More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2311 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2313  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  99.68 
 
 
314 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0276977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2210  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  96.82 
 
 
314 aa  639    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00149934  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2424  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  100 
 
 
314 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.126367  hitchhiker  0.000645643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2311  putative O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase  100 
 
 
314 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0283502  normal  0.0363291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  55.41 
 
 
303 aa  335  7e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2354  glycosyl transferase, group 2 family protein  50.66 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.218636  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0085  glycosyl transferase family 2  48.03 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0285695  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0082  O antigen biosynthesis rhamnosyltransferase, putative  48.03 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2138  glycosyl transferase family protein  50.33 
 
 
308 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.177505  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2861  glycosyl transferase family 2  50.65 
 
 
305 aa  291  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4286  glycosyl transferase family protein  45.25 
 
 
303 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.131233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3560  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
306 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480294  normal  0.632112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0841  glycosyl transferase family protein  43.61 
 
 
306 aa  256  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.913833  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1578  glycosyl transferase family 2  41.5 
 
 
305 aa  253  3e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4927  glycosyl transferase family 2  44.19 
 
 
309 aa  251  9.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.640418  normal  0.791087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3008  glycosyl transferase  44.26 
 
 
303 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4142  glycosyl transferase family 2  40.13 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3103  glycosyl transferase family protein  35.74 
 
 
322 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.532387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0596  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.08 
 
 
304 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.300556  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5865  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
292 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  31.76 
 
 
1162 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
1061 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.43 
 
 
1161 aa  99.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3109  glycosyl transferase family protein  28.88 
 
 
327 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0047  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
327 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0045  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
327 aa  85.5  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.288326  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3641  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 
423 aa  75.9  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144986  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4770  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3933  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
423 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2444  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
320 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.181475  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0472  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 
365 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
311 aa  70.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2839  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0441317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  27.94 
 
 
461 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
1486 aa  65.9  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  22.44 
 
 
411 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  24.79 
 
 
1644 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  24.79 
 
 
1644 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
1267 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0228  polysaccharide deacetylase  26.24 
 
 
1124 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.523895 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.12 
 
 
403 aa  62.4  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
509 aa  62  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27.36 
 
 
328 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0775  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
617 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1503  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.34 
 
 
300 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.814973  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  25.81 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0043  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.11 
 
 
282 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.32 
 
 
752 aa  58.9  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1309  glycosyl transferase family 2  37.36 
 
 
272 aa  58.9  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 
333 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 
785 aa  58.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001813  putative two-domain glycosyltransferase  35.64 
 
 
267 aa  58.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.735917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
477 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  24.89 
 
 
1334 aa  58.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  21.36 
 
 
428 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  24.79 
 
 
1267 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
1152 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  23.17 
 
 
337 aa  57.4  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
1152 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 
304 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1360  glycosyl transferase, group 1  26.19 
 
 
1991 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.976549  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  23.98 
 
 
378 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  23.92 
 
 
327 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
470 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  25.39 
 
 
337 aa  55.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
331 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
313 aa  55.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2700  glycosyl transferase family 2  24.75 
 
 
584 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00534164 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  23.81 
 
 
1099 aa  55.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  23.14 
 
 
362 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  24.06 
 
 
445 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.68 
 
 
528 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3090  glycosyl transferase family protein  22.26 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.933883  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  22.8 
 
 
544 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1244  glycosyl transferase family 2  22.13 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.161463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1214  glycosyl transferase family 2  22.13 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2154  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 
466 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.38 
 
 
1002 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 
294 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5661  hypothetical protein  26.21 
 
 
355 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1962  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.26 
 
 
312 aa  53.5  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  25.23 
 
 
325 aa  53.1  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
1067 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
420 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  25.53 
 
 
470 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  25.87 
 
 
1120 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0353  glycosyl transferase family 2  22.5 
 
 
312 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000439981  normal  0.42611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1526  beta-(1-3)-glucosyl transferase, putative  27.27 
 
 
863 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.166405 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  23.48 
 
 
340 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
324 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4198  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
863 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.80228  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  21.86 
 
 
345 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0847  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
429 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0295  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 
334 aa  52  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.211949  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1306  glycosyl transferase family 2  21.9 
 
 
299 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  24.11 
 
 
470 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>