67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3257 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3257  galactitol-specific phosphotransferase enzyme iia component  100 
 
 		 159 aa  324  4.0000000000000003e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000435521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1645  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  64.38 
 
 		 147 aa  201  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000320453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3613  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  45.07 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.397916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3445  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  45.07 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3447  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  45.07 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.487344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3516  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  45.07 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0319619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  45.07 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2382  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  42.55 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2230  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  42.55 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.846174  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1553  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  42.55 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3073  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  42.55 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000478831 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1563  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  42.55 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00172388  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0970  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  42.55 
 
 		 150 aa  120  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.381164 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  44.19 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1144  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIA  42.55 
 
 		 150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.199908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01986  hypothetical protein  42.65 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02020  galactitol-specific enzyme IIA component of PTS  42.65 
 
 		 150 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3159  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.71 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0121  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  30.83 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0315962  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3554  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  34.31 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3717  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.93 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0214  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.05 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3262  PTS system mannitol-specific eiicba component  29.2 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.71965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0037  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.12 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1640  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.98 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233864  hitchhiker  0.0036959 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0154  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.45 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.882818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3386  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.66 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000117799  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4823  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  26.32 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0234  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  28.18 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3767  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIA component  26.32 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1732  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.18 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1933  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  29.46 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000195157  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4430  putative fructose-like phosphotransferase system subunit EIIA  27.7 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3994  putative phosphotransferase system mannitol/fructose-specific IIA domain  25.41 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.489093 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4065  putative PTS system mannitol/fructose-specific transporter subunit IIA  27.93 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.405107  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4010  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, eiia 2  27.93 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2222  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.19 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03830  phosphotransferase system mannitol/fructose-specifc IIA component (Ntr-type)  32.14 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3753  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.36 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0577  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  36.71 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000200384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4115  putative phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system eiia 2  27.03 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5351  putative fructose-like phosphotransferase system subunit EIIA  26.17 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1682  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.25 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0065  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.79 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.302113  normal  0.357186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03734  hypothetical protein  26.17 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03785  predicted enzyme IIA component of PTS  26.17 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4084  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  26.17 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4117  putative fructose-like phosphotransferase system subunit EIIA  26.17 
 
 		 148 aa  47.8  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4290  putative fructose-like phosphotransferase system subunit EIIA  25.5 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.226084 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0495  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  30.36 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000311069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4120  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.95 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.105011  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4149  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28.57 
 
 		 154 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2631  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  33.02 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.984641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4128  putative fructose-like phosphotransferase system subunit EIIA  25.5 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3023  phosphoenolpyruvate-dependent sugar PTS system, EIIA component  33.02 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1061  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  25.71 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0823  transcriptional antiterminator, BglG  26.98 
 
 		 652 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.325703  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1935  PTS system, IIA component, putative  29.35 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.025117  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0125  phosphotransferase system galacitol-specific IIA domain-containing protein  28.87 
 
 		 184 aa  42  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00946268  hitchhiker  0.00000000000330151 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0236  phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system EIIA 2  27.14 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28600  PTS system, fructose subfamily, IIA component  26.6 
 
 		 155 aa  42  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0345947  normal  0.0698609 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0230  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.14 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1716  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  31.48 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0484088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2753  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  32.91 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0505  putative PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  28 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0750012  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4455  PTS IIA-like nitrogen-regulatory protein PtsN  27.94 
 
 		 154 aa  40.8  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384019  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13280  PTS system D-fructose-specific IIA component (F1P-forming)/PTS system D-fructose-specific IIB component (F1P-forming)/PTS system D-fructose-specific IIC component (F1P-forming)  26.9 
 
 		 646 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.839336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>