199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0099 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0099  phospholipase D (PLD) family protein  100 
 
 
183 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1890  endonuclease  54.65 
 
 
193 aa  195  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0054  endonuclease  54.71 
 
 
169 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0047  endonuclease  53.18 
 
 
183 aa  190  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1501  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  44.33 
 
 
242 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1481  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  44.55 
 
 
207 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.710904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4723  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  47.78 
 
 
207 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.932181  normal  0.476253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1653  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  48.33 
 
 
245 aa  174  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.845862  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1562  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase like enzyme  47.78 
 
 
207 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1476  endonuclease Nuc  53.38 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2492  endonuclease Nuc  53.38 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.920435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2109  endonuclease Nuc  52.7 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1969  endonuclease Nuc  53.38 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.139279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3336  endonuclease Nuc  53.38 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270623  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2335  endonuclease Nuc  53.38 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83833  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2376  endonuclease Nuc  53.38 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1242  phospholipase D (PLD) family protein  53.38 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.255553  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0290  endonuclease  51.19 
 
 
176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1585  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  47.22 
 
 
207 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1105  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  47.22 
 
 
242 aa  171  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.336022  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1930  phospholipase D/transphosphatidylase  47.93 
 
 
180 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6783  putative endonuclease  44.68 
 
 
186 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.023889  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4968  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  42.94 
 
 
219 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134103  normal  0.0409016 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4213  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthases like enzyme  45.12 
 
 
205 aa  136  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00000010604  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0120  phospholipase D family protein  38.46 
 
 
162 aa  125  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0285948  hitchhiker  2.06745e-40 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0039  endonuclease  38.67 
 
 
177 aa  117  9e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0126  phospholipase D (PLD) family protein  36.69 
 
 
175 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.204585  normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5019  TRAG family protein  35.25 
 
 
758 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1243  nuclease-related protein  32.18 
 
 
176 aa  100  2e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.77863  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2720  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  31.55 
 
 
184 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1736  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  33.09 
 
 
213 aa  95.5  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000000866452  hitchhiker  0.000020321 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2079  endonuclease  33.09 
 
 
213 aa  95.5  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2108  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate related protein  37.68 
 
 
176 aa  94  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4982  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  36.42 
 
 
252 aa  92  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00261395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0227  hypothetical protein  36.81 
 
 
203 aa  90.5  1e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.610761 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5002  endonuclease  32.72 
 
 
190 aa  90.1  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.209573 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0059  phospholipase D (PLD) family protein  34.35 
 
 
196 aa  89.4  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000614493  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0971  putative phospholipase D  35.97 
 
 
176 aa  88.6  5e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1079  phospholipase D  35.97 
 
 
176 aa  88.6  5e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6817  putative endonuclease  38.58 
 
 
208 aa  87  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1188  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.84 
 
 
196 aa  87.4  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000788745  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5578  phospholipase D/transphosphatidylase  32.41 
 
 
234 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2621  putative endonuclease protein  27.75 
 
 
197 aa  85.5  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.958419  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5407  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardioli pin synthase and related enzyme  31.48 
 
 
188 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6196  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  35.66 
 
 
203 aa  84.3  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477108  normal  0.875629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2331  putative endonuclease protein  31.47 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.870825  normal  0.178627 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0130  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.06 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1827  putative endonuclease  28.66 
 
 
184 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.682836  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2720  putative endonuclease protein  29.41 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2452  putative endonuclease protein  27.97 
 
 
189 aa  75.9  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_7664  predicted protein  34.81 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.305132  normal  0.408477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2958  phospholipase D/transphosphatidylase  29.73 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1868  phospholipase D/transphosphatidylase  33.57 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.705897  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1414  phospholipase D/Transphosphatidylase  32.43 
 
 
386 aa  71.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3384  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  27.14 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.456432 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3593  phospholipase D/transphosphatidylase  33.1 
 
 
393 aa  69.7  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0515773 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2601  putative phosphoslipase  34.38 
 
 
392 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.809365  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1319  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  25.99 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4280  phospholipase D/transphosphatidylase  34.06 
 
 
376 aa  67.8  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000117632  normal  0.0357828 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0279  phospholipase D/transphosphatidylase  29.5 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0277  phospholipase D/transphosphatidylase  28.15 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0166843  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2237  phospholipase D/Transphosphatidylase  33.54 
 
 
363 aa  65.5  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.289369  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0357  phospholipase D family protein  35.43 
 
 
359 aa  63.5  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.217708  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0432  phospholipase D family protein  30.71 
 
 
311 aa  63.2  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1075  phospholipase D/transphosphatidylase  28.08 
 
 
487 aa  61.6  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3028  phospholipase D/transphosphatidylase  28.08 
 
 
481 aa  61.6  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.14441  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16200  hypothetical protein  27.14 
 
 
230 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7357  hypothetical protein  36.56 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000600434  normal  0.754367 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0785  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  30.17 
 
 
349 aa  60.1  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1393  hypothetical protein  27.14 
 
 
230 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06501  hypothetical protein  26.43 
 
 
234 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  25.15 
 
 
545 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0433  phospholipase D family protein  31.71 
 
 
448 aa  57  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.395138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1010  phospholipase D/Transphosphatidylase  35 
 
 
366 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.680316  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  25.15 
 
 
545 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0525  phospholipase D/transphosphatidylase  27.33 
 
 
203 aa  56.2  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0434  phospholipase D family protein  32.52 
 
 
389 aa  55.8  0.0000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5186  hypothetical protein  36.07 
 
 
558 aa  54.7  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500471  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1962  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.7 
 
 
474 aa  54.7  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.146573  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4857  phospholipase D/transphosphatidylase  26.42 
 
 
528 aa  54.7  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404738  hitchhiker  0.00000312959 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  26.52 
 
 
543 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_002620  TC0440  phospholipase D family protein  28.57 
 
 
439 aa  53.9  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0718  phospholipase D/Transphosphatidylase  30 
 
 
551 aa  53.9  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1027  phospholipase D/transphosphatidylase  29.93 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.422314  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.98 
 
 
585 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0644  phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.32 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524645  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1297  phospholipase D/transphosphatidylase  27.43 
 
 
355 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0711  phospholipase D/transphosphatidylase  22.92 
 
 
294 aa  50.4  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2955  phospholipase D/Transphosphatidylase  30.07 
 
 
476 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0495  phospholipase D/transphosphatidylase  25 
 
 
556 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214347  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3530  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.29 
 
 
374 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0270  phospholipase D  29.55 
 
 
299 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1559  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipin synthase-like protein  26.85 
 
 
263 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000157971  normal  0.15339 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0191  phospholipase D/transphosphatidylase  30.61 
 
 
478 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00230403  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1430  phospholipase D/transphosphatidylase  28.12 
 
 
467 aa  49.3  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0041  phospholipase D/transphosphatidylase  25.76 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2595  phospholipase D/Transphosphatidylase  29.03 
 
 
560 aa  48.9  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02951  hypothetical protein  24.14 
 
 
260 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3602  phospholipase D/transphosphatidylase  32.98 
 
 
257 aa  48.5  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0836596  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4507  phospholipase D/transphosphatidylase  28.07 
 
 
372 aa  48.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>