18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C0040 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0040  hypothetical protein  74.4 
 
 		 415 aa  656    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  hitchhiker  0.00714315 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0042  putative cytoplasmic protein  74.4 
 
 		 415 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.814834  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0041  putative cytoplasmic protein  74.4 
 
 		 415 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.241451 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0040  hypothetical protein  100 
 
 		 417 aa  876    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.204135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0042  putative cytoplasmic protein  74.15 
 
 		 415 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.315374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0016  hypothetical protein  66.5 
 
 		 414 aa  592  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.969858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1508  putative cytoplasmic protein  38.59 
 
 		 414 aa  277  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.371174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4387  hypothetical protein  25.64 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4435  hypothetical protein  24.88 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4438  hypothetical protein  24.88 
 
 		 374 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.944151  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4321  putative cytoplasmic protein  24.88 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4351  hypothetical protein  24.13 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2860  hypothetical protein  22.74 
 
 		 453 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001248  hypothetical protein  21.38 
 
 		 489 aa  60.1  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.27761  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05117  hypothetical protein  19.87 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0456  conserved hypothetical protein, putative transposase  20.57 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0084  hypothetical protein  20.39 
 
 		 520 aa  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.332452  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5346  hypothetical protein  20.91 
 
 		 590 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.696692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>