarase  63.19 
 
 
551 aa  700    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0693  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  59.44 
 
 
538 aa  684    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.635421  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1492  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily, beta subunit  63.18 
 
 
554 aa  714    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4022  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase beta subunit  85.95 
 
 
548 aa  1001    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00935684  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1875  fumarate hydratase class I, anaerobic  88.5 
 
 
548 aa  1002    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.27379  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0825  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate family  66.73 
 
 
550 aa  798    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4695  fumarate hydratase class I, anaerobic  99.64 
 
 
548 aa  1136    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3082  hydro-lyase, Fe-S type, tartrate/fumarate subfamily subunit beta  63.81 
 
 
551 aa  716    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4363  fumarate hydratase  93.61 
 
 
548 aa  1076    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2038  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  34.81 
 
 
506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00475801  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2334  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  34.39 
 
 
505 aa  213  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000449013  normal  0.0431842 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1977  fumarate hydratase  32.39 
 
 
512 aa  213  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.146696  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2883  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  33.12 
 
 
516 aa  211  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.234305 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1139  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  32.18 
 
 
507 aa  209  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3613  putative fumarate hydratase, class I  31.7 
 
 
507 aa  209  9e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.985356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01949  fumarate hydratase, class I  31.04 
 
 
509 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0117439  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1912  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  33.47 
 
 
520 aa  207  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00626493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2412  fumarase  34.55 
 
 
505 aa  207  4e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.2772  hitchhiker  0.00265911 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2227  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  34.11 
 
 
504 aa  207  5e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00238187  hitchhiker  0.00748664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2654  tartrate/fumarate subfamily Fe-S type hydro-lyase alpha subunit  33.26 
 
 
517 aa  206  7e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0657589  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0922  putative fumarate hydratase, class I  32.49 
 
 
505 aa  206  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.673761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>