More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3987 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  80.92 
 
 		 676 aa  1162    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  54.44 
 
 		 694 aa  748    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  81.51 
 
 		 676 aa  1165    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  81.36 
 
 		 676 aa  1164    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  81.51 
 
 		 676 aa  1165    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  68.3 
 
 		 687 aa  959    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  99.56 
 
 		 675 aa  1394    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  98.52 
 
 		 675 aa  1381    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  68.46 
 
 		 687 aa  961    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  81.36 
 
 		 676 aa  1164    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  81.51 
 
 		 676 aa  1164    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  99.11 
 
 		 675 aa  1387    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  68.45 
 
 		 688 aa  950    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  68.15 
 
 		 687 aa  960    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  98.96 
 
 		 675 aa  1385    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  81.07 
 
 		 676 aa  1164    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  81.51 
 
 		 676 aa  1165    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  100 
 
 		 675 aa  1398    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  81.51 
 
 		 676 aa  1168    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  76.75 
 
 		 676 aa  1075    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  49.93 
 
 		 687 aa  595  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04858  periplasmic alpha-amylase precursor  43.33 
 
 		 686 aa  551  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  43.15 
 
 		 686 aa  548  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0377  periplasmic alpha-amylase precursor  44.95 
 
 		 690 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5156  alpha amylase catalytic region  51.08 
 
 		 631 aa  472  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.794447 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2966  periplasmic alpha-amylase precursor  34.15 
 
 		 554 aa  289  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0359773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  32.95 
 
 		 553 aa  273  6e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  34.26 
 
 		 566 aa  267  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  33 
 
 		 528 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  33.66 
 
 		 528 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4138  Alpha amylase  34.06 
 
 		 533 aa  184  6e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.244711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  28.02 
 
 		 2638 aa  157  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  27.69 
 
 		 752 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  28.17 
 
 		 609 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.41 
 
 		 1891 aa  132  3e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.3 
 
 		 2068 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  23.06 
 
 		 511 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  27.62 
 
 		 1942 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  26.62 
 
 		 723 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.44 
 
 		 1975 aa  127  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  30.02 
 
 		 925 aa  127  9e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.51 
 
 		 1855 aa  125  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  22.66 
 
 		 510 aa  125  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  25.78 
 
 		 614 aa  124  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  26.2 
 
 		 1005 aa  122  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  26.65 
 
 		 1017 aa  120  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  23.67 
 
 		 836 aa  119  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  27.16 
 
 		 600 aa  119  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25.87 
 
 		 604 aa  118  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  24.39 
 
 		 620 aa  118  3.9999999999999997e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  23.47 
 
 		 582 aa  117  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  23.82 
 
 		 838 aa  117  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  24.82 
 
 		 593 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  26.88 
 
 		 599 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3419  hypothetical protein  25.35 
 
 		 481 aa  113  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  23.29 
 
 		 814 aa  110  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  25.65 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  26.27 
 
 		 622 aa  108  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  25.8 
 
 		 1021 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2916  Alpha-amylase  25.1 
 
 		 472 aa  106  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  21.81 
 
 		 574 aa  104  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1856  Alpha amylase, catalytic region  25.11 
 
 		 586 aa  104  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1613  alpha amylase, catalytic region  24.86 
 
 		 589 aa  104  6e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.050548  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0611  alpha amylase, catalytic region  25.44 
 
 		 496 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.132901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  25 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02018  Alpha-amylase AmyAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV07]  26.63 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  26.24 
 
 		 624 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1119  alpha-amylase  22.97 
 
 		 586 aa  100  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0181074  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4120  alpha-amylase  22.97 
 
 		 586 aa  100  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000171258  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2017  Alpha amylase, catalytic region  24.14 
 
 		 488 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00107336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3842  alpha amylase catalytic region  22.8 
 
 		 586 aa  99.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000752132  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  21.8 
 
 		 649 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0693  alpha amylase catalytic region  23 
 
 		 589 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.544256  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  21.71 
 
 		 575 aa  98.2  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2350  alpha amylase catalytic region  24.34 
 
 		 583 aa  98.2  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1510  alpha amylase catalytic region  23.63 
 
 		 588 aa  97.8  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4139  alpha-amylase  22.46 
 
 		 586 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00110847  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  22.65 
 
 		 586 aa  97.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0209  alpha amylase catalytic region  26.39 
 
 		 587 aa  96.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.214929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  22.63 
 
 		 885 aa  96.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2715  alpha amylase catalytic region  23.11 
 
 		 586 aa  96.3  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.783965  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  26.61 
 
 		 662 aa  95.5  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  23.77 
 
 		 742 aa  95.5  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4033  alpha-amylase  22.2 
 
 		 586 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  36.15 
 
 		 610 aa  94.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3923  alpha-amylase  22.24 
 
 		 586 aa  94.4  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.077221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3771  neopullulanase  22.24 
 
 		 586 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00823842  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4230  alpha-amylase  22.24 
 
 		 586 aa  94.4  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.300485  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  37.88 
 
 		 524 aa  94  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  39.55 
 
 		 853 aa  93.6  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1887  alpha amylase, catalytic region  37.18 
 
 		 654 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 878 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  22.06 
 
 		 586 aa  92.8  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  33.33 
 
 		 878 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4392  alpha amylase, catalytic region  23.51 
 
 		 493 aa  92.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1712  alpha amylase, catalytic region  23.15 
 
 		 481 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1429  glycoside hydrolase, starch-binding  21.48 
 
 		 642 aa  91.3  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.56449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  26.49 
 
 		 653 aa  91.3  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1852  neopullulanase  22.91 
 
 		 584 aa  90.9  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.496782  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  33.54 
 
 		 646 aa  90.5  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>