185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4745 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4709  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
322 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798666  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4745  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
322 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.24348  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4626  phosphatidylserine decarboxylase  99.38 
 
 
322 aa  663    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000204539  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4766  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
322 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.348054  normal  0.116072 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4617  phosphatidylserine decarboxylase  100 
 
 
322 aa  666    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0883956  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4692  phosphatidylserine decarboxylase  93.44 
 
 
322 aa  627  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000517081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4631  phosphatidylserine decarboxylase  93.44 
 
 
322 aa  627  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00179779  normal  0.0733814 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04030  phosphatidylserine decarboxylase  93.44 
 
 
322 aa  627  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0258247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5676  phosphatidylserine decarboxylase  93.44 
 
 
322 aa  627  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000843358  normal  0.717209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03992  hypothetical protein  93.44 
 
 
322 aa  627  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0169439  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4717  phosphatidylserine decarboxylase  93.44 
 
 
322 aa  627  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3850  phosphatidylserine decarboxylase  93.44 
 
 
322 aa  627  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.137033  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3830  phosphatidylserine decarboxylase  93.12 
 
 
322 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000265826  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4402  phosphatidylserine decarboxylase  93.12 
 
 
322 aa  625  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00017658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0346  phosphatidylserine decarboxylase  91.3 
 
 
345 aa  617  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0946105  unclonable  0.00000248623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3810  phosphatidylserine decarboxylase  73.01 
 
 
293 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0442773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0710  phosphatidylserine decarboxylase  73.01 
 
 
293 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3663  phosphatidylserine decarboxylase  73.01 
 
 
293 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0225113  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0385  phosphatidylserine decarboxylase  72.57 
 
 
304 aa  442  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.356013  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0474  phosphatidylserine decarboxylase  73.78 
 
 
304 aa  441  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3755  phosphatidylserine decarboxylase  70.81 
 
 
342 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3933  phosphatidylserine decarboxylase  69.84 
 
 
318 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0422  phosphatidylserine decarboxylase  70.41 
 
 
316 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00161477  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002250  phosphatidylserine decarboxylase  58.3 
 
 
285 aa  349  4e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0305015  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2785  phosphatidylserine decarboxylase  58.1 
 
 
287 aa  348  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2741  phosphatidylserine decarboxylase  58.66 
 
 
285 aa  346  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722964  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0587  phosphatidylserine decarboxylase  58.96 
 
 
292 aa  346  4e-94  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.31062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00114  phosphatidylserine decarboxylase  57.6 
 
 
285 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1300  phosphatidylserine decarboxylase  55.36 
 
 
294 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3319  phosphatidylserine decarboxylase  53.87 
 
 
288 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00181452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2955  phosphatidylserine decarboxylase  57.45 
 
 
294 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.223762  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3483  phosphatidylserine decarboxylase  52.78 
 
 
286 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.645642  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3441  phosphatidylserine decarboxylase  52.46 
 
 
292 aa  306  3e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0589  phosphatidylserine decarboxylase  52.46 
 
 
292 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0588  phosphatidylserine decarboxylase  52.46 
 
 
292 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0111413 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3549  phosphatidylserine decarboxylase  52.82 
 
 
287 aa  305  6e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1668  phosphatidylserine decarboxylase  56.36 
 
 
293 aa  305  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.284597  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3289  phosphatidylserine decarboxylase  52.46 
 
 
289 aa  305  7e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00549  phosphatidylserine decarboxylase  50.34 
 
 
325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65500  phosphatidylserine decarboxylase  55.09 
 
 
289 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3719  phosphatidylserine decarboxylase  51.76 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3902  phosphatidylserine decarboxylase  51.76 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.355127  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0549  phosphatidylserine decarboxylase  51.76 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0096877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3776  phosphatidylserine decarboxylase  51.76 
 
 
292 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0788  phosphatidylserine decarboxylase  52.82 
 
 
287 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.234745  hitchhiker  0.000512313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3214  phosphatidylserine decarboxylase  53.87 
 
 
289 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0842821  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2036  phosphatidylserine decarboxylase  56.36 
 
 
283 aa  302  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0621  phosphatidylserine decarboxylase  53.79 
 
 
286 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5686  phosphatidylserine decarboxylase  54.04 
 
 
289 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2876  phosphatidylserine decarboxylase  59.76 
 
 
282 aa  302  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4870  phosphatidylserine decarboxylase  51.93 
 
 
284 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3034  phosphatidylserine decarboxylase  51.06 
 
 
287 aa  298  6e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.749088  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2122  phosphatidylserine decarboxylase  56.54 
 
 
280 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.138271  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4381  phosphatidylserine decarboxylase  50.53 
 
 
297 aa  296  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4700  phosphatidylserine decarboxylase  53.57 
 
 
287 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  0.933822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4180  phosphatidylserine decarboxylase  50.7 
 
 
287 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4961  phosphatidylserine decarboxylase  53.57 
 
 
287 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.989114  normal  0.392503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0557  phosphatidylserine decarboxylase  52.11 
 
 
286 aa  297  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.122246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07440  phosphatidylserine decarboxylase  52.52 
 
 
286 aa  296  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4908  phosphatidylserine decarboxylase  53.21 
 
 
287 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4784  phosphatidylserine decarboxylase  53.21 
 
 
287 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0559  bifunctional thiosulfate sulfurtransferase/phosphatidylserine decarboxylase  52.5 
 
 
610 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2796  phosphatidylserine decarboxylase  51.41 
 
 
283 aa  293  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0509  phosphatidylserine decarboxylase  53.07 
 
 
286 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0592417  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2643  phosphatidylserine decarboxylase  53.51 
 
 
286 aa  292  5e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.270157  hitchhiker  0.000349127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4955  rhodanese domain protein/phosphatidylserine decarboxylase  51.93 
 
 
613 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4660  phosphatidylserine decarboxylase  51.38 
 
 
284 aa  291  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0641109  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3747  phosphatidylserine decarboxylase  52.96 
 
 
296 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4251  phosphatidylserine decarboxylase  53.99 
 
 
285 aa  290  2e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4088  phosphatidylserine decarboxylase  52.54 
 
 
289 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3337  phosphatidylserine decarboxylase  48.96 
 
 
286 aa  287  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430843  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1716  phosphatidylserine decarboxylase  50.72 
 
 
283 aa  283  3.0000000000000004e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0895386  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0607  phosphatidylserine decarboxylase  50 
 
 
299 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0681  phosphatidylserine decarboxylase  53.9 
 
 
289 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0862  phosphatidylserine decarboxylase  51.87 
 
 
288 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2679  phosphatidylserine decarboxylase  48.77 
 
 
286 aa  278  9e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2780  phosphatidylserine decarboxylase  49.29 
 
 
286 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1650  phosphatidylserine decarboxylase  50.87 
 
 
286 aa  276  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.5354  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1409  phosphatidylserine decarboxylase  48.24 
 
 
288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2529  phosphatidylserine decarboxylase  51.26 
 
 
280 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159773  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0598  phosphatidylserine decarboxylase  49.46 
 
 
303 aa  271  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0026541  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1234  phosphatidylserine decarboxylase  51.44 
 
 
289 aa  262  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.70474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2896  phosphatidylserine decarboxylase  47.64 
 
 
306 aa  255  6e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2025  phosphatidylserine decarboxylase  47.62 
 
 
282 aa  251  8.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0055  phosphatidylserine decarboxylase  47.62 
 
 
282 aa  251  2e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1846  phosphatidylserine decarboxylase  48.28 
 
 
284 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.028301 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3046  phosphatidylserine decarboxylase  45.16 
 
 
283 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0913  phosphatidylserine decarboxylase  40.8 
 
 
302 aa  237  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113131  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2903  phosphatidylserine decarboxylase  44.8 
 
 
283 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0634  phosphatidylserine decarboxylase  43.97 
 
 
293 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.697003  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01257  phosphatidylserine decarboxylase  47.25 
 
 
273 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2218  phosphatidylserine decarboxylase  43.01 
 
 
277 aa  233  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.127421  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1925  phosphatidylserine decarboxylase  43.36 
 
 
277 aa  232  7.000000000000001e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0944439  hitchhiker  0.00451587 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2859  phosphatidylserine decarboxylase  44.84 
 
 
280 aa  232  7.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0718  phosphatidylserine decarboxylase  43.42 
 
 
293 aa  229  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2095  phosphatidylserine decarboxylase  42.65 
 
 
303 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4116  phosphatidylserine decarboxylase  44.49 
 
 
284 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0824  phosphatidylserine decarboxylase  40.71 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.088312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2314  phosphatidylserine decarboxylase  37.54 
 
 
282 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0294543 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2446  phosphatidylserine decarboxylase  36.61 
 
 
282 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.779952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>