198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1572 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  324  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  66.24 
 
 		 164 aa  223  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  58.82 
 
 		 153 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  58.09 
 
 		 153 aa  185  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  44.67 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  44.53 
 
 		 153 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  45.04 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  38.85 
 
 		 175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  38.22 
 
 		 175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  37.58 
 
 		 175 aa  117  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  43.95 
 
 		 221 aa  117  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  42 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  39.22 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  41.94 
 
 		 221 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  37.89 
 
 		 232 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  42.11 
 
 		 238 aa  114  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  37.11 
 
 		 244 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  43.38 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  39.35 
 
 		 227 aa  110  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  46.21 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  35.14 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  39.57 
 
 		 206 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  39.74 
 
 		 166 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  42.86 
 
 		 196 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  41.98 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  38.52 
 
 		 216 aa  105  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  39.22 
 
 		 185 aa  103  9e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  40.88 
 
 		 182 aa  102  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  38.96 
 
 		 228 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  39.1 
 
 		 225 aa  99.8  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  37.23 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  41.86 
 
 		 185 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  40 
 
 		 193 aa  94  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  33.59 
 
 		 184 aa  94  8e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  39.42 
 
 		 175 aa  94  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  33.12 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  34.11 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  36.13 
 
 		 199 aa  92.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  35.94 
 
 		 192 aa  90.9  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  39.1 
 
 		 208 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.54 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  36.84 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  36.84 
 
 		 179 aa  88.6  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  34.29 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.97 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  32.21 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  36.69 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  34.66 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  38.81 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  34.56 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  33.14 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  34.57 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  31.98 
 
 		 187 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  31.87 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  35.42 
 
 		 185 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  33.8 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  38.46 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  40.58 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  34.9 
 
 		 214 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  34.97 
 
 		 171 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  32.62 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  35.51 
 
 		 155 aa  71.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  27.78 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  32.87 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  33.85 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.37 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.82 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  34.81 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  37.3 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.43 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  33.09 
 
 		 226 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  33.33 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  33.58 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  35.34 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  35.34 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  36.79 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  29.3 
 
 		 175 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  26.25 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  36.57 
 
 		 284 aa  63.9  0.0000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30.07 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  34.85 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  30.07 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  32.3 
 
 		 534 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.79 
 
 		 187 aa  62  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.57 
 
 		 192 aa  62  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.33 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  34.44 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  30.36 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  29.68 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  33.07 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  30 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  29.25 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  30 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  31.68 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  36.15 
 
 		 175 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  31.25 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  34.04 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  34.38 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.01 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>