42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C1251 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A1236  curli assembly protein CsgF  100 
 
 
138 aa  281  2e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.788328  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1251  curli assembly protein CsgF  100 
 
 
138 aa  281  2e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.583171 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1206  curli assembly protein CsgF  100 
 
 
138 aa  281  2e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.388292  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2233  curli assembly protein CsgF  100 
 
 
138 aa  281  2e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.697441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2050  curli assembly protein CsgF  100 
 
 
138 aa  281  2e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1157  curli assembly protein CsgF  89.86 
 
 
138 aa  231  2e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2561  curli assembly protein CsgF  89.86 
 
 
138 aa  231  2e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.368345 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2095  curli assembly protein CsgF  89.86 
 
 
138 aa  231  2e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.771182 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01035  predicted transport protein  89.86 
 
 
138 aa  231  2e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.868652  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1417  curli assembly protein CsgF  89.86 
 
 
138 aa  231  2e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0483844 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2607  curli assembly protein CsgF  89.86 
 
 
138 aa  231  2e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0574427  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01042  hypothetical protein  89.86 
 
 
138 aa  231  2e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2291  curli assembly protein CsgF  89.13 
 
 
138 aa  229  8e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1156  curli assembly protein CsgF  89.13 
 
 
138 aa  229  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.572292  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1554  curli assembly protein CsgF  81.88 
 
 
138 aa  215  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.381005  normal  0.199683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2473  curli production assembly/transport component CsgF precursor  43.18 
 
 
137 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.947001  normal  0.308509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2464  curli production assembly/transport component CsgF precursor  42.42 
 
 
137 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1992  curli fiber protein CsgF, putative  45.13 
 
 
143 aa  101  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0290148  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3473  curli fiber protein CsgF, putative  46.49 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.910163  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2298  hypothetical protein  46.49 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2856  assembly/transport component in curli production, CsgF precursor  40.32 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.618254  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1728  curli production assembly/transport component CsgF precursor  37.4 
 
 
139 aa  84.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6125  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1819  curli production assembly/transport component CsgF precursor  35.82 
 
 
135 aa  82.4  2e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0321037  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2587  hypothetical protein  41.35 
 
 
145 aa  74.7  4e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1519  curli production assembly/transport component CsgF precursor  35.65 
 
 
133 aa  72  2e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817654  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2985  curli production assembly/transport component CsgF, putative  35.92 
 
 
131 aa  67.8  5e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0869  curli production assembly/transport component CsgF, putative  31.4 
 
 
131 aa  64.3  5e-10  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3153  curli production assembly/transport component CsgF, putative  31.4 
 
 
131 aa  64.3  5e-10  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3254  curli production assembly/transport component CsgF, putative  31.4 
 
 
131 aa  64.3  5e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1025  curli production assembly/transport component CsgF, putative  32.56 
 
 
131 aa  63.9  7e-10  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1037  curli production assembly/transport component CsgF, putative  32.56 
 
 
131 aa  63.9  7e-10  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.730845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1004  curli production assembly/transport component CsgF, putative  32.56 
 
 
131 aa  63.9  7e-10  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3335  curli production assembly/transport component CsgF, putative  32.56 
 
 
131 aa  63.9  7e-10  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0642  curli production assembly/transport component CsgF, putative  30 
 
 
130 aa  63.2  1e-09  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00175392  unclonable  1.39477e-08 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3686  curli production assembly/transport component CsgF, putative  30.53 
 
 
131 aa  61.2  4e-09  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2858  curli production assembly/transport component CsgF, putative  33.33 
 
 
129 aa  61.2  5e-09  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6062  Curli production assembly/transport component CsgF  34.91 
 
 
140 aa  57.8  5e-08  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0970  curli production assembly/transport component CsgF, putative  32.56 
 
 
135 aa  57  9e-08  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2350  hypothetical protein  25.56 
 
 
134 aa  48.1  4e-05  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4729  Curli production assembly/transport component CsgF  28.12 
 
 
134 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01505  putative curli production assembly/transport component  27.41 
 
 
151 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1275  hypothetical protein  28.44 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>