More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_B0011 on replicon NC_011204
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  100 
 
 		 186 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  94.09 
 
 		 186 aa  353  5e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  94.09 
 
 		 186 aa  353  5e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  94.09 
 
 		 186 aa  353  5e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3112  Resolvase domain protein  68.16 
 
 		 184 aa  244  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  67.04 
 
 		 183 aa  235  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0816  resolvase domain-containing protein  65.56 
 
 		 185 aa  233  9e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5397  Resolvase domain protein  64.64 
 
 		 185 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6810  Resolvase domain protein  64.44 
 
 		 185 aa  231  5e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.67902  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  65.92 
 
 		 183 aa  229  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  64.44 
 
 		 185 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  47.8 
 
 		 313 aa  164  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5122  resolvase domain-containing protein  44.02 
 
 		 290 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5519  Resolvase domain  47.51 
 
 		 197 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.176111  normal  0.515657 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6417  resolvase domain-containing protein  46.77 
 
 		 196 aa  154  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  48.07 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0268  resolvase domain-containing protein  46.41 
 
 		 181 aa  150  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.268273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  43.78 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0747  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 181 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4885  resolvase domain-containing protein  44.13 
 
 		 187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  47.78 
 
 		 180 aa  144  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  46.93 
 
 		 190 aa  142  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4606  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  47.51 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2239  resolvase domain-containing protein  43.55 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  45.41 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2095  Resolvase domain protein  48.15 
 
 		 203 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2027  resolvase domain-containing protein  45.05 
 
 		 185 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  43.32 
 
 		 219 aa  137  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  41.67 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  45.45 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  46.37 
 
 		 185 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  43.18 
 
 		 194 aa  134  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2550  Resolvase domain  44.21 
 
 		 196 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.819685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6388  resolvase domain-containing protein  45.3 
 
 		 191 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  43.01 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  44.69 
 
 		 180 aa  131  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  42.22 
 
 		 191 aa  131  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0086  resolvase family site-specific recombinase  42.93 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.464664  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1992  resolvase domain-containing protein  42.02 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.7 
 
 		 182 aa  130  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0189  resolvase domain-containing protein  42.02 
 
 		 206 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3477  resolvase domain-containing protein  42.93 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4560  resolvase domain-containing protein  41.49 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  46.15 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  46.15 
 
 		 205 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_010504  Mrad2831_6517  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 		 185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  41.11 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  43.33 
 
 		 181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  44.2 
 
 		 189 aa  128  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  42.46 
 
 		 203 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  40.88 
 
 		 187 aa  127  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  38.83 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  42.61 
 
 		 189 aa  127  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3992  resolvase domain-containing protein  42.25 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378658  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  41.58 
 
 		 224 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  40.33 
 
 		 186 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  41.57 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  42.7 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  43.09 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  39.36 
 
 		 193 aa  123  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  39.89 
 
 		 192 aa  122  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  44 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  47.25 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  41.81 
 
 		 193 aa  121  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  41.08 
 
 		 188 aa  120  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.11 
 
 		 188 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  42.7 
 
 		 192 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  37.63 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  43.58 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  39.44 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  37.84 
 
 		 199 aa  119  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  38.3 
 
 		 188 aa  118  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  40 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  40 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  40 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  42.31 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2984  putative site-specific recombinases, DNA invertase Pin  40.54 
 
 		 203 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.200056  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  38.98 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  39.89 
 
 		 191 aa  117  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 191 aa  117  9e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0938  site-specific recombinase  45.71 
 
 		 154 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 307 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 		 307 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  38.42 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2096  resolvase domain-containing protein  39.58 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0211835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  37.7 
 
 		 309 aa  115  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  40.78 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2396  resolvase domain-containing protein  46.04 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.718289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  39.46 
 
 		 196 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  38.98 
 
 		 193 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  39.89 
 
 		 189 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  39.55 
 
 		 193 aa  114  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  39.01 
 
 		 183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>