More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3638 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  100 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  99.62 
 
 		 260 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  99.17 
 
 		 242 aa  490  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  88.08 
 
 		 263 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  88.08 
 
 		 263 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  88.08 
 
 		 263 aa  471  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  88.08 
 
 		 260 aa  472  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  88.08 
 
 		 260 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  88.08 
 
 		 260 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  88.08 
 
 		 263 aa  471  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  88.08 
 
 		 260 aa  472  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  88.08 
 
 		 260 aa  471  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  84.23 
 
 		 260 aa  448  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  58.7 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  46.88 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  42.49 
 
 		 237 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  37.72 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  34.76 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  36.68 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  36.75 
 
 		 234 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  36.32 
 
 		 235 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  43.5 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.71 
 
 		 258 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.82 
 
 		 239 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  28.81 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  31.25 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  30.87 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  29.86 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.63 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  30.51 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  32.34 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  27.39 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  33.48 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.19 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  31.3 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  30.65 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  30.65 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  30.65 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 247 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  27.68 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  30.28 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  32.75 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  31.86 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28.38 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  28 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  26.87 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  31.14 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  32 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  28.88 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  32.76 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  29.78 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  29.46 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 268 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  27.6 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.63 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  30.24 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  31.2 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.51 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  27.78 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  28.92 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  25.22 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  28.44 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  31.61 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  26.79 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.18 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  28.51 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  28.38 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  24.79 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  28.76 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  29.61 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  30.77 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  26.52 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>