33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_A0038 on replicon NC_011081
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011081  SeHA_A0038  protein ImpC  100 
 
 		 82 aa  167  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.511285  normal  0.0568274 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2782  DinI family protein  37.18 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.398825  hitchhiker  0.000224366 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00827  Prophage protein  35.44 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.439708  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00836  hypothetical protein  35.44 
 
 		 101 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.5903  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0920  dinI family protein  35.9 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0793544  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3504  DinI family protein  32.47 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0840838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1090  hypothetical protein  40.74 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148997 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2819  DNA damage-inducible protein I  36.71 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.856695  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2831  hypothetical protein  40.51 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.656931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1127  hypothetical protein  40.51 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.157001  normal  0.695719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2514  DNA damage-inducible protein I  35.8 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2279  hypothetical protein  39.24 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.42074  normal  0.133437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1058  hypothetical protein  39.24 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.767989  decreased coverage  0.000000199344 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1612  DinI family protein  35.44 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.110829  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1230  DNA damage-inducible protein I  34.57 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.280438  normal  0.360014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2026  DNA damage-inducible protein I  34.57 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2210  DNA damage-inducible protein I  34.57 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.212881  normal  0.27906 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1259  DNA damage-inducible protein I  34.57 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.414091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1575  DinI family protein  34.57 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.512058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1576  DinI family protein  35.44 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0825386  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1274  DNA damage-inducible protein I  33.33 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.860825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1674  DNA damage-inducible protein I  33.33 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0403  DNA damage-inducible protein I  33.33 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0124932 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1566  DNA damage-inducible protein I  33.33 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00521035  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3109  DinI family protein  25 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0209906  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2068  DNA damage-inducible protein I  32.1 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348863  normal  0.143439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2539  DNA damage-inducible protein I  32.1 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0403017  normal  0.278127 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1184  DNA damage-inducible protein I  32.1 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1184  DNA damage-inducible protein I  32.1 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.647938  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1440  DNA damage-inducible protein I  32.1 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.398572  normal  0.0309658 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01065  hypothetical protein  32.1 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2585  DinI family protein  32.1 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.534423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01057  DNA damage-inducible protein I  32.1 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>