More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3266 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 		 367 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  72.19 
 
 		 404 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  72.19 
 
 		 404 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  72.19 
 
 		 404 aa  549  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  65.17 
 
 		 404 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  62.08 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  62.08 
 
 		 394 aa  480  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  62.18 
 
 		 396 aa  479  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  61.52 
 
 		 417 aa  474  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  62.08 
 
 		 402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  62.95 
 
 		 396 aa  463  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  60.96 
 
 		 394 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  57.58 
 
 		 410 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4002  phage integrase family site specific recombinase  58.15 
 
 		 387 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1377  integrase family protein  57.02 
 
 		 404 aa  443  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.421262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1403  integrase family protein  56.74 
 
 		 404 aa  441  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  56.46 
 
 		 389 aa  439  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  57.58 
 
 		 397 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  56.74 
 
 		 404 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  56.74 
 
 		 395 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  56.46 
 
 		 391 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  54.49 
 
 		 402 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  55.62 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  55.9 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  55.9 
 
 		 394 aa  421  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  55.06 
 
 		 409 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  55.03 
 
 		 396 aa  414  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  54.49 
 
 		 387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  50 
 
 		 401 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0968  cp4-like integrase protein  47.77 
 
 		 391 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  44.97 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  47.27 
 
 		 406 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2993  integrase family protein  45.8 
 
 		 411 aa  330  3e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0241673  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  47.25 
 
 		 403 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  44.51 
 
 		 385 aa  325  9e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3122  integrase family protein  46.13 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3253  integrase family protein  47.37 
 
 		 406 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.274925  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  43.94 
 
 		 397 aa  322  7e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1871  putative integrase prophage protein  45.92 
 
 		 405 aa  319  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00740779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2072  integrase family protein  45.38 
 
 		 407 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.841134  normal  0.685608 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1823  prophage P4 integrase  46.2 
 
 		 421 aa  315  7e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0003918  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3444  integrase family protein  45.86 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.950055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0912  phage integrase family protein  45.65 
 
 		 413 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  45.25 
 
 		 401 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  43.65 
 
 		 404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1627  phage integrase family protein  45.11 
 
 		 419 aa  301  1e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1442  phage integrase  43.75 
 
 		 404 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1752  phage integrase  42.54 
 
 		 404 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2364  phage integrase family protein  42.54 
 
 		 404 aa  299  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  42.54 
 
 		 404 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  41.74 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2184  Phage integrase  42.35 
 
 		 403 aa  295  1e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.264722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  44.47 
 
 		 410 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4836  integrase  45.09 
 
 		 421 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.466297  normal  0.712135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1135  integrase family protein  41.98 
 
 		 420 aa  293  4e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.660437  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0943  putative integrase prophage protein  42.62 
 
 		 400 aa  291  9e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  40.83 
 
 		 438 aa  289  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6353  P4-like integrase  43.53 
 
 		 407 aa  288  8e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.276221  normal  0.142283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1315  phage integrase family protein  43.79 
 
 		 378 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00318446  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  42.63 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3669  prophage CP4-like integrase  42.54 
 
 		 462 aa  285  9e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.18314  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1577  integrase family protein  44.32 
 
 		 407 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  43.05 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  41.18 
 
 		 404 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3717  integrase family protein  42.63 
 
 		 419 aa  279  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3554  integrase family protein  42.63 
 
 		 419 aa  280  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3314  site-specific recombinase, phage integrase family protein  39.62 
 
 		 420 aa  279  5e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.426306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1087  prophage CP4-like integrase  44.69 
 
 		 402 aa  279  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0686158  normal  0.733302 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3878  integrase family protein  39.89 
 
 		 421 aa  279  5e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.642125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2233  integrase family protein  41.94 
 
 		 397 aa  279  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0126025 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  39.89 
 
 		 411 aa  278  9e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2483  integrase family protein  41.71 
 
 		 404 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2400  phage integrase family protein  42.54 
 
 		 404 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0432428  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  39.89 
 
 		 420 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4347  integrase family protein  43.02 
 
 		 402 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000357829 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1669  integrase family protein  39.89 
 
 		 421 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.553774  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0463  phage integrase family protein  39.78 
 
 		 420 aa  276  6e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0356989 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  37.71 
 
 		 394 aa  274  1.0000000000000001e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  39.89 
 
 		 421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4272  site-specific recombinase, phage integrase family protein  39.35 
 
 		 421 aa  272  6e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.451693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  39.35 
 
 		 419 aa  272  7e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2005  cp4-like integrase protein  43.37 
 
 		 425 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2073  putative integrase prophage protein  40.22 
 
 		 445 aa  271  1e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3996  phage integrase family protein  41.74 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.243095  normal  0.464149 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0484  phage integrase family protein  40.11 
 
 		 421 aa  268  8e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0871  integrase family protein  41.24 
 
 		 419 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3702  integrase family protein  39.78 
 
 		 418 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0718  integrase family protein  41.51 
 
 		 419 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1557  integrase family protein  42.9 
 
 		 403 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4753  phage integrase family site specific recombinase  38.71 
 
 		 421 aa  265  7e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2767  phage integrase family protein  40.8 
 
 		 421 aa  265  7e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00105965 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2704  Phage integrase  41.16 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143842  hitchhiker  0.00000139825 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3541  integrase family protein  40.67 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2383  integrase family protein  40.43 
 
 		 427 aa  261  8.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4773  integrase  39.2 
 
 		 449 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.368119  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  39.34 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4662  site-specific recombinase, phage integrase family protein  40.87 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0628  phage integrase  42.17 
 
 		 405 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  38.7 
 
 		 422 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0958  integrase family protein  37.57 
 
 		 403 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>