More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4121 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4016  DNA-binding transcriptional activator UhpA  99.49 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4121  DNA-binding transcriptional activator UhpA  100 
 
 		 196 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.97066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4071  DNA-binding transcriptional activator UhpA  99.49 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4000  DNA-binding transcriptional activator UhpA  99.49 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.348805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4179  DNA-binding transcriptional activator UhpA  99.49 
 
 		 196 aa  394  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03553  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system wtih UhpB  97.45 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0034  two component transcriptional regulator, LuxR family  97.45 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4034  DNA-binding transcriptional activator UhpA  97.45 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383338 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03495  hypothetical protein  97.45 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5099  DNA-binding transcriptional activator UhpA  97.45 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0828785 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3882  DNA-binding transcriptional activator UhpA  97.45 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4178  DNA-binding transcriptional activator UhpA  97.45 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4250  DNA-binding transcriptional activator UhpA  97.45 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0030  DNA-binding transcriptional activator UhpA  97.45 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0027  DNA-binding transcriptional activator UhpA  91.33 
 
 		 197 aa  369  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3504  DNA-binding transcriptional activator UhpA  89.29 
 
 		 196 aa  360  6e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4080  transcriptional regulatory protein UhpA  65.97 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4132  two-component system response regulator  65.97 
 
 		 196 aa  256  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0081  two component LuxR family transcriptional regulator  66.49 
 
 		 196 aa  257  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0132  two component LuxR family transcriptional regulator  64.77 
 
 		 196 aa  254  5e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.401597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000091  transcriptional regulatory protein UhpA  63.64 
 
 		 202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.136186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2482  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.52 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0622  transcriptional regulator UhpA  51.79 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2402  LuxR family DNA-binding response regulator  48.48 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2499  two component LuxR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.449467  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1688  LuxR family DNA-binding response regulator  48.48 
 
 		 209 aa  183  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000202542  normal  0.0533619 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1775  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.99 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.814588  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1369  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.99 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.380225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0836  two component LuxR family transcriptional regulator  49.74 
 
 		 210 aa  164  5e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0438  transcriptional regulatory protein UhpA  48.95 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1987  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 215 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0949899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0090  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 210 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0306  two component LuxR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000161342  hitchhiker  0.00000159266 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 213 aa  135  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0121  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.830531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0153  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.3 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0242  two component LuxR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000159114 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0292  response regulator transcription regulator protein  38.81 
 
 		 210 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0145  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 210 aa  131  6e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1785  two component LuxR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.762084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2832  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.988429  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1725  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000351159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3509  two component LuxR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 239 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.325902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2902  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.255362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3043  LuxR family DNA binding response regulator  42.71 
 
 		 209 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  39.2 
 
 		 209 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1809  two component LuxR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 210 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  36.84 
 
 		 213 aa  128  4.0000000000000003e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2012  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2686  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  128  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000957663  normal  0.053055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1460  two component LuxR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.39219  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3862  two component LuxR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.734244  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1732  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.14 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000321601  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 213 aa  128  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1269  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584326  hitchhiker  0.00198125 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1041  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644757  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  38.76 
 
 		 210 aa  128  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2147  response regulator  36.14 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000040455  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2141  response regulator  35.82 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.126922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  38.28 
 
 		 210 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2162  response regulator  35.64 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.284818  hitchhiker  0.000000016111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1173  response regulator  35.64 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000706228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02748  response regulator  34.83 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  38.58 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2103  response regulator  35.64 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0532421  hitchhiker  0.00988724 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.03 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1296  response regulator  35.64 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  hitchhiker  0.00000564902 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 		 213 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0032  two component LuxR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 210 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1824  response regulator  35.71 
 
 		 229 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.152948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 210 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1450  response regulator  35.82 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0303042  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.81 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.520546 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0357  two-component response regulator  38.83 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00848176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21900  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  39.35 
 
 		 230 aa  125  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00486265  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1848  response regulator  34.83 
 
 		 218 aa  124  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0524957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1026  response regulator protein  38.54 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2455  response regulator  36.02 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.140183  normal  0.431169 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2110  response regulator  35.64 
 
 		 218 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.167551  hitchhiker  0.00000000000000238763 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1336  two component LuxR family transcriptional regulator  36 
 
 		 208 aa  124  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1607  response regulator  36.49 
 
 		 214 aa  124  7e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000106395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4382  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 209 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1518  response regulator  35.96 
 
 		 220 aa  123  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121615  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1594  response regulator  35.82 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.518893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 220 aa  123  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2450  two component LuxR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00539256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38900  putative two-component response regulator  40 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.899747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 214 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000360675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1888  two component transcriptional regulator, LuxR family  38 
 
 		 212 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  37.43 
 
 		 209 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2132  two component LuxR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0449794  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2150  response regulator  35.85 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0590135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  35.07 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>