More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3839 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A3900  major facilitator superfamily MFS_1  99.55 
 
 		 444 aa  880    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.416802  normal  0.649925 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3797  major facilitator superfamily MFS_1  99.77 
 
 		 444 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.653013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3839  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 443 aa  884    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.993033  normal  0.150303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3731  major facilitator superfamily MFS_1  99.77 
 
 		 444 aa  882    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4381  major facilitator transporter  53.1 
 
 		 428 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0579635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 431 aa  385  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3694  major facilitator superfamily MFS_1  45.57 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3891  major facilitator superfamily MFS_1  45.45 
 
 		 433 aa  375  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  45.3 
 
 		 430 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3209  major facilitator transporter  45.3 
 
 		 430 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  45.06 
 
 		 430 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4376  major facilitator transporter  45.1 
 
 		 430 aa  359  7e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5057  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5803  major facilitator transporter  44.85 
 
 		 430 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 435 aa  351  2e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1580  major facilitator transporter  40.65 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.177691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1793  major facilitator family transporter  40.7 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365481 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2068  major facilitator transporter  41.38 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1981  major facilitator superfamily 2- ketogluconate transporter  37.76 
 
 		 429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1375  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 423 aa  266  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1252  major facilitator transporter  37.76 
 
 		 424 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.117112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0058  major facilitator transporter  36.79 
 
 		 422 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.788855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2277  major facilitator superfamily MFS_1  37.12 
 
 		 431 aa  259  9e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.783016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0353  major facilitator family transporter  34.75 
 
 		 432 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2287  major facilitator family transporter  36.98 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2153  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 425 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0443682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2095  major facilitator transporter  36.98 
 
 		 425 aa  251  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0962  major facilitator family transporter  36.74 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.683776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2903  general substrate transporter  36.24 
 
 		 432 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2297  major facilitator family transporter  36.5 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0691  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0861874  normal  0.321761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0757  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 426 aa  249  5e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.237029  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1527  major facilitator transporter  37.41 
 
 		 426 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0610688  normal  0.832565 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2215  major facilitator superfamily MFS_1  34.4 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1653  major facilitator transporter  37.32 
 
 		 426 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.297588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2978  putative 2-ketogluconate transporter  35.75 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.079041  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0168  major facilitator transporter  36.32 
 
 		 426 aa  245  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5028  major facilitator transporter  35.85 
 
 		 426 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35330  putative 2-ketogluconate transporter  35.71 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00579798  normal  0.180448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26900  2-ketogluconate transporter  35.6 
 
 		 432 aa  242  9e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1653  major facilitator transporter  36.58 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.931717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1745  major facilitator transporter  36.45 
 
 		 426 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.734469 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6347  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 426 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1732  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 426 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2290  major facilitator superfamily MFS_1  37.05 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.485265  hitchhiker  0.00935989 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3377  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 430 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0713136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2381  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 462 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2567  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.128703  normal  0.227607 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0686  major facilitator transporter  34.82 
 
 		 426 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.150061 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  34.26 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2570  major facilitator transporter  36.25 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.824774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 436 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 437 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46740  Major facilitator superfamily protein  35.11 
 
 		 440 aa  229  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366034  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  34.85 
 
 		 443 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  33.33 
 
 		 442 aa  226  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 424 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  31.31 
 
 		 439 aa  221  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  31.05 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 439 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 444 aa  219  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.86 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 445 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5164  major facilitator superfamily MFS_1  31.62 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  33.17 
 
 		 469 aa  216  5e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  33.17 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  33.17 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  33.17 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  33.17 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  33.17 
 
 		 440 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0143  phthalate transporter, putative  33.65 
 
 		 433 aa  216  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.448934  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 441 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 441 aa  216  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 441 aa  216  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 433 aa  216  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  31.23 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  33.25 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  31.86 
 
 		 456 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  31.96 
 
 		 441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0128  putative phthalate transporter  33.41 
 
 		 433 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  31.95 
 
 		 441 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  32.14 
 
 		 437 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 436 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 436 aa  212  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6876  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0110774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 442 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0899  major facilitator superfamily anion(metabolite)/cation symporter  29.88 
 
 		 444 aa  208  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.31772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4083  major facilitator superfamily MFS_1  31.33 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  31.5 
 
 		 434 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 439 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 454 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  32.95 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>