145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0714 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0655  hypothetical protein  99.17 
 
 
362 aa  732    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0714  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  736    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0760  hypothetical protein  98.9 
 
 
362 aa  728    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0641  hypothetical protein  98.62 
 
 
362 aa  725    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0620  hypothetical protein  82.83 
 
 
362 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.505795  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00567  predicted oxidoreductase  82.55 
 
 
362 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3025  iron-containing alcohol dehydrogenase  81.99 
 
 
362 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00556  hypothetical protein  82.55 
 
 
362 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730411  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0651  hypothetical protein  81.99 
 
 
362 aa  578  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0620  hypothetical protein  82.27 
 
 
362 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0685  hypothetical protein  82.55 
 
 
362 aa  578  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3044  hypothetical protein  81.99 
 
 
362 aa  578  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0502  hypothetical protein  81.72 
 
 
362 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1134  hypothetical protein  80.61 
 
 
362 aa  551  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2422  hypothetical protein  66.85 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3080  hypothetical protein  66.85 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2519  hypothetical protein  66.85 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113395  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1663  hypothetical protein  67.6 
 
 
362 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0224162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2371  hypothetical protein  65.08 
 
 
362 aa  441  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2414  hypothetical protein  68.44 
 
 
361 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2314  hypothetical protein  67.32 
 
 
361 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0458376  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1934  hypothetical protein  67.04 
 
 
362 aa  421  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.807137  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.18 
 
 
373 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1650  glycerol dehydrogenase  32.48 
 
 
359 aa  187  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0116595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.26 
 
 
373 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  40.61 
 
 
359 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1022  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.47 
 
 
377 aa  174  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.54 
 
 
385 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4190  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.58 
 
 
358 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1296  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.46 
 
 
339 aa  162  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.764657  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  39.06 
 
 
396 aa  162  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  33.61 
 
 
367 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  32.77 
 
 
367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  32.77 
 
 
367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  32.21 
 
 
367 aa  155  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  32.77 
 
 
367 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  32.21 
 
 
367 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.21 
 
 
367 aa  155  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  32.21 
 
 
367 aa  155  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  32.21 
 
 
367 aa  155  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  32.21 
 
 
367 aa  155  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  32.21 
 
 
367 aa  155  9e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  32.21 
 
 
367 aa  155  9e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  32.38 
 
 
364 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  32.38 
 
 
364 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  32.49 
 
 
367 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  31.93 
 
 
367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1794  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.94 
 
 
367 aa  153  4e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  32.49 
 
 
367 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11781  putative glycerol dehydrogenase  31.76 
 
 
364 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.04 
 
 
378 aa  150  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3601  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.93 
 
 
384 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1396  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
367 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.498895  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.58 
 
 
366 aa  146  7.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.33 
 
 
374 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09901  putative glycerol dehydrogenase  33.82 
 
 
417 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
368 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.36 
 
 
363 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1388  putative glycerol dehydrogenase  34.75 
 
 
366 aa  139  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.106406  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  33.99 
 
 
369 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11941  putative glycerol dehydrogenase  31.06 
 
 
363 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  33.66 
 
 
369 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  33.66 
 
 
369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3838  glycerol dehydrogenase  33.66 
 
 
369 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.200623 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0333  glycerol dehydrogenase  32.57 
 
 
362 aa  136  5e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.43 
 
 
385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.86 
 
 
380 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  26.89 
 
 
398 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1840  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.58 
 
 
373 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00260  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  29.11 
 
 
383 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.952088  normal  0.866411 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  29.44 
 
 
360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  32.15 
 
 
395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.01 
 
 
364 aa  129  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1626  putative glycerol dehydrogenase  35.59 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.234673  normal  0.71595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  28.99 
 
 
360 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2109  glycerol dehydrogenase  31.17 
 
 
366 aa  126  5e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0658599  normal  0.138257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  29.3 
 
 
364 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11931  putative glycerol dehydrogenase  30.74 
 
 
363 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.273319  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.78 
 
 
383 aa  124  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0712  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.97 
 
 
363 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1052  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 
408 aa  123  4e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1098  putative glycerol dehydrogenase  31.7 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2634  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.68 
 
 
360 aa  120  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.56 
 
 
365 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  30.84 
 
 
379 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0094  glycerol dehydrogenase  30 
 
 
376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4666  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.79 
 
 
360 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0734  glycerol dehydrogenase  27.91 
 
 
365 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0061  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.37 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2046  glycerol dehydrogenase, putative  27.16 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.220349  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  31.31 
 
 
365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0772  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.43 
 
 
367 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.277229  normal  0.0195639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  27.3 
 
 
367 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0661  glycerol dehydrogenase family protein  28.78 
 
 
372 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0783296  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2346  glycerol dehydrogenase  27.7 
 
 
367 aa  105  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27210  glycerol dehydrogenase-like oxidoreductase  31.14 
 
 
352 aa  106  8e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14931  putative glycerol dehydrogenase  28.26 
 
 
372 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115918  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1046  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.27 
 
 
368 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251209  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0051  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.87 
 
 
361 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00126649  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6106  glycerol dehydrogenase  29.14 
 
 
374 aa  97.1  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.25848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>