More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0117 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  86.05 
 
 		 551 aa  983    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  63.04 
 
 		 552 aa  729    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  63.29 
 
 		 553 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  63.59 
 
 		 552 aa  728    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  81.16 
 
 		 551 aa  940    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  67.51 
 
 		 555 aa  762    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  85.87 
 
 		 551 aa  983    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  99.46 
 
 		 552 aa  1130    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  64.86 
 
 		 553 aa  737    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  65.46 
 
 		 553 aa  753    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  86.41 
 
 		 551 aa  986    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  99.28 
 
 		 552 aa  1126    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  86.05 
 
 		 551 aa  983    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  99.64 
 
 		 552 aa  1131    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  86.23 
 
 		 552 aa  984    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  86.41 
 
 		 552 aa  988    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  86.05 
 
 		 551 aa  986    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  86.05 
 
 		 551 aa  986    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  99.46 
 
 		 552 aa  1130    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  63.11 
 
 		 553 aa  717    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  100 
 
 		 552 aa  1134    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  63.29 
 
 		 553 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  39.42 
 
 		 596 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  39.42 
 
 		 596 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  39.08 
 
 		 596 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  38.91 
 
 		 596 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  39.08 
 
 		 596 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  33.63 
 
 		 569 aa  323  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  32.56 
 
 		 568 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  32.98 
 
 		 565 aa  307  3e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  30.78 
 
 		 569 aa  293  4e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 563 aa  200  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 566 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  28.99 
 
 		 566 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  28.99 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  28.82 
 
 		 566 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  27.41 
 
 		 637 aa  194  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  25.72 
 
 		 585 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  29.4 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  26.31 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03322  hypothetical protein  25 
 
 		 589 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  30.2 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  30.2 
 
 		 566 aa  184  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  29.43 
 
 		 566 aa  183  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 		 566 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  29.64 
 
 		 566 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  29.62 
 
 		 566 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  29.62 
 
 		 566 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  29.62 
 
 		 566 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  29.45 
 
 		 566 aa  179  8e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  26.67 
 
 		 559 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  25.19 
 
 		 536 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  25.65 
 
 		 567 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 567 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  25.65 
 
 		 567 aa  161  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.47 
 
 		 579 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.47 
 
 		 586 aa  144  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.47 
 
 		 579 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.7 
 
 		 579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  27.2 
 
 		 579 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  31.68 
 
 		 345 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  27.42 
 
 		 579 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  27.42 
 
 		 579 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.03 
 
 		 579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  28.03 
 
 		 555 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  27.85 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  24.51 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  24.51 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  25.08 
 
 		 578 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  25.35 
 
 		 578 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  23.96 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  23.96 
 
 		 578 aa  109  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 578 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  24.45 
 
 		 578 aa  104  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 578 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  19.93 
 
 		 571 aa  94  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  20.8 
 
 		 554 aa  93.2  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  23.96 
 
 		 569 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001577  ABC-type uncharacterized transport system component  24.41 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.826243  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.82 
 
 		 538 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  27.07 
 
 		 538 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.91 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  26.64 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  27.36 
 
 		 504 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4444  extracellular solute-binding protein  28.19 
 
 		 517 aa  73.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.300506  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.13 
 
 		 532 aa  73.9  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 537 aa  73.2  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1825  extracellular solute-binding protein family 5  26.11 
 
 		 502 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.778707  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  25.37 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  31.54 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0191  extracellular solute-binding protein  22.61 
 
 		 495 aa  71.6  0.00000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  29.89 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1077  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5080  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0526207  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  24.1 
 
 		 521 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  24.1 
 
 		 521 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  26.7 
 
 		 533 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>