15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0075 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009788  EcE24377A_D0057  hypothetical protein  97.93 
 
 		 590 aa  1172    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0209487  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0075  TrbC  100 
 
 		 763 aa  1588    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0356259 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0076  trbC protein  40.99 
 
 		 762 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0068  TraG/TraD family conjugal transfer protein  40.83 
 
 		 762 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03523  TrbC-like protein  56.94 
 
 		 387 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0488  hypothetical protein  25.96 
 
 		 783 aa  231  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0512  hypothetical protein  25.96 
 
 		 783 aa  229  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0366  IcmO  26.33 
 
 		 792 aa  219  2e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1816  IcmO protein  26.33 
 
 		 792 aa  219  2e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3686  DotL  29.71 
 
 		 786 aa  204  4e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00900266  normal  0.235831 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0057  hypothetical protein  27.72 
 
 		 952 aa  195  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.889998  hitchhiker  0.00629192 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03474  hypothetical protein  48.28 
 
 		 171 aa  168  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.481674  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0122  putative type IV secretion system protein IcmO/DotL  26.29 
 
 		 934 aa  167  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4265  hypothetical protein  24.45 
 
 		 950 aa  145  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0361  sex pilus assembly and mating pair formation  23.12 
 
 		 589 aa  63.2  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.398823  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>