267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0093 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0092  dihydrofolate reductase  100 
 
 
159 aa  333  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.197159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0093  dihydrofolate reductase  100 
 
 
159 aa  333  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0091  dihydrofolate reductase  100 
 
 
159 aa  333  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.895795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0098  dihydrofolate reductase  100 
 
 
159 aa  333  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0096  dihydrofolate reductase  100 
 
 
159 aa  333  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3551  Dihydrofolate reductase  96.86 
 
 
196 aa  328  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0050  dihydrofolate reductase  96.86 
 
 
196 aa  328  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.450338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00052  dihydrofolate reductase  96.86 
 
 
159 aa  327  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0042  dihydrofolate reductase  96.86 
 
 
159 aa  327  3e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3607  dihydrofolate reductase  96.86 
 
 
159 aa  327  3e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0054  dihydrofolate reductase  96.86 
 
 
159 aa  327  3e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00051  hypothetical protein  96.86 
 
 
159 aa  327  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0052  dihydrofolate reductase  96.23 
 
 
159 aa  326  7e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.264396  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0052  dihydrofolate reductase  96.23 
 
 
196 aa  324  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0597  dihydrofolate reductase  94.34 
 
 
159 aa  317  6e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.235828  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0778  dihydrofolate reductase  81.13 
 
 
160 aa  280  8.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.143949  normal  0.0713752 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3578  dihydrofolate reductase  81.13 
 
 
160 aa  280  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3449  dihydrofolate reductase  81.13 
 
 
160 aa  280  8.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0599  dihydrofolate reductase  79.87 
 
 
165 aa  276  7e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0720  dihydrofolate reductase  77.36 
 
 
160 aa  268  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.919586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3836  dihydrofolate reductase  77.36 
 
 
160 aa  265  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3641  dihydrofolate reductase  77.99 
 
 
160 aa  265  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0559  dihydrofolate reductase  77.99 
 
 
160 aa  261  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  55.97 
 
 
163 aa  186  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  52.83 
 
 
159 aa  178  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001668  dihydrofolate reductase  52.83 
 
 
159 aa  176  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0561  dihydrofolate reductase  49.38 
 
 
165 aa  172  9.999999999999999e-43  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  50.91 
 
 
170 aa  168  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  52.5 
 
 
165 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  56.25 
 
 
160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3735  dihydrofolate reductase  50 
 
 
171 aa  161  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0124901  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  50.63 
 
 
162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  47.8 
 
 
161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0366  dihydrofolate reductase type 3  48.26 
 
 
173 aa  160  9e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  46.25 
 
 
175 aa  158  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  57.25 
 
 
160 aa  158  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  57.25 
 
 
160 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  52.2 
 
 
160 aa  156  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  50.3 
 
 
167 aa  156  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  56.52 
 
 
160 aa  154  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  52.32 
 
 
160 aa  153  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  53.96 
 
 
160 aa  152  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  57.14 
 
 
160 aa  152  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  52.78 
 
 
160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  54.35 
 
 
160 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  45.28 
 
 
165 aa  149  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  47.56 
 
 
171 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  57.14 
 
 
160 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  56.43 
 
 
160 aa  148  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  50.99 
 
 
160 aa  147  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3741  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 
169 aa  147  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.674026  hitchhiker  0.000322893 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  49.09 
 
 
176 aa  147  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  55.71 
 
 
160 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  55.71 
 
 
160 aa  147  6e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 
172 aa  147  8e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  48.43 
 
 
160 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  46.06 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  38.75 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  45 
 
 
161 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  45 
 
 
161 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  45.4 
 
 
167 aa  144  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 
167 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 
162 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
171 aa  143  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  45.4 
 
 
167 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  45.4 
 
 
167 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 
162 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 
162 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 
162 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 
167 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 
162 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 
167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 
167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  47.83 
 
 
163 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 
162 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 
162 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  38.12 
 
 
162 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 
167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  46.58 
 
 
167 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  42.41 
 
 
161 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 
166 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 
172 aa  141  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  45.96 
 
 
167 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
166 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2267  dihydrofolate reductase  37.5 
 
 
162 aa  140  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00982117  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  45.62 
 
 
161 aa  140  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  44.64 
 
 
172 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 
167 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4737  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 
170 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.153856 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  45.91 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0437  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 
170 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  45.18 
 
 
174 aa  137  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  46.88 
 
 
161 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 
166 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  40 
 
 
164 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  44.85 
 
 
168 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 
179 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  45.28 
 
 
163 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>