More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3105 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  99.53 
 
 
212 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  99.06 
 
 
212 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  99.06 
 
 
212 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  99.06 
 
 
212 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  85.31 
 
 
212 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  85.31 
 
 
212 aa  375  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  85.31 
 
 
212 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  85.31 
 
 
212 aa  375  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  85.31 
 
 
212 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  85.31 
 
 
212 aa  375  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  85.31 
 
 
212 aa  375  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  72.41 
 
 
218 aa  321  5e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  72.41 
 
 
218 aa  320  9.000000000000001e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  74.02 
 
 
210 aa  318  5e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  60.29 
 
 
210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  60.29 
 
 
210 aa  262  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  59.8 
 
 
215 aa  258  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  59.5 
 
 
210 aa  251  5.000000000000001e-66  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  53.92 
 
 
243 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  53.92 
 
 
231 aa  222  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  50.74 
 
 
220 aa  206  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  50.24 
 
 
226 aa  204  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  50 
 
 
224 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  50.25 
 
 
222 aa  203  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  49 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  49.02 
 
 
228 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  52.36 
 
 
212 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  49.27 
 
 
221 aa  198  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  49.02 
 
 
218 aa  195  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  48.53 
 
 
211 aa  191  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  47.29 
 
 
220 aa  190  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  48.78 
 
 
219 aa  190  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0144  putative aldolase  50 
 
 
210 aa  189  4e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.349251  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  47.57 
 
 
220 aa  188  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0129  putative aldolase  50 
 
 
224 aa  188  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  46.19 
 
 
217 aa  186  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  47.15 
 
 
217 aa  185  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  48.77 
 
 
220 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  44 
 
 
216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  48.28 
 
 
226 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  50.25 
 
 
208 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  49.75 
 
 
208 aa  175  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  45.67 
 
 
214 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  45.85 
 
 
214 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3143  putative aldolase  47.8 
 
 
209 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  41.92 
 
 
218 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  44.44 
 
 
213 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  43.23 
 
 
220 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  43.98 
 
 
220 aa  157  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  43.85 
 
 
212 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  43.32 
 
 
212 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  43.81 
 
 
204 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  43.01 
 
 
212 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2015  putative aldolase  45.59 
 
 
213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435503  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0575  putative aldolase  45.59 
 
 
213 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0440  putative aldolase  45.59 
 
 
213 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  43.52 
 
 
212 aa  155  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0892  putative aldolase  45.59 
 
 
213 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2814  putative aldolase  45.08 
 
 
212 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.216378 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1922  putative aldolase  45.59 
 
 
213 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1859  putative aldolase  45.59 
 
 
213 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  43.75 
 
 
213 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5122  putative aldolase  43 
 
 
212 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3210  putative aldolase  43 
 
 
212 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5157  putative aldolase  43 
 
 
212 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117752  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4552  putative aldolase  42.56 
 
 
213 aa  144  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.211976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3731  class II aldolase/adducin family protein  40.3 
 
 
220 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2331  class II aldolase/adducin family protein  39.02 
 
 
216 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  40.09 
 
 
222 aa  141  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4877  putative aldolase  38.91 
 
 
224 aa  135  6.0000000000000005e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0444  putative aldolase  38.01 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  36.22 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  32.16 
 
 
265 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  33.82 
 
 
214 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  36.46 
 
 
180 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  35.16 
 
 
227 aa  108  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  33.49 
 
 
225 aa  108  6e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  30.95 
 
 
234 aa  103  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  36.52 
 
 
181 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  36.41 
 
 
237 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  34.24 
 
 
220 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  34.81 
 
 
181 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  29.95 
 
 
303 aa  102  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  27.83 
 
 
264 aa  101  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  34.81 
 
 
190 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  32.49 
 
 
222 aa  100  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.22 
 
 
215 aa  98.6  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1110  L-fuculose phosphate aldolase, putative  35.16 
 
 
219 aa  97.4  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  32.98 
 
 
215 aa  97.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  36.36 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2031  class II aldolase/adducin family protein  32.62 
 
 
211 aa  96.3  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  34.81 
 
 
189 aa  95.5  5e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  30.69 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  30.62 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  31.32 
 
 
180 aa  94.4  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  28.64 
 
 
216 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  29.27 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0359  class II aldolase/adducin-like  37.36 
 
 
221 aa  91.3  9e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1188  class II aldolase/adducin family protein  31.66 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0647898  normal  0.0283985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>