More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4794 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_04043  hypothetical protein  95.07 
 
 		 470 aa  903    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000255427  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4776  D-alanine/D-serine/glycine permease  95.07 
 
 		 470 aa  903    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4759  D-alanine/D-serine/glycine permease  100 
 
 		 467 aa  936    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.329595  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04080  D-alanine/D-serine/glycine transporter  95.07 
 
 		 470 aa  903    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000357991  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1591  D-alanine/D-serine/glycine permease  78.54 
 
 		 470 aa  737    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.892948  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3785  amino acid permease-associated region  95.07 
 
 		 470 aa  903    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000255253  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4458  D-alanine/D-serine/glycine permease  95.29 
 
 		 467 aa  906    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000362617  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1516  amino acid permease-associated region  76.08 
 
 		 469 aa  687    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.413789  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4840  D-alanine/D-serine/glycine permease  74.51 
 
 		 468 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.317801  normal  0.122354 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4794  D-alanine/D-serine/glycine permease  100 
 
 		 467 aa  936    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3739  D-alanine/D-serine/glycine permease  71.65 
 
 		 482 aa  661    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0151839  normal  0.192087 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4676  D-alanine/D-serine/glycine permease  98.71 
 
 		 469 aa  923    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00205284  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2259  D-alanine/D-serine/glycine permease  82.33 
 
 		 471 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.046598  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4632  D-alanine/D-serine/glycine permease  75.6 
 
 		 468 aa  702    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.75325  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3798  D-alanine/D-serine/glycine permease  95.07 
 
 		 470 aa  903    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000560112  normal  0.948087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3098  D-alanine/D-serine/glycine permease  71.93 
 
 		 474 aa  669    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4685  D-alanine/D-serine/glycine permease  95.5 
 
 		 467 aa  885    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000407821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4816  D-alanine/D-serine/glycine permease  98.71 
 
 		 469 aa  923    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.343115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2361  D-alanine/D-serine/glycine permease  82.33 
 
 		 474 aa  755    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.149802  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4666  D-alanine/D-serine/glycine permease  98.71 
 
 		 469 aa  923    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0386097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5725  D-alanine/D-serine/glycine permease  95.07 
 
 		 470 aa  903    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00067927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4749  D-alanine/D-serine/glycine permease  94.65 
 
 		 470 aa  899    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000228678  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4718  D-alanine/D-serine/glycine permease  74.73 
 
 		 468 aa  697    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0466612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1448  amino acid permease-associated region  74.89 
 
 		 473 aa  674    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2045  D-alanine/D-serine/glycine permease  82.33 
 
 		 471 aa  756    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00488299  normal  0.01176 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0378  D-alanine/D-serine/glycine permease  93.35 
 
 		 469 aa  881    Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000253333  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1825  D-alanine/D-serine/glycine permease  86.7 
 
 		 466 aa  805    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.20063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2608  D-alanine/D-serine/glycine permease  70.26 
 
 		 487 aa  655    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2672  D-alanine/D-serine/glycine permease  78.45 
 
 		 470 aa  732    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4896  D-alanine/D-serine/glycine permease  74.67 
 
 		 473 aa  696    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.673653  normal  0.259186 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0405  D-alanine/D-serine/glycine permease  69.16 
 
 		 457 aa  625  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0728357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30130  gamma-aminobutyrate permease-like transporter  67.11 
 
 		 503 aa  615  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362555 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4275  amino acid permease-associated region  63.18 
 
 		 467 aa  606  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3773  amino acid permease-associated region  65.93 
 
 		 502 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0983  amino acid permease-associated region  63.68 
 
 		 473 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.604277  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0539  amino acid permease-associated region  65.21 
 
 		 513 aa  579  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0916  D-serine/D-alanine/glycine transporter  61.69 
 
 		 466 aa  580  1e-164  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.104508  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04173  D-alanine/D-serine/glycine permease  69.09 
 
 		 440 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3611  amino acid permease-associated region  61.94 
 
 		 493 aa  535  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11719  D-serine/alanine/glycine transporter protein cycA  59.48 
 
 		 556 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.636709  normal  0.17883 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0056  amino acid permease family protein  59.26 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0051  amino acid permease family protein  59.78 
 
 		 467 aa  504  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2472  amino acid permease-associated region  55.15 
 
 		 485 aa  502  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1260  amino acid permease family protein  53.66 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2394  amino acid permease-associated region  53.68 
 
 		 472 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1787  amino acid permease-associated region  52.89 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1753  amino acid permease-associated region  52.89 
 
 		 453 aa  479  1e-134  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0124899  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2200  amino acid permease-associated region  53.53 
 
 		 467 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2017  amino acid permease family protein  50.89 
 
 		 458 aa  472  1e-132  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000181843  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2464  amino acid permease-associated region  52.2 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025431  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2513  amino acid permease-associated region  52.2 
 
 		 469 aa  467  9.999999999999999e-131  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0665501  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2142  amino acid permease family protein  48.55 
 
 		 459 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4992  amino acid permease-associated region  46.58 
 
 		 475 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0100  amino acid permease-associated region  45.93 
 
 		 449 aa  400  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000148817  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3389  amino acid permease-associated region  47.07 
 
 		 464 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0821  amino acid permease family protein  44.82 
 
 		 463 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000433182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0762  amino acid permease family protein  44.82 
 
 		 463 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0748  amino acid permease family protein  44.39 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000194828 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0659  amino acid permease family protein  44.39 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000492464  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0603  amino acid permease; proline-specific permease  44.62 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000034111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0604  amino acid permease; proline-specific permease  44.39 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000017445  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0693  amino acid permease family protein  44.39 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.890997  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1301  amino acid permease-associated region  46.1 
 
 		 448 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0725  amino acid permease family protein  43.95 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.050872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0608  amino acid permease-associated region  44.39 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000166726  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0584  amino acid permease-associated region  44.62 
 
 		 463 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000395475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4610  amino acid permease family protein  43.95 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0103  gamma-aminobutyrate permease related permease  45.49 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000103198  hitchhiker  0.00000046337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3525  amino acid permease-associated region  45.62 
 
 		 462 aa  385  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1560  amino acid permease  43.74 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.762264  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3996  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5984  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4371  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 460 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4894  amino acid permease-associated region  43.96 
 
 		 459 aa  376  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2440  amino acid permease  43.57 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1646  amino acid transporter  43.08 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1170  amino acid permease  42.7 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.247985  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0717  amino acid permease  43.57 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0745  amino acid permease  43.57 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1709  amino acid permease  43.57 
 
 		 447 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4250  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 471 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.254584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2459  amino acid permease-associated region  41.09 
 
 		 462 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000167644  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1244  proline-specific permease  43.34 
 
 		 485 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0663  gamma-aminobutyrate permease related permease  43.02 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3129  amino acid permease  41.89 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1480  amino acid permease  42.37 
 
 		 462 aa  362  1e-98  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000231717  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0036  amino acid permease  42.05 
 
 		 468 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3814  amino acid permease  42.05 
 
 		 468 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.756679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3874  amino acid permease  42.05 
 
 		 468 aa  362  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0172  amino acid permease-associated region  42.86 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2796  amino acid permease  41.82 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0563419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0019  amino acid permease  41.82 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.038207  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1747  amino acid permease  41.82 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3181  amino acid permease  41.82 
 
 		 468 aa  360  3e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2091  amino acid permease-associated region  41.19 
 
 		 455 aa  355  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.180943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0439  putative proline-specific permease  41.63 
 
 		 476 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.37513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0445  putative proline-specific permease  41.63 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0458  putative proline-specific permease  41.63 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3225  amino acid permease-associated region  40.13 
 
 		 467 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0439  putative proline-specific permease  41.63 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>