61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0062 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0062    100 
 
 		 177 bp  351  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00586485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2364  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000494012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2109  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2413  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.624161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2601  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2618  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2636  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0147268  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2711  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.292603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2947  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2964  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3096  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.147891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3413  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3448  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3675  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3708  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00019301  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4197  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4198    91.21 
 
 		 4969 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4625  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4637    91.21 
 
 		 1407 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4660  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.781469  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0017  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0070    91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000253615  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0146  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0193  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0228  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1866  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.324382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0510  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0707  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0712  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1001  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.720933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1006  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1113  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1117  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1584  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1317 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1640  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1644  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.547013  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1653  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1523  IS66 family element, transposase  91.21 
 
 		 1539 bp  117  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4652  IS66 family element, transposase  90.11 
 
 		 1539 bp  109  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0019  IS66 family transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4292  IS66 family element, transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2841  IS66 family element, transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0678669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2224  IS66 family element, transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.101822  hitchhiker  0.0000000000417229 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1812  IS66 family element, transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.438062  hitchhiker  0.000000148464 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1651  IS66 family element, transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1308  IS66 family element, transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.796856 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1183  IS66 family element, transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0344  IS66 family element, transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000788528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0118  IS66 family element, transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.960295  normal  0.698521 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5043  IS66 family element, transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4877    90.91 
 
 		 1385 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4860  IS66 family transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3384  IS66 family transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3343  IS66 family transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2933    90.91 
 
 		 1540 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1760  IS66 family transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0839939  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1407  IS66 family transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0815  IS66 family transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.87963  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0068  IS66 family transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0038  IS66 family transposase  90.91 
 
 		 1539 bp  69.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>