More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2955 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2921  effector protein pipB2  89.89 
 
 		 366 aa  680    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347087  normal  0.0393811 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2974  effector protein pipB2  96.17 
 
 		 366 aa  716    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.16662 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2955  effector protein pipB2  100 
 
 		 366 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000403936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  90 
 
 		 350 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3077  effector protein pipB2  99.73 
 
 		 366 aa  747    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1164  hypothetical protein  33.94 
 
 		 291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.919275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1198  secreted effector protein  32.85 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1185  secreted effector protein  32.85 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1152  secreted effector protein  32.85 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324884  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1047  secreted effector protein  32.97 
 
 		 291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  40.18 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  37.75 
 
 		 309 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  39.88 
 
 		 567 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  44.44 
 
 		 386 aa  106  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  38.5 
 
 		 576 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  39.34 
 
 		 449 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  37.97 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  42.01 
 
 		 489 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  36.76 
 
 		 776 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  34.95 
 
 		 234 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  35.23 
 
 		 381 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  34.67 
 
 		 286 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  36.06 
 
 		 225 aa  98.6  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  41.96 
 
 		 245 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  40.46 
 
 		 1033 aa  96.7  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.59 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  34.63 
 
 		 745 aa  95.1  1e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  39.58 
 
 		 333 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  38.92 
 
 		 320 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  38.46 
 
 		 517 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  35.91 
 
 		 452 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  36.9 
 
 		 277 aa  94.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  34.03 
 
 		 493 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  35.85 
 
 		 336 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  35.85 
 
 		 336 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  35.91 
 
 		 340 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 485 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  31.7 
 
 		 456 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  35.78 
 
 		 266 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 267 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  31.8 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  31.8 
 
 		 343 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  38.04 
 
 		 278 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  35.86 
 
 		 441 aa  90.5  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  34.21 
 
 		 862 aa  90.5  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  35.64 
 
 		 525 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  36.1 
 
 		 291 aa  89.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 264 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  36.92 
 
 		 433 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  39.05 
 
 		 219 aa  87.8  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  35.23 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  32.34 
 
 		 259 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  38.42 
 
 		 216 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 268 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3130  pentapeptide repeat protein  33.49 
 
 		 356 aa  87  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  34.65 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  37.79 
 
 		 213 aa  86.7  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.88 
 
 		 521 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  36.57 
 
 		 416 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  36.98 
 
 		 241 aa  86.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  33.67 
 
 		 389 aa  86.7  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  35.5 
 
 		 351 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1286  hypothetical protein  32.77 
 
 		 412 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2990  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  38.71 
 
 		 225 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3552  pentapeptide repeat-containing protein  31.75 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  34.68 
 
 		 515 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  36.59 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  36.63 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  34.86 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  35.11 
 
 		 727 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  35.03 
 
 		 419 aa  84  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  39.88 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  39.51 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  37.29 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  33.95 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  34.78 
 
 		 734 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  34.45 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  36.2 
 
 		 706 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  32.24 
 
 		 870 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  39.16 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  28.14 
 
 		 872 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  34.67 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3764  pentapeptide repeat protein  35.59 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  36.47 
 
 		 204 aa  81.6  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  33.92 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  38.59 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0289  pentapeptide repeat protein  36.67 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0289  pentapeptide repeat protein  36.67 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  35.33 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  38.18 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  35.75 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4100  pentapeptide repeat protein  40.8 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.614412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  33.97 
 
 		 1191 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0684  pentapeptide repeat-containing protein  34.6 
 
 		 215 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>