64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2339 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1600  colanic acid biosynthesis glycosyl transferase WcaC  80.74 
 
 
405 aa  701    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2671  putative glycosyl transferase  82.47 
 
 
405 aa  712    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01952  hypothetical protein  80.49 
 
 
405 aa  698    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2350  putative glycosyl transferase  80.25 
 
 
405 aa  694    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2992  putative glycosyl transferase  80.74 
 
 
405 aa  698    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229268 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1584  putative glycosyl transferase  80.25 
 
 
405 aa  695    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1005  putative glycosyl transferase  80.49 
 
 
405 aa  696    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1175  putative glycosyl transferase  80.49 
 
 
405 aa  699    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2453  putative glycosyl transferase  98.52 
 
 
405 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.449849  normal  0.0475636 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01963  predicted glycosyl transferase  80.49 
 
 
405 aa  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2295  putative glycosyl transferase  98.52 
 
 
405 aa  835    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0600773  normal  0.121319 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2339  putative glycosyl transferase  100 
 
 
405 aa  846    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.225754  normal  0.701653 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2346  putative glycosyl transferase  99.75 
 
 
405 aa  844    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.31761  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2238  putative glycosyl transferase  99.51 
 
 
405 aa  841    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2758  glycosyl transferase group 1  28.25 
 
 
406 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.623072  hitchhiker  0.000930156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5441  putative glycosyltransferase  23.98 
 
 
400 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4583  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4786  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 
414 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0735512 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4273  glycosyl transferase group 1  27.14 
 
 
441 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  24.01 
 
 
418 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1862  glucosyltransferase  24.64 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0045  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0043  glycosyl transferase group 1  24.28 
 
 
437 aa  73.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.46781  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  23.91 
 
 
2401 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2171  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1041  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
420 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000238759  normal  0.0144782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1241  glycosyl transferase group 1  25.96 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4579  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.441551  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0507  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
424 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015181 
 
 
-
 
NC_002950  PG1346  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.35 
 
 
423 aa  63.5  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1836  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.08 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00266206  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3036  glycosyl transferase, group 1  24.32 
 
 
445 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.258746  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1539  glycosyl transferase, group 1  24.17 
 
 
431 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4047  glycosyl transferase group 1  24.17 
 
 
422 aa  60.1  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  25.29 
 
 
404 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1379  glycosyl transferase, group 1  21.14 
 
 
417 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865158  normal  0.0304049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3782  glycosyl transferase, group 1  22.34 
 
 
414 aa  57  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  28.38 
 
 
392 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  26.67 
 
 
746 aa  53.5  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1546  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 
428 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1357  glycosyl transferase, group 1  23.01 
 
 
362 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0646  glycosyl transferase group 1  22.59 
 
 
430 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4229  glycosyl transferase, group 1  22.76 
 
 
445 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3927  glycosyl transferase group 1  25.97 
 
 
366 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.273461 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0588  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.48 
 
 
377 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108704  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0986  glycosyltransferase  31.25 
 
 
383 aa  47  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.075214 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  24.35 
 
 
350 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  25 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5888  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 
389 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.355509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
363 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3880  glycosyl transferase group 1  22.86 
 
 
366 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  26.14 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0991  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00704021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1620  glycosyl transferase group 1  30.4 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  27.09 
 
 
371 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.39 
 
 
394 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 
381 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1174  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4662  glycosyl transferase group 1  35.16 
 
 
350 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0886148  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1832  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 
337 aa  43.5  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  35.85 
 
 
381 aa  43.5  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  41.3 
 
 
387 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.26 
 
 
394 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  24.26 
 
 
394 aa  43.1  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>