12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0096 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0096  TraM  100 
 
 		 230 aa  481  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0937912  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0059  traM protein  35.24 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0051  traM protein  38.71 
 
 		 235 aa  155  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0515  hypothetical protein  29.79 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0491  hypothetical protein  29.79 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0369  IcmL  28.05 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1813  IcmL protein  28.05 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0368  IcmL  22.94 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1814  IcmL protein  22.94 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5597  hypothetical protein  23.24 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0458091 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0114  putative type IV secretion system protein IcmL/DotI  21.76 
 
 		 264 aa  50.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3862  hypothetical protein  20.13 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.999935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>