219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4296 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03725  predicted recombination limiting protein  87.58 
 
 
475 aa  847    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4147  protein of unknown function DUF195  87.58 
 
 
475 aa  847    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0247  hypothetical protein  76.76 
 
 
515 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.131005 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4304  DNA recombination protein RmuC  87.37 
 
 
475 aa  844    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4296  DNA recombination protein RmuC  100 
 
 
476 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4177  DNA recombination protein RmuC  100 
 
 
476 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.608265  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4353  DNA recombination protein RmuC  87.58 
 
 
475 aa  847    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4057  hypothetical protein  74.94 
 
 
520 aa  639    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4176  DNA recombination protein RmuC  87.79 
 
 
475 aa  848    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0130671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4215  DNA recombination protein RmuC  87.79 
 
 
475 aa  848    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4056  DNA recombination protein RmuC  87.58 
 
 
475 aa  847    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03674  hypothetical protein  87.58 
 
 
475 aa  847    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4249  DNA recombination protein RmuC  99.79 
 
 
476 aa  964    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4200  DNA recombination protein RmuC  99.79 
 
 
476 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5273  DNA recombination protein RmuC  87.58 
 
 
475 aa  847    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.243215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4356  DNA recombination protein RmuC  100 
 
 
476 aa  967    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881162  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3961  DNA recombination protein RmuC  85.9 
 
 
485 aa  802    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0880517 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3946  hypothetical protein  72.51 
 
 
501 aa  631  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.737654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0270  RmuC domain-containing protein  72.51 
 
 
501 aa  631  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557179  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3642  RmuC domain-containing protein  72.51 
 
 
501 aa  631  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4248  protein of unknown function DUF195  74.21 
 
 
518 aa  630  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.474867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3764  protein of unknown function DUF195  75.06 
 
 
501 aa  608  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3916  protein of unknown function DUF195  71.98 
 
 
513 aa  609  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.705842  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0018  RmuC domain-containing protein  64.32 
 
 
494 aa  520  1e-146  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2995  DNA recombination protein RumC  58.27 
 
 
506 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00561  hypothetical protein  61.58 
 
 
510 aa  482  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2433  hypothetical protein  62.33 
 
 
513 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001928  DNA recombination protein RmuC  61.27 
 
 
510 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2124  hypothetical protein  46.6 
 
 
491 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2414  hypothetical protein  55.28 
 
 
507 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01951  RmuC  52.53 
 
 
429 aa  426  1e-118  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.537829  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2041  hypothetical protein  46.96 
 
 
537 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2110  hypothetical protein  46.96 
 
 
521 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.664501  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1864  hypothetical protein  46.96 
 
 
521 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1980  hypothetical protein  54.6 
 
 
515 aa  424  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.981976 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2235  hypothetical protein  46.75 
 
 
521 aa  422  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0248668  normal  0.25441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2620  hypothetical protein  53.66 
 
 
498 aa  421  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.27226  normal  0.225065 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1629  hypothetical protein  55.65 
 
 
518 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.158753  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2528  hypothetical protein  54.4 
 
 
498 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2101  hypothetical protein  46.75 
 
 
519 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.399402  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2284  protein of unknown function DUF195  46.75 
 
 
519 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0239912  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2054  hypothetical protein  46.75 
 
 
518 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0154477  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4558  hypothetical protein  46.54 
 
 
519 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2272  hypothetical protein  46.54 
 
 
519 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2104  hypothetical protein  46.12 
 
 
518 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2346  hypothetical protein  55.65 
 
 
522 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1894  hypothetical protein  54.87 
 
 
520 aa  415  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0083  hypothetical protein  50.68 
 
 
453 aa  391  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.884602 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2040  hypothetical protein  46.34 
 
 
548 aa  371  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0614  hypothetical protein  46.85 
 
 
640 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0286081 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1623  putative alpha helix chain  47.19 
 
 
462 aa  346  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.577151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51000  hypothetical protein  44.25 
 
 
453 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000148678  hitchhiker  0.000000161097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1724  hypothetical protein  44.29 
 
 
492 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000410334  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0145  protein of unknown function DUF195  46.89 
 
 
420 aa  340  4e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549267  normal  0.154744 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2954  hypothetical protein  43.58 
 
 
500 aa  340  4e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.652449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3666  hypothetical protein  44.05 
 
 
492 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000475221  normal  0.0538787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0133  hypothetical protein  46.37 
 
 
424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000273434  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4351  RmuC domain-containing protein family  44.64 
 
 
491 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00339657  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1659  hypothetical protein  44.47 
 
 
492 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000440717  decreased coverage  0.00162326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1291  hypothetical protein  44.18 
 
 
495 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000719972  normal  0.7676 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0140  hypothetical protein  40.37 
 
 
407 aa  316  5e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1249  hypothetical protein  44.18 
 
 
495 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0088018  normal  0.121564 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4026  hypothetical protein  42.55 
 
 
495 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000512387  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1694  hypothetical protein  42.31 
 
 
495 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141195  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0068  hypothetical protein  37.31 
 
 
457 aa  310  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.243757  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2890  hypothetical protein  44.48 
 
 
437 aa  307  3e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.18912  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3332  hypothetical protein  41.71 
 
 
491 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000142299  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1614  hypothetical protein  45.29 
 
 
494 aa  306  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0228591  normal  0.73372 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1321  hypothetical protein  39.51 
 
 
427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1370  protein of unknown function DUF195  43.14 
 
 
430 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1481  protein of unknown function DUF195  41.49 
 
 
435 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0981784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2422  hypothetical protein  36.49 
 
 
639 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0441  hypothetical protein  40.66 
 
 
527 aa  291  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.870826  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0986  hypothetical protein  40.23 
 
 
403 aa  286  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0412766  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12808  DNA recombination protein RmuC  35.57 
 
 
470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0015  protein of unknown function DUF195  38.17 
 
 
448 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.567486  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1053  hypothetical protein  40.54 
 
 
437 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0646  hypothetical protein  35.53 
 
 
480 aa  277  4e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.932654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1094  hypothetical protein  38.46 
 
 
428 aa  273  6e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437038  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0447  hypothetical protein  38.67 
 
 
437 aa  267  4e-70  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0432711  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1035  protein of unknown function DUF195  39.71 
 
 
612 aa  266  8e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000597215  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1614  DNA recombination protein rmuC  36.64 
 
 
535 aa  265  2e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2033  RmuC domain-containing protein  38.82 
 
 
530 aa  264  3e-69  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0125  RmuC domain-containing protein  39.76 
 
 
408 aa  263  4e-69  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.63126  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0577  RmuC family protein  38.58 
 
 
397 aa  262  8e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.585058  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4070  hypothetical protein  40.88 
 
 
504 aa  261  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.73657 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1087  hypothetical protein  35.95 
 
 
630 aa  256  8e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0033  RmuC domain-containing protein  34.61 
 
 
432 aa  249  6e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0237  hypothetical protein  34.7 
 
 
626 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0705649  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0751  RmuC domain-containing protein  38.2 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1422  protein of unknown function DUF195  36.42 
 
 
428 aa  221  3e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2898  hypothetical protein  32.2 
 
 
504 aa  206  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5568  protein of unknown function DUF195  28.46 
 
 
473 aa  176  9e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110134  normal  0.0896714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1920  hypothetical protein  31.86 
 
 
525 aa  176  9.999999999999999e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0785962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4571  hypothetical protein  35.17 
 
 
431 aa  175  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0571  hypothetical protein  27.68 
 
 
503 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1026  RmuC family protein  27.11 
 
 
435 aa  172  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000225596  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3209  hypothetical protein  34.14 
 
 
456 aa  170  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000788974  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0232  hypothetical protein  29.82 
 
 
445 aa  169  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.169599  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1406  hypothetical protein  29.87 
 
 
459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0324522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>