More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0579 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  91.69 
 
 
397 aa  696  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  100 
 
 
397 aa  793  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  100 
 
 
397 aa  793  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  83.12 
 
 
397 aa  640  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  91.69 
 
 
397 aa  696  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  91.44 
 
 
409 aa  694  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  100 
 
 
397 aa  793  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  91.69 
 
 
397 aa  696  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  91.44 
 
 
409 aa  694  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  91.69 
 
 
397 aa  696  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  91.69 
 
 
397 aa  696  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  100 
 
 
397 aa  793  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  91.69 
 
 
409 aa  696  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  91.69 
 
 
397 aa  696  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  100 
 
 
397 aa  793  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  78.97 
 
 
395 aa  603  1e-171  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  2.30672e-08 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  73.66 
 
 
395 aa  584  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  73.66 
 
 
395 aa  584  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  73.89 
 
 
388 aa  572  1e-162  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.2 
 
 
395 aa  565  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  71.79 
 
 
398 aa  554  1e-156  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  74.74 
 
 
397 aa  535  1e-151  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  69.01 
 
 
396 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  68.18 
 
 
385 aa  505  1e-142  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  68.45 
 
 
385 aa  506  1e-142  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  68.45 
 
 
385 aa  506  1e-142  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  68.45 
 
 
385 aa  506  1e-142  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.10651e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  68.45 
 
 
385 aa  506  1e-142  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  68.45 
 
 
385 aa  506  1e-142  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  66.75 
 
 
385 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  68.18 
 
 
385 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  68.18 
 
 
385 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  69.25 
 
 
385 aa  493  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  69.25 
 
 
385 aa  493  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  69.25 
 
 
385 aa  493  1e-138  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  68.98 
 
 
385 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  67.02 
 
 
379 aa  490  1e-137  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  66.38 
 
 
390 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  57.18 
 
 
392 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.71 
 
 
422 aa  413  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  58.04 
 
 
433 aa  412  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  53.71 
 
 
385 aa  407  1e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  53.71 
 
 
385 aa  408  1e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  53.71 
 
 
385 aa  408  1e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.71 
 
 
385 aa  408  1e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  53.71 
 
 
385 aa  408  1e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  53.71 
 
 
385 aa  408  1e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  55.32 
 
 
386 aa  405  1e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  53.45 
 
 
385 aa  405  1e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  53.71 
 
 
385 aa  408  1e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  53.71 
 
 
385 aa  408  1e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  57.36 
 
 
442 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  57.87 
 
 
382 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  58.13 
 
 
383 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.79 
 
 
386 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  57.71 
 
 
386 aa  401  1e-110  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  59.04 
 
 
400 aa  400  1e-110  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  51.13 
 
 
405 aa  392  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  56.06 
 
 
384 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  54.38 
 
 
384 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.66 
 
 
399 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  57.03 
 
 
387 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  56.52 
 
 
381 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  54.45 
 
 
384 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  54.52 
 
 
385 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  54.42 
 
 
405 aa  375  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.45 
 
 
384 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  54.85 
 
 
394 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  60.43 
 
 
395 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  54.34 
 
 
394 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  54.18 
 
 
412 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.56 
 
 
410 aa  364  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  53.13 
 
 
420 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  53.13 
 
 
420 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  53.13 
 
 
420 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  53.13 
 
 
420 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  53.13 
 
 
420 aa  363  2e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  53.13 
 
 
420 aa  363  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  51.77 
 
 
425 aa  363  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  50.27 
 
 
383 aa  362  6e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.65031e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.64 
 
 
411 aa  362  7e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  52.86 
 
 
420 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.28 
 
 
403 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  51.74 
 
 
400 aa  359  4e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.34 
 
 
415 aa  359  6e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  49.73 
 
 
383 aa  358  1e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  52.43 
 
 
420 aa  357  2e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  52.8 
 
 
394 aa  357  2e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.02 
 
 
393 aa  355  6e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  52.93 
 
 
423 aa  355  7e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  52.86 
 
 
431 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  55.43 
 
 
409 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  50.53 
 
 
382 aa  355  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  56.18 
 
 
432 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  50.68 
 
 
379 aa  354  2e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  54.65 
 
 
418 aa  353  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  52.04 
 
 
412 aa  353  4e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  52.55 
 
 
383 aa  352  5e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.02028e-07  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  55.99 
 
 
398 aa  352  6e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  52.04 
 
 
412 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>