165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0323 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  45.65 
 
 		 1329 aa  1091    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  44.92 
 
 		 1302 aa  1059    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  31.93 
 
 		 1275 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  34.58 
 
 		 1211 aa  660    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3182  type VI secretion protein IcmF  39.85 
 
 		 1317 aa  830    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0388038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  99.38 
 
 		 1289 aa  2598    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  45.59 
 
 		 1302 aa  1130    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1689  SciS protein  47.23 
 
 		 1358 aa  865    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.79205  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  31.93 
 
 		 1275 aa  658    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0992  hypothetical protein  44.84 
 
 		 1369 aa  1094    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.894672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1823  hypothetical protein  40.9 
 
 		 1332 aa  849    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  46.05 
 
 		 1302 aa  1120    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6108  type VI secretion protein IcmF  45.77 
 
 		 1348 aa  1108    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.916616 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2085  putative membrane protein, SciS/IcmF-like  48.17 
 
 		 1365 aa  939    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.842355 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3485  ImcF domain-containing protein  47.16 
 
 		 1365 aa  938    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.547503 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  45.53 
 
 		 1268 aa  1047    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  44.54 
 
 		 1302 aa  1067    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3922  type VI secretion protein IcmF  44.74 
 
 		 1366 aa  1043    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  99.38 
 
 		 1289 aa  2601    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  45.75 
 
 		 1302 aa  1132    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0327  ImcF/SciS family protein  47.23 
 
 		 1358 aa  865    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  45.67 
 
 		 1302 aa  1130    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0236  ImcF/SciS family protein  47.04 
 
 		 1358 aa  863    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  100 
 
 		 1289 aa  2615    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  99.46 
 
 		 1289 aa  2605    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  34.74 
 
 		 1209 aa  629  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  34.4 
 
 		 1208 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  34.97 
 
 		 1209 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  34.97 
 
 		 1209 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  34.97 
 
 		 1209 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  36.12 
 
 		 1205 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  34.97 
 
 		 1209 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  34.97 
 
 		 1209 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  34.97 
 
 		 1209 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  34.89 
 
 		 1209 aa  619  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  32.57 
 
 		 1199 aa  596  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  32.98 
 
 		 1209 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  31.86 
 
 		 1150 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  34.25 
 
 		 1220 aa  573  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  33.62 
 
 		 1218 aa  569  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  32.41 
 
 		 1212 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  32.17 
 
 		 1207 aa  535  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  30.41 
 
 		 1171 aa  502  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  31.12 
 
 		 1176 aa  496  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0928  SciS protein  48.71 
 
 		 890 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1215  ImcF-like family protein  48.71 
 
 		 890 aa  481  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  31.73 
 
 		 1102 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  29.33 
 
 		 1182 aa  431  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  26.98 
 
 		 1172 aa  419  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  29.57 
 
 		 1175 aa  390  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  27.91 
 
 		 1164 aa  382  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  25.94 
 
 		 1181 aa  379  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  26.99 
 
 		 1181 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0929  SciS protein  46.02 
 
 		 431 aa  357  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1216  hypothetical protein  46.02 
 
 		 431 aa  357  8.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  29.05 
 
 		 1176 aa  355  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  28.47 
 
 		 1157 aa  348  3e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  27.3 
 
 		 1204 aa  331  6e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1173 aa  331  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  27.47 
 
 		 1173 aa  330  9e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3421  hypothetical protein  25.47 
 
 		 1164 aa  320  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3550  type VI secretion protein IcmF  25.39 
 
 		 1164 aa  318  3e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.267985  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  28.55 
 
 		 1152 aa  309  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  24.62 
 
 		 1187 aa  293  1e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  27.45 
 
 		 1148 aa  288  4e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1168 aa  287  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  27.07 
 
 		 1175 aa  282  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  26.97 
 
 		 1179 aa  282  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  26.65 
 
 		 1192 aa  282  4e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  24.24 
 
 		 1182 aa  275  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1179 aa  275  6e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1175 aa  273  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  24.63 
 
 		 1230 aa  261  5.0000000000000005e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  26.26 
 
 		 1288 aa  240  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  27.12 
 
 		 1270 aa  239  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0016  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1008 aa  238  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  24.3 
 
 		 1165 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  23.46 
 
 		 1177 aa  236  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  23.46 
 
 		 1177 aa  236  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0057  ImcF domain-containing protein  26.66 
 
 		 1205 aa  234  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1297 aa  234  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1297 aa  234  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1297 aa  234  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1297 aa  234  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1297 aa  234  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1297 aa  234  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1297 aa  234  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1195 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 1194 aa  225  6e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1315 aa  215  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  22.68 
 
 		 1165 aa  211  5e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  22.71 
 
 		 1165 aa  211  6e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2627  hypothetical protein  23.93 
 
 		 1206 aa  206  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  29.04 
 
 		 1314 aa  206  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  29.04 
 
 		 1314 aa  206  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  28.99 
 
 		 1314 aa  206  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  32.45 
 
 		 1313 aa  204  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1208 aa  204  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  29.42 
 
 		 1315 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  32.53 
 
 		 1313 aa  204  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>